| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,142,509 | T→G | 5.8% | intergenic (‑288/‑21) | frwA ← / → frwC | putative PTS enzyme: Hpr, enzyme I and II components/putative enzyme IIC component of PTS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,142,509 | 0 | T | G | 5.8% | 471.6 / 10.9 | 148 | intergenic (‑288/‑21) | frwA/frwC | putative PTS enzyme: Hpr, enzyme I and II components/putative enzyme IIC component of PTS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (77/61); new base G (3/6); total (81/67) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.01e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 151 total aligned reads displayed.
CGGCATGCTTCCGGTTTATCGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCGTCATGTTGTATGGCAAAGG > NC_000913/4142360‑4142657 | cGGCATGCTTCCGGTTTATCGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGATTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCttt > 2:1445049/1‑150 (MQ=255) tGCTTCCGGTTTATCGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCaa < 1:683312/150‑1 (MQ=255) cTTCCGGTTTATCGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGc > 1:1328387/1‑150 (MQ=255) ggTTTATCGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTGCGAAAGcccatg < 1:433586/150‑4 (MQ=255) ggTTTATCGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTACGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCATCCATCAAAAATATGGACATGTGCTTTCGCAAGCCCggg > 1:12922/1‑150 (MQ=255) tttATCGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGag > 2:1061144/1‑150 (MQ=255) tATCGCAAGTTATGAGGCGGATAGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATTGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTGCGAAAGcccatgtcca < 2:1649780/150‑8 (MQ=255) tCGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGagcagc > 1:1014971/1‑150 (MQ=255) tCGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGagcagc < 1:1702233/150‑1 (MQ=255) cGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCt > 2:1352280/1‑150 (MQ=255) gCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCtt > 2:1075080/1‑150 (MQ=255) gCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCtt < 2:453451/150‑1 (MQ=255) aaGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTat < 1:439777/150‑1 (MQ=255) aaGTTATGAGCCGGATCGCATTTTAGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAAAGGACTTTTTATCCACTTTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATAGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTACGCAAGACCGGCAGCAGCTTat > 1:959157/1‑150 (MQ=255) aGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTatg < 2:1651521/150‑1 (MQ=255) aGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTatg < 1:632477/150‑1 (MQ=255) gTTAGGATGCGGATAGCATTTTTGTACTGATATTACAACAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTatga < 2:280606/150‑1 (MQ=255) aTGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGGCTTTTTATCGACTGTTTGCTCAGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCTAGCCCGGGGGCAGCTTatgaatg > 1:288885/1‑150 (MQ=255) aTGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTatgaatg < 2:1691734/150‑1 (MQ=255) gAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAg < 1:1468986/150‑1 (MQ=255) gAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCATTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTatgaatgat > 2:1226089/1‑149 (MQ=255) ggATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTTTTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTggg > 2:939744/1‑149 (MQ=255) ggATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGt < 1:1238388/150‑1 (MQ=255) aTCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTACTCCATCAAAAATATGTACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATTAGTTAGTGc > 1:320709/1‑150 (MQ=255) cGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAg < 1:1063032/150‑1 (MQ=255) gCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAATTATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGTGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGa > 1:152083/1‑150 (MQ=255) gCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGa > 2:1543612/1‑150 (MQ=255) gCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGa < 1:385681/150‑1 (MQ=255) aTTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATc < 2:1419879/150‑1 (MQ=255) aTTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATc > 1:788303/1‑150 (MQ=255) tttttGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATcc < 2:173478/150‑1 (MQ=255) tttGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTg > 2:1330623/1‑150 (MQ=255) tGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGaa < 1:1525808/150‑1 (MQ=255) tGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGaa < 1:2766/150‑1 (MQ=255) aCTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGaaaaa > 1:186534/1‑150 (MQ=255) aCTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGaaaaa > 1:51156/1‑150 (MQ=255) aCTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGaaaaa > 1:887470/1‑150 (MQ=255) cTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGATTGAGTTGGTGCTGATCCTGaataat > 2:1581879/1‑150 (MQ=255) cTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAAt > 2:228117/1‑150 (MQ=255) cTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAAt > 2:1693357/1‑150 (MQ=255) cTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAAt > 2:1161097/1‑150 (MQ=255) gATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCATATCCTGAAAAATAc > 1:1092445/1‑150 (MQ=255) gATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATAc > 1:1077489/1‑150 (MQ=255) ggataaaaaGGCCATTTACTGGACTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCg > 1:547464/6‑150 (MQ=255) ttACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGt > 1:991326/1‑150 (MQ=255) ttACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACACGt > 2:841052/1‑150 (MQ=255) cAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAg < 1:678044/150‑1 (MQ=255) cAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAAt > 2:207608/1‑150 (MQ=255) cAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAAt > 2:1095499/1‑150 (MQ=255) cAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCCGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAAt > 1:482810/1‑150 (MQ=255) aGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCAttt > 1:512664/1‑146 (MQ=255) aGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATg > 2:555554/1‑150 (MQ=255) aGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATg > 2:554800/1‑150 (MQ=255) gTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATAcc > 1:1447791/1‑134 (MQ=255) aaaTTGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACg < 1:875693/150‑1 (MQ=255) aTGGCGTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATTGACATGTGCTTTCGAAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACggg < 1:556703/150‑1 (MQ=255) aTGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGTCATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACggg > 1:1407399/1‑150 (MQ=255) ggCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCg > 2:1483742/1‑150 (MQ=255) ccTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGtt > 2:899842/1‑150 (MQ=255) ccTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGtt > 1:742343/1‑150 (MQ=255) ccTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGtt < 2:1561069/150‑1 (MQ=255) cTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGttt > 2:1382867/1‑150 (MQ=255) cTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGttt < 1:471374/150‑1 (MQ=255) tATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTcacac < 2:186534/150‑1 (MQ=255) tCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTcacacaa > 2:1106604/1‑149 (MQ=255) ccACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATg < 1:1352280/150‑1 (MQ=255) ccACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGCGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATg > 2:41652/1‑150 (MQ=255) tGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTc < 2:780517/150‑1 (MQ=255) tGTTTGATCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTCTGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTc < 2:845907/150‑1 (MQ=255) tttGCTCCGCCTGCGATTGGCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTccc < 1:1668646/150‑1 (MQ=255) cTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCtttg < 1:1645422/150‑3 (MQ=255) cGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTgg < 1:1219853/150‑1 (MQ=255) cTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTAt < 2:1391318/150‑1 (MQ=255) cGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGAGATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGTGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCgg < 2:320709/150‑1 (MQ=255) gATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCggg < 2:600014/150‑1 (MQ=255) gATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCggg > 1:1237470/1‑150 (MQ=255) aTTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTAttt < 1:1013386/150‑1 (MQ=255) ttctgtcctccAGCACAAATATGCACATGGGCTTGCTCAAGCCCGGGAGCCGCTTATGCATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGCCGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTAtttt < 2:251373/145‑1 (MQ=255) gTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGc > 1:1185076/1‑150 (MQ=255) tttCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCt < 2:887470/150‑1 (MQ=255) tttCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCt < 2:51156/150‑1 (MQ=255) ttCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTg < 1:1061144/150‑1 (MQ=255) cctccATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTcaca < 2:1618115/111‑1 (MQ=255) cctccATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGc < 1:1309237/150‑1 (MQ=255) ctccATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCAGTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCg > 2:713292/1‑150 (MQ=255) cATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTAGTTTGCTGGCGGtt > 2:1278500/1‑150 (MQ=255) aTCAAAAATATGGACATGGGCTTTAGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGAAGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGttt > 2:1499298/1‑150 (MQ=255) cAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTcc > 1:155847/1‑150 (MQ=255) cAAAAATATGGACATGGGCTTTCCCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTcc < 2:1672226/150‑1 (MQ=255) aaaaaTATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCg < 2:578939/150‑1 (MQ=255) aaaTATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGTGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATCCCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTAGCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCGTc < 2:1040193/150‑1 (MQ=255) atGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCGTCAtgt > 2:31218/1‑150 (MQ=255) tGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAAAACCCTTCAGCATATAATGACGTGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGTGAGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCGTCAggtt > 2:272280/1‑150 (MQ=255) gctcccgggCTTGCGAAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCAGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGATTCCGTCAtgttg > 1:1595735/7‑150 (MQ=255) cccgggCTTGCGAAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCGTCATGTTGTAt > 1:1404239/4‑150 (MQ=255) cATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCGTCATGTTGTAt > 1:621095/1‑150 (MQ=255) gggCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCGTTCGTGGTATCGGGCGGTAATTTGCTGGCGGTTTCCGTCATGTTGTATGGc > 2:1556217/1‑150 (MQ=255) gggCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCGTCATGTTGTATGGc < 2:1285125/150‑1 (MQ=255) cTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCGTCATGTTGTATGGCaaa > 2:404120/1‑150 (MQ=255) ttCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCGTCATGTTGTATGGCAAAgg > 2:1721343/1‑150 (MQ=255) | CGGCATGCTTCCGGTTTATCGCAAGTTATGAGGCGGATCGCATTTTTGTACTGATATTACAAAAGTCCAGTAAATGGCCTTTTTATCCACTGTTTGCTCCGCCTGCGATTGCCTATTGTTTCCTCCATCAAAAATATGGACATGGGCTTTCGCAAGCCCGGGAGCAGCTTATGAATGAGTTGGTGCAGATCCTGAAAAATACCCGTCAGCATTTAATGACGGGCGTTTCACACATGATTCCCTTCGTGGTATCGGGCGGTATTTTGCTGGCGGTTTCCGTCATGTTGTATGGCAAAGG > NC_000913/4142360‑4142657 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |