| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,256,369 | A→G | 5.8% | L33P (CTG→CCG) | plsB ← | glycerol‑3‑phosphate O‑acyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,256,369 | 0 | A | G | 5.8% | 421.4 / 11.3 | 140 | L33P (CTG→CCG) | plsB | glycerol‑3‑phosphate O‑acyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/64); new base G (4/4); total (71/69) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.57e-01 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
CATAGCGCGGCAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCGGCAAGGATAGC > NC_000913/4256220‑4256516 | caTAGCGCGGCAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTACCGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCa > 1:653007/1‑150 (MQ=255)caTAGCGCGGCAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCa > 2:1311116/1‑150 (MQ=255) aGCGCGGCAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGtt > 1:1446608/1‑150 (MQ=255) gcgcGGCAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGATc > 2:421067/1‑150 (MQ=255) cgcgGCAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTcc > 2:1181155/1‑150 (MQ=255) cgcgGCAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTcc < 1:1443181/150‑1 (MQ=255) cgGCAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGCCACTGGGCGGGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCgg > 2:1150026/1‑150 (MQ=255) gCAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCgggg > 1:1662457/1‑150 (MQ=255) cAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCACCGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGc > 1:320410/1‑150 (MQ=255) cAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGc > 1:769697/1‑150 (MQ=255) aGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCa < 1:1275030/150‑1 (MQ=255) aGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCa < 1:158404/150‑1 (MQ=255) aGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCa < 2:569054/150‑1 (MQ=255) gTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCCTGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAg < 1:1190920/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGa < 1:479262/150‑1 (MQ=255) aGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGa > 2:579113/1‑150 (MQ=255) gCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCGGAACTGGGGCTGGAt < 2:816917/150‑1 (MQ=255) gCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGAt > 1:578531/1‑150 (MQ=255) gTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCTGCCCCGGAACTGGGGCTGGAtac < 2:934084/150‑3 (MQ=255) ccGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCTGCCCCGGAACTGGGGCTGGAtacctc < 1:724179/150‑6 (MQ=255) cGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCg > 2:44253/1‑150 (MQ=255) gATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAAt > 2:710/1‑150 (MQ=255) gATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAAt < 1:1268158/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACtt > 2:419592/1‑150 (MQ=255) aGCGGCGCTAACGGGTCAGGCAATTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTg < 2:219741/150‑1 (MQ=255) ggCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCtt < 2:800927/150‑1 (MQ=255) ctAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCtttttt > 1:1100420/1‑149 (MQ=255) ctAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTa > 1:368192/1‑150 (MQ=255) ctAACGGGTCAGGCAAGTCATGAGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTa < 1:1057391/150‑1 (MQ=255) ctAACGGGACAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCCCGCAACGTCAGCAAAACTGCTTTCGAGTTGTACGGGTTCACGTGCATTATTGGATGAGAGGTTTCCTGCCCCAGTTCCGGGGCCGGATCTGCGGGAATAGACTTGcagtgta > 2:328613/1‑144 (MQ=255) ctAACGCGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGTAATAGACTTGCTTTTTa < 1:895392/150‑1 (MQ=255) tAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTAc < 2:1311891/150‑1 (MQ=255) tAACGGGGCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTAc < 1:1139844/150‑1 (MQ=255) aaaCGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCGTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTAc < 1:838573/149‑1 (MQ=255) aCGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCa > 1:61567/1‑150 (MQ=255) cGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAg > 1:1083189/1‑150 (MQ=255) ggCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTAAGCTAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCGCAGTTCCGGGGCAGGTTCTGCCGGAATAGACTGGCTTTTTAGCAGGATGGtt > 1:1132980/1‑150 (MQ=255) gCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTa > 1:983559/1‑150 (MQ=255) gCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTa > 1:870584/1‑150 (MQ=255) cAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTaa > 2:91375/1‑150 (MQ=255) aaGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAAt > 2:833299/1‑150 (MQ=255) aGTCATGGGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATg < 2:1553104/150‑1 (MQ=255) gTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGGGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATgg > 1:784393/1‑150 (MQ=255) gTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATgg > 1:546835/1‑150 (MQ=255) tCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGt < 2:1446608/150‑1 (MQ=255) cATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTa < 1:857556/150‑1 (MQ=255) aTGTTCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACTAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTaa < 1:1563032/150‑1 (MQ=255) gCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTc > 1:327803/1‑150 (MQ=255) cAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGATGTATCCAGCCCCTGTTCCGGGGCCGGATCTGCCGGAATAGAATTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATTGTAAATTCAg > 2:293189/1‑150 (MQ=255) aGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTTGACGAGAGGTATCCATCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGTAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGt < 1:857283/150‑1 (MQ=255) cacTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAAt < 2:962224/150‑1 (MQ=255) acTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAAtt > 2:1474025/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAAttt < 2:600960/150‑1 (MQ=255) tGGGCGCGCAACGGCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGATAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTg < 1:1469396/150‑1 (MQ=255) gggCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTgt < 1:1356885/150‑1 (MQ=255) gcgcgcAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTgtag < 2:870584/150‑1 (MQ=255) cgcAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTaa > 2:1526989/1‑150 (MQ=255) cAACGTCAGCAATTCTGCGTTCGCGTTGTACGGTAAACCGTACATAATTGGACGAGAGGGTTACATCCACTGATACGGGGCAGTATCTGACTCAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAAt < 1:293189/150‑1 (MQ=255) cAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAAt < 1:1382723/150‑1 (MQ=255) cAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTgg < 1:579113/150‑1 (MQ=255) cAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTgg < 1:1001125/150‑1 (MQ=255) cAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTAAGTAATATGTAGTAAATTAGTgg > 1:1686639/1‑150 (MQ=255) cAGCAAATCAGCTTTCGAGTTTTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTgg < 2:868986/150‑1 (MQ=255) gCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGcc < 1:421067/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGCTTTCGAGTTGTTCGGTAAAAAGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGGAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAg < 1:914258/150‑1 (MQ=255) aaaTCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAg < 1:1195177/150‑1 (MQ=255) tCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTGAATTCGTGGCCAGCCg < 1:1691691/150‑1 (MQ=255) tGCTTTCGAGTTGTACTGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGa < 1:446343/150‑1 (MQ=255) gCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGAc < 2:1080583/150‑1 (MQ=255) cTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACa < 2:769697/150‑1 (MQ=255) cTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACa > 1:156965/1‑150 (MQ=255) cTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACa > 2:1439007/1‑150 (MQ=255) cTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACa > 1:1475479/1‑150 (MQ=255) cGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATaaa > 1:1305807/1‑150 (MQ=255) aGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACg > 2:1463335/1‑150 (MQ=255) ggTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAg > 1:250792/1‑150 (MQ=255) gTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGt > 2:525883/1‑150 (MQ=255) gTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGt > 1:1347150/1‑150 (MQ=255) tACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGtt < 2:320410/150‑1 (MQ=255) aTAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTtaat < 2:983559/150‑1 (MQ=255) ttGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATg < 1:1319295/150‑1 (MQ=255) ggACGAGAGGTATCCATCCCCAGTTCCGGGGCAGGAGCTGCCGGAATAGACTTGCTTGTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCa < 2:1323387/150‑1 (MQ=255) ggACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCa > 1:388767/1‑150 (MQ=255) ggACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCa < 2:1128765/150‑1 (MQ=255) aCGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCaaa < 1:54400/150‑1 (MQ=255) aCGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCaaa < 2:1675302/150‑1 (MQ=255) cGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGTACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAAt > 2:19783/1‑150 (MQ=255) gagaGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATg < 1:1181155/150‑1 (MQ=255) agagGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATgc > 1:952302/1‑150 (MQ=255) ggTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGcgcg < 1:1662614/150‑1 (MQ=255) gTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCgg > 2:558852/1‑150 (MQ=255) agaTCCTGCCCCGGAACTGGGGCTGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCgg > 1:23766/3‑150 (MQ=255) gaTCCTGCCCCGGAACTGGGGCTGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCGGc > 2:1369851/2‑150 (MQ=255) aTCCTGCCCCGGAACTGGGGCTGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCGGCa > 1:857879/1‑150 (MQ=255) aTCCTGCCCCGGAACTGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCGGCa > 2:18375/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCGGCAAg > 2:624059/1‑150 (MQ=255) ccAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCGGCAAg > 2:1332848/1‑150 (MQ=255) aGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCGGCAAGGa > 1:688352/1‑150 (MQ=255) ccAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATTCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCGGCAAGGATAgt < 1:1065224/150‑2 (MQ=255) ccAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCGGCAAGGATAGc < 2:543364/150‑1 (MQ=255) | CATAGCGCGGCAGTAGCGTGCCGTCGATTTCCAGCGGCTCTAACGGGTCAGGCAAGTCATGTGCCAGACACTGGGCGCGCAACGTCAGCAAATCTGCTTTCGAGTTGTACGGTAAAACGTACATAATTGGACGAGAGGTATCCAGCCCCAGTTCCGGGGCAGGATCTGCCGGAATAGACTTGCTTTTTACCAGGATGCTTAATGGTAAATTCAGTAATTTGTAGTAAATTCGTGGCCAGCCGGACATAAACGATGTAAAGCCTCTGGTTAATAATGCAAATGCGCGGCAAGGATAGC > NC_000913/4256220‑4256516 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |