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Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
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cAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGgag < 1:188601/150‑1 (MQ=255) cAGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGgag > 2:697068/1‑150 (MQ=255) cAGGCGCAGAGCTGTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGgag < 2:1160092/150‑1 (MQ=255) aGGCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGgaga > 1:1597098/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGagag > 1:66391/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGagag < 1:1088722/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGagag > 2:840845/1‑150 (MQ=255) gcgcAGAGCTTTACGCCTGGTATGAAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGTGTCGCGgatgtt < 1:611510/150‑5 (MQ=255) cAGAGCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCa < 2:1693131/150‑1 (MQ=255) gCTTTACGCCTGGTATGTAACCCTAACTTAAGATGTTGATTCGGCGCGAGCGAGGGTAAAAATATCGTAAAAAGACAGTTCACCTTTACGGACGATCATTTTTTGCAGTTGTTCCTTATGAACATCCGCGACACGCGGAGAGTTCAAGAt > 2:743854/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |