| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,971,996 | T→A | 10.8% | L246Q (CTG→CAG) | wecC → | UDP‑N‑acetyl‑D‑mannosaminuronic acid dehydrogenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,971,996 | 0 | T | A | 10.8% | 316.2 / 20.8 | 120 | L246Q (CTG→CAG) | wecC | UDP‑N‑acetyl‑D‑mannosaminuronic acid dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (65/41); new base A (6/7); total (71/49) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.72e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.04e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AAGGTGAGTGTGTCGTCACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTGAACGATCACAAAC > NC_000913/3971849‑3972145 | aaGGTGAGTGTGTCGTCACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCAgg < 2:781952/150‑1 (MQ=255)aaGGTGAGTGTGTCGTCACTAACTCGCGGACGGCGGAAATCTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAAAATCGCGTTTGCTAATGAATTGGCGCTGTTTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCATgg > 2:117656/1‑150 (MQ=255) ggTGAGTGTGTCGTCACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCAGGCg < 2:1288208/150‑1 (MQ=255) gTGAGTGTGTCGTCACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGa < 1:927273/150‑1 (MQ=255) tGAGTGTGTCGTCACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGaa > 1:521737/1‑150 (MQ=255) aGTGTGTCGTCACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATc < 1:1178679/150‑1 (MQ=255) gtgtgtCGTCACTAACTCGCGTACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCTGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCAGGCGAATca < 1:831579/150‑2 (MQ=255) gtgtgtCGTCACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGGTAATGATTTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGTATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCg > 1:1164135/1‑150 (MQ=255) tgtgtCGGCACTAACTGGCGGACGGGGGAAATGGGTAAGCTCACCGAAAACAGTTTCGGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGAGTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCAGGCGAATcag < 2:297890/150‑3 (MQ=255) gtcgtcACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGCGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCAGGCGAATcagttc < 2:30927/150‑6 (MQ=255) tcgtcACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCAcc < 2:65414/150‑1 (MQ=255) cgtcACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACCGATTCGCCTGGCGAATCGTCAccc > 1:816297/1‑150 (MQ=255) cgtcACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGAGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCAGGCGAATcagttcc < 1:733360/149‑7 (MQ=255) gtcACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCt > 1:1468276/1‑150 (MQ=255) aaaCTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGt < 2:536812/149‑1 (MQ=255) aaCTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGtt > 1:614474/1‑150 (MQ=255) gctgacgacGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCAATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAatat < 1:1048887/147‑1 (MQ=255) ggACTGCGGACATGTCTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGACTATCGCTTTTGCTCATGAAGTGTCGCTGAGTTGTGCCGATCAGGGGAGTAAGGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGCTAATAttc < 1:930496/150‑1 (MQ=255) cggcggAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATAttcttc < 1:1459820/150‑1 (MQ=255) gAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCATCAGcct > 1:599071/1‑150 (MQ=255) aaTGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGATTTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGcctgg < 1:530764/150‑1 (MQ=255) aaTGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGcctgg < 1:1224810/150‑1 (MQ=255) gtgtAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGcctggccc > 1:616030/1‑150 (MQ=255) gtgtAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGcctggccc > 1:1142470/1‑150 (MQ=255) gtgtAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGAGTTGTGCCGATCAGGGGATTTACGTCTGCGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGcctggccc > 2:168641/1‑150 (MQ=255) tgtAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGcctggccct > 1:1570604/1‑150 (MQ=255) gtAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGcctggccctg < 1:1271283/150‑1 (MQ=255) gtAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGcctggccctg > 1:334029/1‑150 (MQ=255) gtAAGCTCACAGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGATTTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATAAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGTCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGcctggccctg < 2:1111953/150‑1 (MQ=255) aGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCg > 1:890955/1‑150 (MQ=255) aGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCg < 2:773287/150‑1 (MQ=255) cTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGATCTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTg < 1:697019/150‑1 (MQ=255) cTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTg > 1:928692/1‑150 (MQ=255) cTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTg > 1:967883/1‑150 (MQ=255) tCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTgg < 1:645500/150‑1 (MQ=255) cACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCCGCCTGGCCCTGGCGgggg > 2:315721/1‑150 (MQ=255) aCCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGc > 1:1079556/1‑150 (MQ=255) ccGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCg < 1:1200872/150‑1 (MQ=255) cGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCgg < 2:161446/150‑1 (MQ=255) gAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAAGATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGt > 2:1210292/1‑150 (MQ=255) aaaCAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGGCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCa < 1:33779/150‑1 (MQ=255) aaCAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATTTTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCAc > 2:40511/1‑150 (MQ=255) aaCAGCTTCCGCGATGTGAATATAGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGTATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCAc > 2:1050045/1‑150 (MQ=255) aCAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACt < 2:45214/150‑1 (MQ=255) cAGCTTCCGCGATGTGAATAACGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATAAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCATCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTg < 1:138669/150‑1 (MQ=255) gCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCa > 2:548467/1‑150 (MQ=255) cTTCCGCGATGGGAATATCGCTTTTGCTATTGATTTGTCGCTGCTTCGTGCCGATCAGGGGTTAAACGTCTGGGAACTGATTCGCCGGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCAt < 1:1260114/150‑1 (MQ=255) tgtgAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGa > 2:536300/1‑150 (MQ=255) tgtgAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGGGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCTCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGa > 2:619809/1‑150 (MQ=255) tgAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATc > 1:135161/1‑150 (MQ=255) tgAATATCGCTTATGCTTATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGAGATTAGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGACACAGCATTGCTgatcata > 1:12849/1‑144 (MQ=255) gAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGGTAAAATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATcc > 2:445347/1‑150 (MQ=255) tCGCTATTGCTACTGAATTGGCCCTGATGAGTGCAGAGCAGGGGATTCACGGCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCGCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGt < 1:1086934/150‑1 (MQ=255) gcGCTGTTGCTAATGAATTGGCGCGGATTTGTGCCGAGCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGGCACCCTCGCGGTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGGGGGCGGGCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGt < 1:83992/149‑1 (MQ=255) cGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGtt > 2:851209/1‑150 (MQ=255) gCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGttt > 2:486566/1‑150 (MQ=255) tttGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATc < 1:744327/150‑1 (MQ=255) ttGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCg < 2:795454/150‑1 (MQ=255) gCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTg > 2:768528/1‑150 (MQ=255) cTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTgg < 2:1355782/150‑1 (MQ=255) cTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTgg > 2:1630100/1‑150 (MQ=255) cTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTATGGGAACTGAATCGACTGGCGAATCGTCACCCTAGCGTTAATATTCTTCCGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTCTTGATCCGTGGATTATCGTgg > 2:507797/1‑150 (MQ=255) tAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGc > 1:1125503/1‑150 (MQ=255) taTGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGcc > 1:80231/2‑149 (MQ=255) aaTGACTTGTCGCTGATTTGGGCCGATCAGGGGAGTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGca < 2:734738/150‑1 (MQ=255) aaTGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGca > 1:364576/1‑150 (MQ=255) aTGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGcac < 2:1158591/150‑1 (MQ=255) aTGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGcac < 2:521737/150‑1 (MQ=255) tGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGcaca > 2:182043/1‑150 (MQ=255) gAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGACTCGTCACCCTCGCGTTACTATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAg > 2:1095564/1‑150 (MQ=255) aaTTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGa > 1:1698564/1‑150 (MQ=255) gTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAAccc > 1:51918/1‑150 (MQ=255) cGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTTCTCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAAccccc > 1:1507628/1‑150 (MQ=255) cGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAAccccc < 2:623204/150‑1 (MQ=255) gATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCcagca < 1:1320664/150‑1 (MQ=255) tgCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCAATGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGcgcg > 2:1391349/1‑150 (MQ=255) ccGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGc < 2:364576/150‑1 (MQ=255) ccGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCAGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCACCAGGCGCGGc > 1:735535/1‑150 (MQ=255) ccGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTAGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGc > 1:1169119/1‑150 (MQ=255) cGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCATGTCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCt < 2:912998/150‑1 (MQ=255) gATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCtt > 1:423695/1‑150 (MQ=255) gATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCtt > 2:657465/1‑150 (MQ=255) cAGGGGATTAACGGCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATc < 1:876056/150‑1 (MQ=255) gggATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGCTCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGt > 2:1221609/1‑150 (MQ=255) aaCGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACcgcg > 1:335448/1‑150 (MQ=255) aCGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACcgcgc > 2:814371/1‑150 (MQ=255) ctCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACcgcgcgc > 1:1712225/2‑150 (MQ=255) ggtgacgATTCGCCAGGCGAATCGTCCCCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGCAGCCCCAGCAGGCGCGGCGTATCCGTCCCGCGCGCGCAGt > 2:668616/7‑150 (MQ=255) gtgacgATTCGCCAGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCCCTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTg > 2:119453/6‑150 (MQ=255) gtgacgATTCGCCAGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTg > 1:600110/6‑150 (MQ=255) tgacgATTCGACAGGCGAATCATCACACTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATGCGTGGTTTATCGTGGCACCGCACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACGGCGCGCGAAGTgg > 1:193180/5‑149 (MQ=255) gacgATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTGaa > 1:184200/4‑150 (MQ=255) cTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTGAAc > 2:359079/1‑150 (MQ=255) tCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTGAACGATca < 2:1081081/150‑1 (MQ=255) cGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCCGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTGAACGATcac > 1:855648/1‑150 (MQ=255) cGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTGAACGATcac < 1:548467/150‑1 (MQ=255) cGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGAGCGCGAAGTGAACGATcac > 2:152698/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTGAACGATcaca > 1:1658247/1‑150 (MQ=255) gCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTGAACGATcaca < 2:890955/150‑1 (MQ=255) tGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTGAACGATCACAAAc > 2:122049/1‑150 (MQ=255) | AAGGTGAGTGTGTCGTCACTAACTCGCGGACGGCGGAAATGTGTAAGCTCACCGAAAACAGCTTCCGCGATGTGAATATCGCTTTTGCTAATGAATTGTCGCTGATTTGTGCCGATCAGGGGATTAACGTCTGGGAACTGATTCGCCTGGCGAATCGTCACCCTCGCGTTAATATTCTTCAGCCTGGCCCTGGCGTGGGCGGTCACTGCATTGCTGTTGATCCGTGGTTTATCGTGGCACAGAACCCCCAGCAGGCGCGGCTTATCCGTACCGCGCGCGAAGTGAACGATCACAAAC > NC_000913/3971849‑3972145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |