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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,470,106 | 0 | C | T | 7.8% | 450.6 / 18.0 | 153 | intergenic (‑253/+39) | chiA/tufA | periplasmic endochitinase/translation elongation factor EF‑Tu 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (73/67); new base T (5/7); total (79/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.57e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 157 total aligned reads displayed.
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acaaATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAACCTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCATCAACGCCCGCGCCAACGGTCCGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGt < 1:104043/150‑1 (MQ=255) aaaTGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGTgg > 2:1301656/1‑150 (MQ=255) gaattgaaaaGGGCGCTTCGGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTCCGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCGTCGCGATCGGGTGGa > 2:154962/7‑150 (MQ=18) tGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGTGGATc > 1:1533323/1‑150 (MQ=255) ttgaaaaGGGCGCTTCGGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGTGGATCa > 1:886170/4‑150 (MQ=18) 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aaaGGGCGCTTCGGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACCGATTGACAAAATCAGCCCGTCAGCGAACGCCATCGGGTGCATCAggct > 2:1116117/1‑148 (MQ=18) aaaGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGTGGATCAGGGt < 2:719400/150‑1 (MQ=255) | ATAAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTAACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGTGGATCAGGGTAACAACCA > NC_000913/3469957‑3470254 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |