| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,471,095 | 0 | G | C | 6.9% | 298.0 / 10.1 | 98 | pseudogene (579/3497 nt) | ydbA | pseudogene, autotransporter homolog; interrupted by IS2 and IS30 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (49/39); new base C (2/5); total (52/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.44e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.72e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
TGCGAGATATAGCTAGCAACAGCGCCATTGACTTCGGTACAGGTGTGGGAGTTGGTACTGATAGTTATAGTGGTGCAGGGAAAAATGCAACAGCAATTAACCAATTGGGCGGTGTTATAACTATTTATAACGCCGGCGCAGGTATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCGAAAAAAATGGTAATTATGACGATAGTCTGGCAGCAAATACTCTGGTAGGGATGGCTGTTTATGAGCATGGTACTGCTATCAACGACCAGACGGGTGTTATC > NC_000913/1470946‑1471244 | tGCGAGATATAGCTAGCAACAGCGCCATTGACTTCGGTACAGGTGTGGGAGTTGGTACTGATAGTTATAGTGGTGCAGGGAAAAATGCAACAGCAATTAACCAATTGGGCGGTGTTATAACTATTTATAACGCCGGCGCAGGTATggcgg > 1:1270495/1‑150 (MQ=255) gcgcGATCTAGCTCGCAACAGCGCCATTGACTTCGGTACAGGTGTGGGAGTTGGTACTGATAGTTATAGTGGTGCAGGGAAAAATGCAACAGCAATTAACCAATTGGGCGGTGTTATAACTATTTATAACGCCGGCGCAGGTATggcggc < 1:1240474/150‑1 (MQ=255) cGAGATATAGCTAGCAACAGCGCCATTGACTTCGGTACAGGTGTGGGAGTTGGTACTGATAGTTATAGTGGTGCAGGGAAAAATGCAACAGCAATTAACCAATTTGGCGGTGTTATAACTATTTATAACGCCGGCGCAGGTATGGCGGcc < 2:1231090/150‑1 (MQ=255) 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tATTTATAACGCCGTCGCAGGTATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCGAAAAAAATGGTAATTATGACGATAGTCTGGCAGCAAATACTCTGGTAGGGATGGCTGTTTATGAGCATTGTAc < 2:115243/150‑1 (MQ=255) taACGCCGGCGCAGGTATGGCGGCATATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCGAAAAAAATGGTAATTATGACGATAGTCTGGCAGCAAATACTCTGTTAGGGATGGCTGTTTATGAGCATGGTACTGCTAt < 2:1534278/150‑1 (MQ=255) aaCGCCGGCGCAGGTATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCGAAAAAAATGGTAATTATGACGATAGTCTGGCAGCAAATACTCTGGTAGGGATGGCTGTTTATGAGCATGGTACTGCTATc > 1:1723641/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGGTATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCGAAAAAAATGGTAATTATGACGATAGTCTGGCAGCAAATACTCTGGTAGGGATGGCTGTTTATGAGCATGGTACTGCTATCAACGAc > 1:1550847/1‑150 (MQ=255) cgcAGGTATGGCGGCCTATGGCGCCAGCAATACAGTTATTAACCAGGGGACGATTAACCTCGAAAAAAATGGTAATTATGACGATAGTCTGGCAGCAAATACTCTGGTAGGGATGGCTGTTTATGAGCATGGTACTGCTATCAACGAcaa > 2:406538/1‑148 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |