| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,408,537 | A→T | 7.8% | E163V (GAG→GTG) | ydaN → | putative Zn(II) transporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,408,537 | 0 | A | T | 7.8% | 189.2 / 7.5 | 77 | E163V (GAG→GTG) | ydaN | putative Zn(II) transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (37/34); new base T (2/4); total (39/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.82e-02 | |||||||||||
CGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCA > NC_000913/1408389‑1408686 | cGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTCGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGag < 2:1645866/150‑1 (MQ=255) gTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGagca > 2:1648165/1‑150 (MQ=255) gTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACAGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGagca > 1:1609243/1‑150 (MQ=255) tAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTCGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGagcagc < 1:615315/150‑1 (MQ=255) aTTGATTCTACCCGACAACGCAAAGTGCGGGCGCTGGACGATGAGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGTCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTg < 2:861140/150‑1 (MQ=255) ttgcgacccgaccACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGGGAGCGATCTGGAAGCGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCGGGGGGATGTGGGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACg < 1:1580382/147‑1 (MQ=255) ttCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGa > 1:540813/1‑150 (MQ=255) cGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCCCGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATa > 2:755598/1‑150 (MQ=255) gACCCGACAACGCACAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATaa < 1:1478172/150‑1 (MQ=255) gACCCGACAACGCAAAGGCCTGCCGCTGGACGATGTGGCTAGCGTTCTGGAAGCTGGCACGGGTCCTACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATaa < 2:1106476/150‑1 (MQ=255) cccGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGTGCAGCTGCTCGATaaat < 1:1031618/150‑2 (MQ=255) cccGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGTGCAGCTGCTCGATaaat < 2:1443760/150‑2 (MQ=255) cccGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGTGCAGCTGCTCGATaaat < 2:1694365/150‑2 (MQ=255) cccGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGAGCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGTGCAGCTGCTCGATaaat < 2:1481265/150‑2 (MQ=255) cAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATc < 2:1438888/150‑1 (MQ=255) cAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATc < 1:421897/150‑1 (MQ=255) aaaCGCAAAGTGCTGGCGATGGACGATGTGGTGAGCTATCTGTAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGTGATGGCTGGTGGATGTGTTCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATc < 2:1191716/149‑1 (MQ=255) aaCGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGAGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCg > 1:1471090/1‑150 (MQ=255) cGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGAc > 1:499620/1‑150 (MQ=255) cGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGAc > 1:1386818/1‑150 (MQ=255) cGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGAc > 2:65308/1‑150 (MQ=255) gCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGAcc < 2:1394610/150‑1 (MQ=255) aaaGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGACCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCTAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACAtt > 2:1068421/1‑150 (MQ=255) aaGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTg < 1:1387304/150‑1 (MQ=255) gCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGa > 1:1071767/1‑150 (MQ=255) tGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGCCCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATa > 1:175977/1‑150 (MQ=255) gctcTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGAACGGTTACGACCGATTGCGGGGGATGGATTATGTATGTGTGCGATGCGTTGAACGATCAAACCAGAGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAAt > 2:228006/4‑150 (MQ=255) gcTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAAtct > 1:1461734/1‑150 (MQ=255) gcTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAAtat > 1:1064795/1‑148 (MQ=255) aCGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCTAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGAACTTGAAGATAATCTCCttt > 1:758264/1‑149 (MQ=255) cGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGa > 1:1382615/1‑150 (MQ=255) gtgAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCaa < 1:1150616/150‑1 (MQ=255) tCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCAcc > 1:1695244/1‑150 (MQ=255) cTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACcg > 1:1275838/1‑150 (MQ=255) agagGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGTGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTgg < 2:1650596/150‑1 (MQ=255) ggCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTc > 1:1446346/1‑150 (MQ=255) ccACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTcc > 1:386064/2‑150 (MQ=255) cgaccgaTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTctgc < 1:1611887/150‑1 (MQ=255) cgaccgaTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATATATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTctgc > 1:689686/1‑150 (MQ=255) gaccgaTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTctgct > 2:187753/1‑150 (MQ=255) accgaTTGCGGGGGATGGCTGGGGGATGTGTGCGATGCGATGACCGATCATTCCAGTTAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCATGAAGATAATCTCATTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTctgctg < 2:349169/150‑1 (MQ=255) ccgaTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCtgctgc < 1:596376/150‑1 (MQ=255) cgaTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTgcg > 2:1211320/1‑150 (MQ=255) gaTTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTgcgc > 1:302220/1‑150 (MQ=255) gCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGATCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAAc < 1:774610/150‑1 (MQ=255) gCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAAc > 1:518609/1‑150 (MQ=255) gggATGGCTGGTTGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTCAATTTCTCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACaatt < 2:1167116/150‑1 (MQ=255) ggATGGCTGGTGGATGGGTGCGATGCGTTGACCGATCAATCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACaatta < 2:892269/150‑1 (MQ=255) gATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACaattaa > 2:1413162/1‑150 (MQ=255) tGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACaattaatt < 2:1461734/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGTACGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATtgtg < 2:919291/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATtgtt > 2:1356159/1‑149 (MQ=255) tggtggATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCTCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGa < 1:1032273/150‑1 (MQ=255) tggtggATGGGTGCGATTCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTAGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGa < 1:1523697/150‑1 (MQ=255) tgtgtgCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCg < 2:518609/150‑1 (MQ=255) tgtgCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCt > 1:648278/1‑150 (MQ=255) gATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATg > 2:748000/1‑150 (MQ=255) gATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATg < 1:417110/150‑1 (MQ=255) gATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATg > 2:741731/1‑150 (MQ=255) tGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGc < 1:1356269/150‑1 (MQ=255) tGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGc < 2:436858/150‑1 (MQ=255) cGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCAc > 2:531526/1‑150 (MQ=255) gACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCa > 2:461405/1‑150 (MQ=255) 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ccAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGttt < 2:1723629/150‑1 (MQ=255) cAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATAAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTa < 2:175977/150‑1 (MQ=255) taattttATCGTGCAGCTGCTCGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGc > 2:1310824/5‑150 (MQ=255) attttATCGTGCAGCTGCTCGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTc > 1:628928/3‑150 (MQ=255) aaTTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCATATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCtg < 1:228006/150‑2 (MQ=255) aaTTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTc > 2:1268451/1‑150 (MQ=255) aTTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGAAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCg < 2:625510/150‑1 (MQ=255) tATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCt < 2:1471090/150‑1 (MQ=255) aTCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCtt > 2:818863/1‑150 (MQ=255) tCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTg < 2:194152/150‑1 (MQ=255) cGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGc > 1:850232/1‑150 (MQ=255) gAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGcc > 1:198955/1‑150 (MQ=255) gAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGcc < 2:1695244/150‑1 (MQ=255) agcagcTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTACTTGATCTGCAAATTCCACCGCGTTGATTCCTGGCTCTGCTGCGCATACAATTAATTGTGATGCTTCGCTATATGGCACCTCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCa < 1:1624051/150‑1 (MQ=255) | CGGTTAATTGTTTCGACCCGACAACGCAAAGTGCTGGCGCTGGACGATGTGGTGAGCGATCTGGAAGAGGGCACGGGTCCGACCGATTGCGGGGGATGGCTGGTGGATGTGTGCGATGCGTTGACCGATCATTCCAGTGAATTTATCGAGCAGCTGCACGATAAAATTATCGACCTTGAAGATAATCTCCTTGATCAGCAAATTCCACCGCGTGGATTCCTGGCTCTGCTGCGCAAACAATTAATTGTGATGCGTCGCTATATGGCACCGCAACGTGATGTTTATGCTCGTCTTGCCA > NC_000913/1408389‑1408686 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |