| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 3,981,102 | T→A | 8.1% | V72V (GTT→GTA) | yifK → | putative APC family amino acid transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,981,102 | 0 | T | A | 8.1% | 305.6 / 11.7 | 109 | V72V (GTT→GTA) | yifK | putative APC family amino acid transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (41/59); new base A (2/7); total (43/66) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.78e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GGGGGCACCATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAG > NC_000913/3980953‑3981249 | gggggCACCATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAaccggtt < 2:760297/150‑1 (MQ=255) ggggCACCATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTACTCGAaccggtta > 2:1661873/1‑150 (MQ=255) ggCACCATTGGCGTCGGCCGGTTTATGGGGCCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTATCATCATGCGGTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAaccggttacc < 2:219340/150‑1 (MQ=255) 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gttaccggttCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGgag < 2:561604/150‑1 (MQ=255) | GGGGGCACCATTGGCGTCGGCCTGTTTATGGGGGCCGCCAGTACCCTGAAATGGGCCGGGCCATCCGTATTGTTGGCCTATATCATCGCCGGGCTGTTCGTCTTTTTCATCATGCGTTCAATGGGCGAAATGTTGTTCCTCGAACCGGTTACCGGTTCGTTCGCCGTTTATGCGCATCGTTATATGAGCCCGTTCTTTGGCTATCTCACCGCCTGGTCTTACTGGTTTATGTGGATGGCGGTGGGGATCTCTGAAATCACCGCCATTGGCGTTTATGTCCAGTTCTGGTTCCCGGAG > NC_000913/3980953‑3981249 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |