| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,183,669 | G→T | 94.0% | G809C (GGT→TGT) | rpoB → | RNA polymerase, beta subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,183,669 | 0 | G | T | 94.0% | 294.4 / 5.0 | 98 | G809C (GGT→TGT) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (3/3); new base T (48/43); total (52/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 | |||||||||||
AACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTG > NC_000913/4183522‑4183815 | aaCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGGGGGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGt < 2:1057841/150‑1 (MQ=255) aCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGtt < 1:704587/150‑1 (MQ=255) aCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGGCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGtt < 2:1469184/150‑1 (MQ=255) aCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGGCTCTGGGGGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGtt < 2:956398/150‑1 (MQ=255) ccAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTa > 2:1343586/1‑150 (MQ=255) ccAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTa > 2:38674/1‑150 (MQ=255) ccAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTa > 2:1490048/1‑150 (MQ=255) cAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTAc < 1:47490/150‑1 (MQ=255) acCTGTATCAACCAGAGGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTGCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTc < 2:1057894/150‑1 (MQ=255) cctcaaacAACCAGAAACCGTCTGTCTCTCTGGCTGAACCGGTTGAACCTGGCGACGTCCTCGCAGACGGTCCGTCCACCGACCACGGTGAACTGGCGCATCCACACAACATGCGCGTAGCGTTCAAGCCGTGCAATAGTTACAACATCg > 2:964576/8‑150 (MQ=255) ccTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGCCCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAAGTGTTACAACTTCg > 1:1388079/1‑150 (MQ=255) ccTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCg > 1:1382380/1‑150 (MQ=255) aTCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGAc > 2:1633165/1‑150 (MQ=255) cAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACTGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTc > 2:772380/1‑150 (MQ=255) cAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTc > 2:1624270/1‑150 (MQ=255) aaCCAGATGTCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTcc > 2:1387681/1‑150 (MQ=255) aaCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTcc > 1:555571/1‑150 (MQ=255) tGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCTTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGGCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCg < 2:1042214/150‑1 (MQ=255) cGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGCTATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTAt > 1:848460/1‑150 (MQ=255) gtgtgtgtCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGTCGCTTGGTCAGACCATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTACCCAGACTCCATCCGCGTATc > 2:1152866/1‑150 (MQ=255) gtgtCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAg > 1:601446/1‑150 (MQ=255) gtCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCg < 1:1577575/150‑1 (MQ=255) ctctGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCgtg > 2:644245/1‑150 (MQ=255) tctGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTAGTATCCGAGCgtgt > 2:1273242/1‑150 (MQ=255) tctGGGGTAACCGGTTGAACGTGGCGACGGGCTGGCTGACGGTCCGGCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTGCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCgtgt < 1:310505/150‑1 (MQ=255) gggTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACATCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGtgttgt < 1:745182/150‑1 (MQ=255) ggTGAACCGGTTGCACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGCACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTgttgtt > 2:238081/1‑150 (MQ=255) ggTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTgttgtt < 2:782329/150‑1 (MQ=255) ggTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTgttgtt > 1:925719/1‑150 (MQ=255) gTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTc > 1:1410109/1‑150 (MQ=255) aaCCGGTTGAACGTGGCGACGTGCGGGCAGACGGGACGTCCACCGACCTCGGTGAAATGGCGCGTGGGCAGAACATGCGCGCAGCGTTCATGCGGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAgg < 1:919209/150‑1 (MQ=255) ggTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGa > 1:384803/1‑150 (MQ=255) ggTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGa > 2:760660/1‑150 (MQ=255) ggTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGa > 1:391138/1‑150 (MQ=255) gAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGt > 2:1733175/1‑150 (MQ=255) gAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGt > 2:1709165/1‑150 (MQ=255) aaCGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACAGACCTCGGTGAACTGGCGCTTTGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGtt < 1:324198/150‑1 (MQ=255) cGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTGCAGGAAGACCGTTTc > 1:1380259/1‑150 (MQ=255) cGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGGCAGAACCTGCGCGGAGCGGTCATGCCGGGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGAATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTc > 1:276565/1‑150 (MQ=255) ggggCGCCGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATCCGCGTAGCGTTCATGCCGTGTAATTGTTACAACTTCGACGACTCCATCCTCGGATCCGAGCGTGTGGTTCAGGAAGACCGTTTca < 2:97700/148‑1 (MQ=255) gTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTca < 1:1084470/150‑1 (MQ=255) tGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTcac > 2:1063279/1‑150 (MQ=255) ggCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTcacc < 1:849619/150‑1 (MQ=255) ggCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTcacc < 2:1209614/150‑1 (MQ=255) ggCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGGCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTcacc < 1:843947/150‑1 (MQ=255) cGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTcaccac < 2:1580596/150‑1 (MQ=255) gACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCGCGGGGTACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGAAGCGGTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGGGCTGTTCAGGAAGACCGTTTCaccacc < 1:774013/150‑1 (MQ=255) gTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATc < 2:618797/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATcc < 1:404498/150‑1 (MQ=255) tGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATcc < 2:1154787/150‑1 (MQ=255) cTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCcac > 1:622212/1‑150 (MQ=255) cTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCcac < 2:973369/150‑1 (MQ=255) gCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACAtt > 2:543914/1‑150 (MQ=255) cAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTc > 2:1462792/1‑150 (MQ=255) gACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAg > 1:1176934/1‑150 (MQ=255) cGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGa < 1:1213274/150‑1 (MQ=255) cgtccACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCCCCCCCATCCACAGTCAGGAACTgg > 2:834603/1‑150 (MQ=255) gtccACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGc > 1:29103/1‑150 (MQ=255) gtccACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGc < 1:1624270/150‑1 (MQ=255) cACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCgtg < 2:1382380/150‑1 (MQ=255) aCCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCgtgt > 2:983879/1‑150 (MQ=255) ccGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGCCCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCgtgtg > 2:643042/1‑150 (MQ=255) ccGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCgtgtg < 1:1343586/150‑1 (MQ=255) ccGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCgtgtg < 1:1490048/150‑1 (MQ=255) ccTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGTACTGGCGTGTGTGTc > 2:39419/1‑150 (MQ=255) cTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTcc < 2:1099606/150‑1 (MQ=255) ggTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGt > 1:1020558/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACAcc < 1:772380/150‑1 (MQ=255) ggCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCaa > 1:1652096/1‑150 (MQ=255) gcggTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAg < 2:1693942/150‑1 (MQ=255) cgcTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACTACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTAAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTACCGTGCCACCaatc > 2:1004783/1‑148 (MQ=255) cTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTg < 1:409327/150‑1 (MQ=255) ttGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTgg < 2:1403675/150‑1 (MQ=255) ttGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTG‑TACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTggg < 2:656102/150‑1 (MQ=255) tGGTCATAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGGGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTggg < 2:311185/150‑1 (MQ=255) tGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTggg < 1:644245/150‑1 (MQ=255) gTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCg < 2:398181/122‑1 (MQ=255) gTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCg > 1:398181/1‑122 (MQ=255) tCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTcc < 1:863994/150‑1 (MQ=255) cAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCg > 2:711346/1‑150 (MQ=255) gAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCCCCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGa > 2:829826/1‑150 (MQ=255) aCATGCGCGTAGCGTGCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCGCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAag < 1:73367/150‑1 (MQ=255) cATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCTATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAaga > 1:506457/1‑150 (MQ=255) cATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAaga > 1:778555/1‑150 (MQ=255) cATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAaga > 1:1116580/1‑150 (MQ=255) cATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACAACAAGCTGGGTCCGGAaga > 1:108014/1‑150 (MQ=255) ttcgcgTAGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCCGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGGGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAgaga < 2:225538/148‑1 (MQ=255) cgcgTAGCGTTCAAGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGATCAGCAAGACCGTTTCACAACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTCTGTCCCGTGACACCAACCTGGGTCCGGAAGAGAta > 2:976091/1‑149 (MQ=255) aGCGTTCATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCCCCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGc > 1:963957/1‑150 (MQ=255) gCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCt < 2:678079/150‑1 (MQ=255) cGTTCATGCCCTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCCCCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGCTCCCCGcgg > 1:405747/1‑148 (MQ=255) cATGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACAt < 2:925719/150‑1 (MQ=255) tGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATcc < 1:1562666/150‑1 (MQ=255) tGCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATcc < 2:1176934/150‑1 (MQ=255) gCCGTGGAATTGTTACAACTTCGAATACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGAGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCAGGAAGAGAGCACCGCTGACATacc > 1:81793/1‑150 (MQ=255) gCCGTGGAATTGTAACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGATGACAGTTTCACCACGATCCACATTCAGGAGCTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGTAAGAGATCAACGCTGACATccc > 1:263504/1‑150 (MQ=255) gTGGAATTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGaa > 2:1455422/1‑150 (MQ=255) aaTTGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTg < 2:967735/150‑1 (MQ=255) | AACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCCTCGTATCCGAGCGTGTTGTTCAGGAAGACCGTTTCACCACCATCCACATTCAGGAACTGGCGTGTGTGTCCCGTGACACCAAGCTGGGTCCGGAAGAGATCACCGCTGACATCCCGAACGTG > NC_000913/4183522‑4183815 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |