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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,470,108 | 0 | A | C | 8.0% | 423.7 / 23.8 | 150 | intergenic (‑255/+37) | chiA/tufA | periplasmic endochitinase/translation elongation factor EF‑Tu 1 |
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Only 100 of 154 total aligned reads displayed.
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caacaaATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTA‑ACGTGAAATTATCCCAGAACTTTAGAAACAACGCCCGCGCCAACGGTAAGGACGCCGACACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGGCCATCGCGATCgg > 2:1140535/1‑150 (MQ=25) aacaaATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTA‑ACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCggg > 2:1123226/1‑150 (MQ=255) acaaATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAACCTAATTA‑ACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCATCAACGCCCGCGCCAACGGTCCGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGt < 1:104043/150‑1 (MQ=255) gaattgaaaaGGGCGCTTCGGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTA‑ACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTCCGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCGTCGCGATCGGGTGGa > 2:154962/7‑150 (MQ=18) tGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTA‑ACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGTGGATc > 1:1533323/1‑150 (MQ=255) 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aaaGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTA‑ACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGTGGATCAGGGt < 2:719400/150‑1 (MQ=255) ccGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTA‑ACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGTGGATCAGGGTAACAACCa < 2:1167256/150‑1 (MQ=255) | AAGAAAAAAGCCTGACAAATGAAGCATTTTAAAAACAGAAACATTCATATTTAAAATGTTAAATTGAATTGATATTTTAAATATGAATAATTTATTCGTTCTGACAGTACGAATAAGATATGCCGTCAACAAATGCAAAAAGGGCGCCGAAGCGCCCTTTTCAATTCAAAACTAATTA‑ACGTGTAATTAGCCCAGAACTTTAGCAACAACGCCCGCGCCAACGGTACGGCCGCCTTCACGGATTGCGAAACGCAGACCGTCGTCCATCGCGATCGGGTGGATCAGGGTAACAACCATT > NC_000913/3469959‑3470256 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |