| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_000913 | 693,030 | C→A | 5.9% | V117L (GTA→TTA) | ybeZ ← | heat shock protein, putative NTPase; PhoH‑like protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 693,030 | 0 | C | A | 5.9% | 285.5 / 5.8 | 93 | V117L (GTA→TTA) | ybeZ | heat shock protein, putative NTPase; PhoH‑like protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (41/46); new base A (2/4); total (43/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.83e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACA > NC_000913/692881‑693178 | gCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTAc > 1:896353/1‑150 (MQ=255)gCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAAAGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGGCTGTGTTGGCGTGCGCGGCTTAATTAc > 1:698188/1‑150 (MQ=255) ttCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCcgcg < 2:623098/150‑1 (MQ=255) ccTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGtt > 2:1252144/1‑150 (MQ=255) ccTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGtt > 2:1265627/1‑150 (MQ=255) cTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCGTAATTAAGCcgcgcac < 1:318622/150‑4 (MQ=255) tGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCGACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTg > 2:1538618/1‑150 (MQ=255) tGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTg < 2:113594/150‑1 (MQ=255) tGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCGTAATTAAGCcgcgcacg < 1:1671588/150‑5 (MQ=255) tGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCGTAATTAAGCcgcgcacg < 1:749896/150‑5 (MQ=255) tGACGCTCCACGGCATCAACTGCCGCACCCACTGCCAGGTAGCTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCAAGGTCGAGAATATAGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCGTAATTAAGCcgcgcacg < 1:36094/150‑5 (MQ=255) gACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGGTTgg > 2:890326/1‑150 (MQ=255) tCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTg < 2:1664307/150‑1 (MQ=255) 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cgcCGGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAAt < 1:1180899/150‑1 (MQ=255) gcCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATc < 1:1252144/150‑1 (MQ=255) tGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGGGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGa > 2:326001/1‑150 (MQ=255) tttGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACcg < 1:787966/150‑1 (MQ=255) accaaacgcgGCGTAATTAAGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCgcgc > 1:1180555/7‑150 (MQ=255) cGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTTCTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCAt > 1:24383/1‑150 (MQ=255) cGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCAt > 2:1322877/1‑150 (MQ=255) gTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGGTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATc < 1:1071703/150‑1 (MQ=255) cTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCAGCGCTTTGCTCCAGTACACTCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGt > 1:190023/1‑150 (MQ=255) ttAATTACGCCGCGTTTGGCTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTa < 1:471392/150‑1 (MQ=255) aaTTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATc > 2:1665866/1‑150 (MQ=255) aTTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCg < 2:284295/150‑1 (MQ=255) aCGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACa < 2:899855/150‑1 (MQ=255) | GCGAATTTCCTGACGCTCCAGGGCATCAACTGCCGCAGCCACTGCCAGGTAGGTTTTACCCGTACCCGCCGGGCCAACGCCGAAGGTAATGTCATGGTCGAGAATATTGGCGATGTACTGCGCCTGGTTTGGCGTGCGCGGCTTAATTACGCCGCGTTTGGTTTTGATATTGACCGCTTTGCCGTACTCCGGCACGCTCTCCGCGCTTTGCTCCAGTACCCGCGCTTCTTTAATCGCAAGGTGGATCTGTTCCGGTTCGATATCCTGAATCTGACCGCGCATCGGGGCAGTATCGACA > NC_000913/692881‑693178 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |