| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,743,155 | C→G | 9.0% | D30H (GAC→CAC) | ribC ← | riboflavin synthase, alpha subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,743,155 | 0 | C | G | 9.0% | 285.5 / 15.9 | 89 | D30H (GAC→CAC) | ribC | riboflavin synthase, alpha subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (42/39); new base G (4/4); total (46/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.78e-01 | |||||||||||
CCCCACTTTTAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGCACAATAGCAGGTGGAAA > NC_000913/1743006‑1743299 | ccccACTTTTAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTc > 1:463303/1‑150 (MQ=255)ccccACTTTTAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTc > 1:373448/1‑150 (MQ=255)ccccACTTTTAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGATTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCAGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTc > 1:884897/1‑150 (MQ=255) cccACTTTTAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCg < 2:758302/150‑1 (MQ=255) aCTTTTAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGt < 1:1001411/150‑1 (MQ=255) cTTTTAATTCTCCAAGTTTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAATCTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCATCCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTa < 2:676940/150‑1 (MQ=255) cTTTTAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTa > 1:1036276/1‑150 (MQ=255) tttAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCACCCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCCGCATGTGGTCGGGTAAc > 2:732236/1‑150 (MQ=255) ttAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTATCGTTTCTTTCATCAGGTCACAACTGACATGGGTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGGCGGGTAACt < 1:46616/150‑1 (MQ=255) ttAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACt > 1:59625/1‑150 (MQ=255) ttAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACt < 2:566906/150‑1 (MQ=255) tAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACTGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACta > 1:1721078/1‑149 (MQ=255) aaaTCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTcc > 1:1151611/1‑150 (MQ=255) aTCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGGCCAGCATGTGGTCGGGTAACTccac < 2:1192320/150‑1 (MQ=255) gCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCccccac > 1:283201/1‑150 (MQ=255) ccAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACcaca > 1:1320443/1‑150 (MQ=255) ccAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGGCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCCCGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACcaca < 2:780671/150‑1 (MQ=255) cAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACAt < 1:607228/150‑1 (MQ=255) aaaGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACAt < 1:581305/149‑1 (MQ=255) aaGATTGGTACTGCGTAACGTTTCTTTCATCCTGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTGTCCTGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATg < 1:1084315/150‑1 (MQ=255) aGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCAACCACATGc > 1:977532/1‑150 (MQ=255) taTTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTGATCAGGTCAAAACTGACATGGATGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGGGGAGTTACCCGACCACATGct < 1:43731/149‑2 (MQ=255) taTTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGGCAAAACTGACCTGGTGGCCGTTAATTTCCGTCACGGGCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑g < 1:347426/149‑1 (MQ=255) gATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑g < 2:560430/150‑1 (MQ=255) gATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCACCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑g < 1:905430/150‑1 (MQ=255) caTTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGct < 1:131633/149‑2 (MQ=255) tGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTAc > 1:1651322/1‑150 (MQ=255) ggTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACg > 2:883146/1‑150 (MQ=255) ggTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACg > 1:948964/1‑150 (MQ=255) ggTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGA‑GTACg > 2:381029/1‑150 (MQ=255) tAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGaa > 2:1664335/1‑150 (MQ=255) gTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTg < 2:576531/150‑1 (MQ=255) gTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTg < 1:654696/150‑1 (MQ=255) aaCGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAAATTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGt < 1:30108/150‑1 (MQ=255) aaCGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTCACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGt < 1:1515933/150‑1 (MQ=255) gTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTtc < 1:426380/150‑1 (MQ=255) tctttcATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCg < 2:516877/150‑1 (MQ=255) tctttcATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCg < 1:601381/150‑1 (MQ=255) ctttcATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGt < 1:1104076/150‑1 (MQ=255) ctttcATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGt > 1:596226/1‑150 (MQ=255) tttcATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTc < 2:1036276/150‑1 (MQ=255) catcaGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAAt > 1:606439/1‑150 (MQ=255) ggTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGaca > 1:789524/1‑150 (MQ=255) ggTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGaca > 1:671520/1‑150 (MQ=255) ggTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGaca > 2:727011/1‑150 (MQ=255) gTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGacac > 2:484489/1‑150 (MQ=255) aaaCTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGt > 1:1667524/1‑150 (MQ=255) aaaCTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGt < 2:1453091/150‑1 (MQ=255) aaCTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCGACCGTTATGCGCAACGGAAGGAACGTTTTCCAGGGCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTACGCCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCTTCAATCGACGCCTGtt > 2:262041/1‑150 (MQ=255) cTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGtttt < 2:162543/150‑1 (MQ=255) cATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCgg < 1:883146/150‑1 (MQ=255) tGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTg < 1:370739/150‑1 (MQ=255) gTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGcc > 1:898397/1‑150 (MQ=255) tGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGCCACCAGTTTTGCGGTGCCCt > 2:1173523/1‑150 (MQ=255) cGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACTGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCTGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTa < 2:583926/150‑1 (MQ=255) cGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTa > 1:434157/1‑150 (MQ=255) ttAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACa > 2:1242186/1‑150 (MQ=255) ttCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATccc < 2:1363392/150‑1 (MQ=255) tCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATcccc > 2:1553446/1‑150 (MQ=255) ccGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCg < 2:1437592/150‑1 (MQ=255) cGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGt > 2:1176882/1‑150 (MQ=255) ccACGGTCATGCAGCAACCGTTAAGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCAGTACAATCCCCGTaa < 1:1470520/149‑1 (MQ=255) tCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACTTAc < 1:727011/150‑1 (MQ=255) ggCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTa > 2:1691147/1‑150 (MQ=255) agcaACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACaa > 2:312339/1‑150 (MQ=255) caACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACt > 1:1520612/1‑150 (MQ=255) aaCCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACACTCCCCGTAAACATACTTACAACTc > 1:1283496/1‑150 (MQ=255) aaCCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTc > 2:674073/1‑150 (MQ=255) cGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTg < 2:463303/150‑1 (MQ=255) tGCGCCACGGAAGCACCTGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGA‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATAGACACCAGGTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc < 1:393116/150‑1 (MQ=255) tGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATc < 2:746736/150‑1 (MQ=255) cgcCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAg < 2:948964/150‑1 (MQ=255) cGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAg < 2:977532/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTg < 2:898397/150‑1 (MQ=255) ccGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGGACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTg > 1:455513/1‑150 (MQ=255) ggTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCACGTAAACATACATACAACTCCTGAAATCAGTTATGAAATTCTGtt > 2:647485/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAg < 2:671520/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGca > 1:582212/1‑150 (MQ=255) cAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGCCATTCTGTTCAGctc > 2:246965/1‑148 (MQ=255) aGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGcaca < 2:1320443/150‑1 (MQ=255) ttcgtacgCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGCTGGACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGCACAAt > 1:397359/8‑150 (MQ=37) cGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACTAAAATTTGGTGTCTCGTCAATCGCCACCAGTTGTGCTGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACCTACTTCCACCGCCTGAAATCAGGTAAGACATTCTTTTCAGCACACTat > 1:174336/1‑149 (MQ=255) cGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGCACAATAg > 1:1395373/1‑150 (MQ=255) gtacgCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGCACAATAGCa > 2:365828/5‑150 (MQ=255) ccAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGCCATTCTGTTCAGCACAATAGCAg > 2:1188275/1‑150 (MQ=255) ccAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGCACAATAGCAg < 2:1313548/150‑1 (MQ=255) ccAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGCACAATAGCAg < 1:312339/150‑1 (MQ=255) cAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGCACAATAGCAgg > 1:1367161/1‑150 (MQ=255) cgCATGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACTCCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAAGTCCTTAAATCAGTTAAGACATTCTGTACAGCACAATAGCAGGt > 1:1215610/2‑150 (MQ=255) cATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGGTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGGTCAGCACAATAGCAGGTgg > 2:900153/1‑150 (MQ=255) aTGTGGTGGAGTTACCCGACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGCAATCAGTTAAGCCATTCTGTTCAGCACAATAGCAGGTGGa > 1:1384146/1‑150 (MQ=255) gtgGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAAGATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGCACAATAGCAGGTGGaaa > 1:1646608/1‑150 (MQ=255) | CCCCACTTTTAAATCGCCAAGATTGGTAATGCGTAACGTTTCTTTCATCAGGTCAAAACTGACATGGTTGCCGTTAATTTCCGTCACGGTCAGGCAGCAACCGTTATGCGCCACGGAAGCACCGGTTTCCAGGCCGTCCAGCATGTGGTCGGGTAACTCCACCACATGC‑GTACGAAAATTTGGTTTCTCGTCAATCGACACCAGTTTTGCGGTGCCCTGTACAATCCCCGTAAACATACTTACAACTCCTGAAATCAGTTAAGACATTCTGTTCAGCACAATAGCAGGTGGAAA > NC_000913/1743006‑1743299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |