| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 585,863 | T→C | 5.4% | intergenic (‑230/‑194) | ompT ← / → pauD | DLP12 prophage; outer membrane protease VII; outer membrane protein 3b/tRNA‑OTHER |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 585,863 | 0 | T | C | 5.4% | 389.9 / 9.1 | 129 | intergenic (‑230/‑194) | ompT/pauD | DLP12 prophage; outer membrane protease VII; outer membrane protein 3b/tRNA‑OTHER |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/66); new base C (5/2); total (61/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.54e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.19e-01 | |||||||||||
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
ACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAGCGCA > NC_000913/585715‑586012 | aCTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCttt < 2:1068158/150‑1 (MQ=255)aCTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCttt < 1:1627910/150‑1 (MQ=255)aCTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCttt > 1:787338/1‑150 (MQ=255) gTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGG‑TTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTagag < 2:901429/150‑1 (MQ=255) tttATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTagag < 2:426661/150‑1 (MQ=255) atatTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGC‑TTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCat < 1:1091180/150‑1 (MQ=255) atTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCata < 1:711399/150‑1 (MQ=255) atTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCata > 2:1354457/1‑150 (MQ=255) tttGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTCTAAAGGCatggc < 2:184727/150‑4 (MQ=255) tGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAg < 1:542621/150‑1 (MQ=255) ttttAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGc < 2:1117466/149‑1 (MQ=255) gTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGc < 1:554746/150‑1 (MQ=255) gTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGc > 2:148284/1‑150 (MQ=255) gTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGGGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTCTAAAGGCatggcact < 2:278946/150‑7 (MQ=255) ttAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATATGCGa > 1:174164/1‑150 (MQ=255) aGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGaaa > 1:1562572/1‑150 (MQ=255) gTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGaaaa > 1:1096993/1‑150 (MQ=255) tATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAAt > 1:1256420/1‑150 (MQ=255) gAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGATTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCa > 1:1113902/1‑150 (MQ=255) gATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAg > 2:564465/1‑150 (MQ=255) ttATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGt > 1:1657292/1‑150 (MQ=255) tATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGtt < 2:662516/150‑1 (MQ=255) aTCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGttt > 1:151295/1‑150 (MQ=255) tCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTa > 1:1407951/1‑150 (MQ=255) acaATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATc < 2:641237/150‑1 (MQ=255) acaATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATc < 1:1038743/150‑1 (MQ=255) caATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTTTCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATcc < 1:656892/150‑1 (MQ=255) caATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATcc < 1:1680799/150‑1 (MQ=255) cgcTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATTCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAAt < 1:844007/150‑1 (MQ=255) gcTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTTTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTTCCATGCCTTTAGAGTCATATAAGCGAAAATAGCATGTGTTTTAACATCAAtt > 1:241100/1‑150 (MQ=255) tCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTa < 1:1458429/150‑1 (MQ=255) tGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATg < 2:505838/150‑1 (MQ=255) ttGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGttttt < 2:1593985/150‑1 (MQ=255) ggTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTa > 1:434850/1‑150 (MQ=255) gTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAg > 2:1210352/1‑150 (MQ=255) tttAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTAAATTACTATGTTTTTTAGt > 2:887406/1‑150 (MQ=255) tttAATTATCTGTAATAGGTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTTAGTGCCATGCCTTTAGATGCATATAAGCGAAAATATCAAGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGt < 1:312582/150‑1 (MQ=255) aaTTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACa < 2:1286752/150‑1 (MQ=255) aTTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACaa > 2:1047859/1‑150 (MQ=255) tATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACaaaa > 2:349715/1‑150 (MQ=255) tATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACaaaa > 2:1645567/1‑150 (MQ=255) gTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAagag > 2:569199/1‑150 (MQ=255) ttATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAgg < 1:999967/150‑1 (MQ=255) ttATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAgg < 2:919834/150‑1 (MQ=255) tATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTTCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGATGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAggg < 1:440358/150‑1 (MQ=255) tATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAggg < 2:1618560/150‑1 (MQ=255) tGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACa < 2:636211/150‑1 (MQ=255) ttttCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACaa < 1:549559/149‑1 (MQ=255) cATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACt > 2:1348833/1‑150 (MQ=255) cATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACt > 2:840088/1‑150 (MQ=255) tttCGGTTTTGCTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTgaga < 1:636932/150‑1 (MQ=255) tttCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTgaga < 1:746362/150‑1 (MQ=255) ttCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGac < 1:168057/150‑1 (MQ=255) ttCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGac > 1:105319/1‑150 (MQ=255) ttCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATAACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTTAGac > 1:598656/1‑150 (MQ=255) ggTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGAcaca > 1:1080357/1‑150 (MQ=255) tACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAgg < 2:382697/150‑1 (MQ=255) tACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCAGATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAgg > 2:848581/1‑150 (MQ=255) aCTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGc > 2:538357/1‑150 (MQ=255) cTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGcc < 2:787338/150‑1 (MQ=255) cTGTGAGGTTTTATTATGCTATTGTGGCGCTTTTATCAATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGcc < 2:44446/150‑1 (MQ=255) gtgtgGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTc > 2:483999/1‑150 (MQ=255) gtgtgGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTc > 1:1016934/1‑150 (MQ=255) gTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAAt > 1:600974/1‑150 (MQ=255) gTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAAt > 1:918837/1‑150 (MQ=255) tttttttATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATg < 2:1362806/150‑1 (MQ=255) ttttttATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGAGAAAATAGCATGAGGTTTATCATCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAAttg > 1:1290792/1‑148 (MQ=255) ttttatATGCTTTTGTGGTGCTTTTAACAAATTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCATCGCAATgg > 1:1290794/1‑150 (MQ=255) ttttATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCt < 1:968633/150‑1 (MQ=255) aTGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCa > 2:858690/1‑150 (MQ=255) cTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTgag > 2:361101/1‑120 (MQ=255) cTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTgag < 1:361101/120‑1 (MQ=255) cTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAgg < 1:1139022/150‑1 (MQ=255) cTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAgg > 1:1458755/1‑150 (MQ=255) tttGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCt < 1:1640101/150‑1 (MQ=255) ttGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCtt < 1:1001992/150‑1 (MQ=255) tgttgtGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCttt < 1:24373/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATTCCTTTTGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAATAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCttt < 2:929271/150‑1 (MQ=255) tgtgGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCttt < 2:151295/150‑1 (MQ=255) gtggtgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTa > 2:450329/1‑150 (MQ=255) tggtgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTAc > 2:383557/1‑150 (MQ=255) tgCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATg > 1:872583/1‑150 (MQ=255) cTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGtt > 1:423023/1‑150 (MQ=255) ttATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGttttt > 1:958602/1‑149 (MQ=255) ttATATATTTCAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAAGAGCCTGAGGGTTATCCTCAATTAATATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAAATGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTGTTg < 2:311176/150‑1 (MQ=255) aTCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAg < 2:485791/150‑1 (MQ=255) cTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGt < 1:576055/150‑1 (MQ=255) cgcttataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGATTTAAATGTTTTTAGTTAGTggg > 2:117259/8‑150 (MQ=255) aGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGa > 2:1200653/1‑150 (MQ=255) cttataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGAc > 1:165165/6‑150 (MQ=255) cttataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGAc > 2:1378812/6‑150 (MQ=255) cttataTGCCTCTAAAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGAc > 1:1545583/6‑150 (MQ=255) tGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACg < 2:181134/150‑1 (MQ=255) ccATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGTGACAAAACTGAGACTCATAAGGGCTCGCTATGGCTTGCAAGGCTTTTCATGTTTTGAGGTAGTGGGACgtg < 1:1316966/150‑1 (MQ=255) cATGCATTTAGAGGAATATAAGCTAAAATAGCATGATGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACTAAACTGAGACAGATAATGCCTCGCAATGGCTTGAAATGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACgtgt < 2:1290794/150‑1 (MQ=255) aaTGACTTTAGATTCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCATCAATTAATATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGATTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACgtgt < 2:1290792/149‑1 (MQ=255) tGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGATTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTTGTACGTGTGa > 1:353388/1‑150 (MQ=255) gCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAg > 2:918447/1‑150 (MQ=255) gCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAg < 1:854600/150‑1 (MQ=255) ttAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAGCGCa > 2:232311/1‑150 (MQ=255) | ACTGTTTATATTTTGTTTAGTATTGAATGATTATCACAATGCGCTATCTGTTTTTGGTTTAATTATCTGTTATTGTTTCATATTTCGGTTTTACTGTGTGGTTTTTTTATGCTTTTGTGGTGCTTTTATCTATTTAAGTGCCATGCCTTTAGAGGCATATAAGCGAAAATAGCATGAGGTTTATCCTCAATTACTATGTTTTTTAGTACAAAAAAGAGGGACAAAACTGAGACACATAAGGCCTCGCAATGGCTTGCAAGGCTTTACATGTTTTGAGGTAGTGGGACGTGTGAGCGCA > NC_000913/585715‑586012 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |