| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 951,219 | T→A | 5.6% | intergenic (‑139/+53) | pflA ← / ← pflB | pyruvate formate‑lyase 1‑activating enzyme; [formate‑C‑acetyltransferase 1]‑activating enzyme; PFL activase/formate C‑acetyltransferase 1, anaerobic; pyruvate formate‑lyase 1 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 951,219 | 0 | T | A | 5.6% | 315.4 / 4.6 | 110 | intergenic (‑139/+53) | pflA/pflB | pyruvate formate‑lyase 1‑activating enzyme; [formate‑C‑acetyltransferase 1]‑activating enzyme; PFL activase/formate C‑acetyltransferase 1, anaerobic; pyruvate formate‑lyase 1 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/50); new base A (3/4); total (56/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TGACATTGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTC > NC_000913/951075‑951368 | tGACATTGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTg < 2:894992/150‑1 (MQ=255) aCATTGCGGTGTTTCTCCTGATGGGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCGACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCTCCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAATAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGa < 1:1110097/150‑1 (MQ=255) ttGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGcc < 1:1462158/150‑1 (MQ=255) ttctgtgtTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAATGCCCCACTTTCGTGGAGCCt < 2:1535169/146‑1 (MQ=255) gCGGTGGTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCtt < 2:468773/150‑1 (MQ=255) gtggTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGGGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTAt < 2:1601861/150‑1 (MQ=255) tgtTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCAGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGTCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTGGTGGAGCCTTTAtt > 2:137487/1‑150 (MQ=255) ggtTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTAtt < 2:176118/149‑1 (MQ=255) gtTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTAATg < 2:802911/150‑1 (MQ=255) gtTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGGCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTg < 1:366353/150‑1 (MQ=255) tttCTCCCGATGGGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCGCGAAGGCTACGGCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCTCCACGAACGGGGGGCCttttttag < 2:831080/150‑3 (MQ=255) tttCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAACGCTCCACGAAAGTGGGGCCttttttag < 1:263931/150‑3 (MQ=255) ttCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCTCCACGAAAGTGGGGCCttttttagc < 1:193235/150‑4 (MQ=255) ggcctcAGATGGGCCACATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTa > 1:1692002/6‑150 (MQ=255) tctcCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCTCCACGAAAGTGGGGCCttttttagcg < 2:1465550/150‑5 (MQ=255) tctcCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTAc < 2:1177373/150‑1 (MQ=255) ctcCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACg > 2:1491669/1‑150 (MQ=255) ctcCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCGCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTCCg > 1:216337/1‑150 (MQ=255) cAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCtt > 2:811076/1‑150 (MQ=255) aTGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCttttt < 2:35072/150‑1 (MQ=255) tgtgGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTa > 1:1432514/1‑150 (MQ=255) ggCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCATCTCGAAGGATACGTCGAGTCAGTTTTTGCAGTCACCTTAAAATATAGATAGATGACAAAAAAGGATCTCGCGCAAAAAAAGGCCACAGTTACGGGCAGCCTATATTGTACGCATTATACtt > 2:1695861/1‑149 (MQ=255) gCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGt > 1:995114/1‑150 (MQ=255) gCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGt < 1:1137073/150‑1 (MQ=255) gCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCGCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGt < 1:1131297/150‑1 (MQ=255) ccATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTCTAGATAGCTGTCAAAAATGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTAc < 1:80220/150‑1 (MQ=255) cTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGAtt > 2:548979/1‑150 (MQ=255) cggCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCa < 2:1235154/149‑1 (MQ=255) aGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCa > 2:1407887/1‑150 (MQ=255) aGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCa > 2:1476511/1‑150 (MQ=255) ggCCGTGTTGGTGCGCAGCGCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAACAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAg < 1:337955/150‑1 (MQ=255) gCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAATGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGt > 2:1137104/1‑150 (MQ=255) gtgtTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCaa > 1:1148698/1‑150 (MQ=255) gtgtTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCaa > 2:1527549/1‑150 (MQ=255) tGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACTCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCt < 1:709857/150‑1 (MQ=255) tGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCt > 2:1251811/1‑150 (MQ=255) tGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCt < 2:537915/150‑1 (MQ=255) gTGCGCAGCGCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTATGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGCCAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTaa < 2:1043194/150‑1 (MQ=255) gcAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTAc > 1:1500189/1‑150 (MQ=255) gcAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTAc < 1:199928/150‑1 (MQ=255) gcAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTAc > 2:1608514/1‑150 (MQ=255) gcAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTAc > 1:1194348/1‑150 (MQ=255) gcAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCACGCGCTAAAAAAGGCCCCACTATCGTGGAGCCTTTATTGTAAGCTTTTTACTGAACGAATACAGTCAAATCAAATTAc > 2:1338956/1‑150 (MQ=255) gCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATa < 2:49307/150‑1 (MQ=255) cTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAg > 2:990426/1‑150 (MQ=255) cGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGAt > 2:1486000/1‑150 (MQ=255) aaGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAATGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTg < 1:912343/150‑1 (MQ=255) aaGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTg < 1:1256449/150‑1 (MQ=255) aGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGa > 2:1261908/1‑150 (MQ=255) ggCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAg < 2:989880/150‑1 (MQ=255) ggCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAg > 2:758565/1‑150 (MQ=255) gCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGt > 1:631772/1‑150 (MQ=255) gCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGt < 1:687380/150‑1 (MQ=255) gCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACATTAGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTAAGACAAATCTAATTACAAAGATTGAGt > 1:1563158/1‑150 (MQ=255) cTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCTCTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTg < 2:805323/150‑1 (MQ=255) cTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTg > 2:636951/1‑150 (MQ=255) cGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAg > 1:1279907/1‑150 (MQ=255) cGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTAAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAg < 2:552678/150‑1 (MQ=255) cGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTa > 2:743483/1‑150 (MQ=255) tCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAg < 1:1208935/150‑1 (MQ=255) cTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGt > 1:396252/1‑150 (MQ=255) ttttGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGtaat > 2:690457/1‑150 (MQ=255) aGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTcc > 2:1658451/1‑150 (MQ=255) aGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTcc < 1:664817/150‑1 (MQ=255) aGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTcc < 2:193265/150‑1 (MQ=255) cACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgc > 2:670683/1‑150 (MQ=255) aCCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgct < 1:609305/150‑1 (MQ=255) ccTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctg > 2:1723126/1‑150 (MQ=255) ccTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctg > 2:599882/1‑150 (MQ=255) cTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctgc > 2:1033525/1‑150 (MQ=255) cTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCctgctgc < 1:1036234/150‑1 (MQ=255) gtatttatagCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAATAAGGCCCCACTTTCTTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATGTAATTACATAGATTGAGTGAATGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCt < 1:1509281/144‑1 (MQ=255) gTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCt < 2:300857/150‑1 (MQ=255) gTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCt < 2:1195936/150‑1 (MQ=255) gTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTATCGTGGAGCCATTATTGTACGCTTATTACTGTACCATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACCTCCTGCTGCTGTTCt > 2:725349/1‑150 (MQ=255) atagatagCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCttt < 2:447861/150‑1 (MQ=255) agatagCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATTCATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCttttg > 2:372643/1‑148 (MQ=255) agatagCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAg < 1:1428295/150‑1 (MQ=255) agatagCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGAATGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAg < 2:701198/150‑1 (MQ=255) agatagCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGATGTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAg > 1:523109/1‑150 (MQ=255) tGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGa < 1:584474/150‑1 (MQ=255) gACAAAAAAGGCTCTCGCGCTTAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAg > 1:90213/1‑150 (MQ=255) aCAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGt < 1:670683/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCGTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGa > 2:1213703/1‑150 (MQ=255) aaaaGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGaa > 2:1151566/1‑150 (MQ=255) gCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTa < 1:803278/150‑1 (MQ=255) ctctCGCGCTAAAAAAGGCCACACTTTCGTTGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTAc < 2:520586/150‑1 (MQ=255) ctcGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTg < 2:1432514/150‑1 (MQ=255) cgcTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTa > 2:222406/1‑150 (MQ=255) cgcTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTa > 2:227458/1‑150 (MQ=255) cgcTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAAAGTACTGCGTa > 2:181883/1‑150 (MQ=255) aaaaaGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAg < 2:758962/150‑1 (MQ=255) aaaaaGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTATTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACCTACTGCGTATCCAg > 1:879169/1‑150 (MQ=255) aaGGCCCCACGTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCATATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGGAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCTTAGCCAGATa > 1:389665/1‑150 (MQ=255) ccccACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACg > 2:1579235/1‑150 (MQ=255) ccccACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACg > 2:569139/1‑150 (MQ=255) ccccACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTAAGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACg > 2:129635/1‑150 (MQ=255) aCTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATg < 2:90213/150‑1 (MQ=255) tttCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGt < 1:758565/150‑1 (MQ=255) ttCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGGGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTc < 1:1527549/150‑1 (MQ=255) | TGACATTGCGGTGTTTCTCCAGATGTGGCCCATCTGAGGCCGTGTTGGTGCGCAGCTCGAAGGCTACGTCGAGTCTGTTTTGGCAGTCACCTTAAAGTATAGATAGCTGACAAAAAAGGCTCTCGCGCTAAAAAAGGCCCCACTTTCGTGGAGCCTTTATTGTACGCTTTTTACTGTACGATTTCAGTCAAATCTAATTACATAGATTGAGTGAAGGTACGAGTAATAACGTCCTGCTGCTGTTCTTTAGTCAGCGAGTTGAAACGTACTGCGTAGCCAGATACACGGATGGTC > NC_000913/951075‑951368 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |