| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,002,402 | 0 | G | A | 5.9% | 428.7 / 10.0 | 134 | intergenic (+26/+17) | corA/yigF | magnesium/nickel/cobalt transporter/DUF2628 family putative inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/70); new base A (4/4); total (60/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
GGCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGCCACCTGTTATTCAAAGGCTCCAGGTATTTAACCCTTTTACCTCTTTCTCATAGAACCATTTGTTCGTGTTAACAGCAACATAGGCTGCTACGGCAATTCCCAGAATGTTAACGCCAATTAGTGCACCAACAAATAGAGATAGA > NC_000913/4002254‑4002551 | ggCATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGc > 2:246682/1‑150 (MQ=255) cATGAACTTTGAGTTTATGCCAGAACTGAAGTGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGAGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCGGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTa > 1:297360/1‑150 (MQ=255) aaCTTGGCGTGTCTGCCAGAACTGAAGGGGAGCTTCGGCTACCCTGGCGCGATTATCTTTATGATCCTCGCGGGCCTGGCACCGTATCTGTACTTTAAGCCGAAGAACTGGTTGTAAAAAACGAGAGCGGTGGCTTAGTCTGGCTAAGcc < 2:332231/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |