| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 3,544,696 | A→T | 5.5% | F50Y (TTC→TAC) | bioH ← | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,544,696 | 0 | A | T | 5.5% | 312.1 / 6.3 | 119 | F50Y (TTC→TAC) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/45); new base T (3/4); total (70/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.74e-01 | |||||||||||
Only 100 of 122 total aligned reads displayed.
GAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGATGTTATTCATC > NC_000913/3544547‑3544845 | gAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGa > 2:1309624/1‑150 (MQ=255) aaCACGCGCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGaa < 2:362583/150‑1 (MQ=255) acGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCCCCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGcc > 1:300318/1‑150 (MQ=255) 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ccAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTc > 2:1604904/1‑150 (MQ=255) aaaTCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTg < 2:1580078/150‑1 (MQ=255) cctgcccGGCTTCGGGCGTAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGc > 2:322507/5‑150 (MQ=255) aTCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGcc < 2:657309/150‑1 (MQ=255) aTCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGcc < 1:649875/150‑1 (MQ=255) aTCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGcc < 1:525016/150‑1 (MQ=255) ccccGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGccac < 1:414601/150‑1 (MQ=255) cccGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGccacc > 1:1099260/1‑150 (MQ=255) ccGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGccacca > 2:592126/1‑150 (MQ=255) ggCTACGCGCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCACCATCCGTTCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGa < 2:1082405/150‑1 (MQ=255) tACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGGCTGCCACCAGATGt < 1:724784/150‑1 (MQ=255) aCGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGATGtt < 2:1433285/150‑1 (MQ=255) gCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGATGTTAt < 1:622874/150‑1 (MQ=255) cccGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGATGTTAtt > 1:1509494/1‑150 (MQ=255) cccGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGATGTTAtt < 1:1309624/150‑1 (MQ=255) cGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGAAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACATTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGATGTTATTCa > 2:1381736/1‑150 (MQ=255) aaGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGATGTTATTCATc < 1:103841/150‑1 (MQ=255) | GAACACGCTCGGGATGGGTTAACGCAATCTGGCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGCCATATCAGCAAGTGACAGCGCACCAAATCCCCGGCTACGCCCGAAGCCGGGCAGGTCAACAAGGTGCAGCGTAAAATGCGAGCTAAGTTCCTCGTCAATGCAACGCCACACTTCGGCATTCAGTCCCCATCCGTGCAGCAGCACAAGATGAACATTCCCCTGACCTTTGGTCTGCCACCAGATGTTATTCATC > NC_000913/3544547‑3544845 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |