| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,208,201 | G→A | 6.1% | V60M (GTG→ATG) | ttdT → | L‑tartrate/succinate antiporte |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,208,201 | 0 | G | A | 6.1% | 312.3 / 4.6 | 98 | V60M (GTG→ATG) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (34/57); new base A (2/4); total (37/61) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.80e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
ATCTTGCGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGTTTTTCTAATTCGGTTATCTGGCTGATTTTCG > NC_000913/3208052‑3208345 | atCTTGCGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGAtgg < 2:226469/150‑1 (MQ=255) tCTTGCGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGCAGAACCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTGTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGAtggt > 1:172447/1‑150 (MQ=255) cTTGCGCCGCTGGCGGTCATCGCCATTATTGCTCTACTTCCGGTTCCCGCAGGGCTGGAGATCCATACCTGGCTCTACTTTGCCGTTTTTACTGGCGTGATCGTTGGACTGATCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGAtggtg > 1:812529/1‑150 (MQ=255) 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tCCTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCGAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGtt > 2:314655/1‑150 (MQ=255) tCCTCGAACCAGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTTAATTCACTCCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTACGGtt > 1:180942/1‑150 (MQ=255) cTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCCCTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTGTCCGGtttt > 1:1172398/1‑150 (MQ=255) cTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATCGCCATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGCCAGGCTTTAAATTCACTGCAAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCCGGtttt > 1:420481/1‑150 (MQ=255) cTCGAACCCGTGCCGGGTGCCGTGGTGGCGATGGTGGGTATATCCATCATAGCGATACTCTCTCCCTGGCTGCTGTTCAGCCCGGAGCAGCTCGCTCAGGCAGGGTTTTAATTGGCTGATAAATCCCTCTCGTGGGCCGTTTCGGGtgtt > 1:1001548/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |