| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,906,231 | C→A | 10.5% | L182I (CTC→ATC) | mntP → | putative Mn(2+) efflux pump, mntR‑regulated |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,906,231 | 0 | C | A | 10.5% | 235.0 / 16.4 | 95 | L182I (CTC→ATC) | mntP | putative Mn(2+) efflux pump, mntR‑regulated |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/40); new base A (6/4); total (51/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.48e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.26e-01 | |||||||||||
ACATTATCGCGACCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGCAATAATGCGACG > NC_000913/1906082‑1906380 | aCATTATCGCGACCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATcc > 2:615842/1‑150 (MQ=255) cATTATCGCGACCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCct > 2:217138/1‑150 (MQ=255) tCGCGACCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGa < 2:551802/150‑1 (MQ=255) cgACCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGc > 1:1657696/1‑150 (MQ=255) gACCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGAGGATCTGGACGcc < 1:996586/150‑2 (MQ=255) aCCGCATTGGCCATCGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCAc < 1:94245/150‑1 (MQ=255) ccGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGTGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGAGGATCTGGACGccga < 2:1473317/150‑4 (MQ=255) ccGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACt > 2:459107/1‑150 (MQ=255) cATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTcc > 2:1400618/1‑150 (MQ=255) cATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGCCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTcc > 2:1476094/1‑150 (MQ=255) aTTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCTCTTCCa < 2:5809/150‑1 (MQ=255) aTTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGAGGATCTGGACGccgatgcc < 2:52279/150‑8 (MQ=255) ggCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACgg > 1:234485/1‑150 (MQ=255) ccATTGGTTGTGCAACCTTTATTATGTATACATTAGGGATGATGGTTTGTCGCTTTATCGGCTCTATTATTTTTTATATAGCTTAATTTTTCGTCGGGCTGGTGCTGATCGGGATATGCTTCAATATCATCTGGACGCACTTCCACGGtt < 2:1146509/150‑1 (MQ=255) ccATTGGTGGTGCACCCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGGTGGGCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGtt < 1:769171/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAAGATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCTTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTtaata < 1:673575/150‑1 (MQ=255) tGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTtaata > 1:1110343/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTtaataa > 2:620423/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTtaataa > 1:800295/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTtaataa > 2:1339896/1‑150 (MQ=255) ggTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTtaataa > 2:1069697/1‑150 (MQ=255) gTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAg > 1:734075/1‑150 (MQ=255) ttGTGCAACCTTGATTATGTAAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGTAAAAATGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGa < 2:664779/150‑1 (MQ=255) tgCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACg < 2:1202061/150‑1 (MQ=255) cAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGGGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCt < 1:1046505/150‑1 (MQ=255) cAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATAGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCt > 2:1594118/1‑150 (MQ=255) aaCCTTGATTATGTCAACATTCGGGATGTTGGTGGGTCGCTTAAGCGGCTCAATTATTGGTAAAAACGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGGGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTg < 2:589802/150‑1 (MQ=255) aaCCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTg > 2:401454/1‑150 (MQ=255) ccTTTATTTTGTCAAAATTAGTTTTGATGGTTGGGCTTTTTTTCGTATAATTTTTTGGGAAAACAGCTTAAATTCTCGCGGGGCGGGTGCGTATCGGCATCGGGGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGcc < 2:1292680/150‑1 (MQ=255) ccTTGTTTATGGCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGGGCGGATCGGCAGCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGcc < 2:357729/150‑1 (MQ=255) ccTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGcc > 1:354456/1‑150 (MQ=255) cTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTTTTTGGAAAAATGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGATGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATATTAACGCTGCCa > 2:1642657/1‑150 (MQ=255) gATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCagag < 1:218728/150‑1 (MQ=255) aTTATGTCTACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGTGAAAAACGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATGGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAgg < 2:278189/150‑1 (MQ=255) ttttGTAAACTTTAGGGTTTAGGGTTGGGCGCTTATTCGGCAAAATTTTGGGTAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCGGGTGCTGATCGGCATCGGCGCCCAGATCCTCTGTACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGt < 2:353433/147‑1 (MQ=255) tATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTg > 2:1313962/1‑150 (MQ=255) tATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTg > 2:1043811/1‑150 (MQ=255) tATGTCAACATTAGGGATGAGGGTGGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTg < 2:824721/150‑1 (MQ=255) tGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGaa > 2:1637119/1‑150 (MQ=255) tCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAata > 2:1570811/1‑150 (MQ=255) cAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAatat > 1:1694955/1‑150 (MQ=255) aaaCATTCGGGATTTTGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCTGGGTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCATATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAatat < 2:1687776/149‑1 (MQ=255) ttcgggATGATGGTTGGGCGATTTATCGGCTCATTTCTTGGGTAAAAAGGGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTGCTGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAg < 1:339051/147‑1 (MQ=255) ttAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAg < 2:783345/150‑1 (MQ=255) ggATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCg > 2:408805/1‑150 (MQ=255) atgatgGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTc > 1:819116/1‑150 (MQ=255) atgatgGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTc < 2:1020325/150‑1 (MQ=255) tgatgGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCt < 2:1110343/150‑1 (MQ=255) tgatgGTTGGGCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGGGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCt < 1:1025066/150‑1 (MQ=255) tggttggtGGCTTTATCGGCTCAATTTTTGGGAAAAAAGCGGAAATTCGCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCAGCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGc < 1:671143/150‑1 (MQ=255) gttggtCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGGCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAg < 2:245694/150‑1 (MQ=255) ggtCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGAGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCg > 2:1013855/1‑150 (MQ=255) tttAGCGGCTCAATTATGGGGAAAAACGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCGGATCGGCAGCGGCGGCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACAct < 1:1567528/150‑1 (MQ=255) cGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGAGCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCttt < 1:110897/150‑1 (MQ=255) ggCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGCCGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCGGTCGACCACTTCtttt > 2:1714234/1‑150 (MQ=255) ggCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCtttt < 2:234485/150‑1 (MQ=255) cTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTtgc < 1:217138/150‑1 (MQ=255) tCAATTATTGGGAAAAAAGCGCAAATGCTCGGCGGGCGGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTtgct < 1:640187/150‑1 (MQ=255) cAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGTCATCGGCGTCCAGATCCTCTTGACGCACTTCAACGGTTAATAAGAACCCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTttctg > 1:329611/1‑150 (MQ=255) attattGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACATCTTTTGCTGcc > 1:1249062/1‑150 (MQ=255) ttattGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCACATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCTGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCa > 1:119258/1‑150 (MQ=255) tattGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCGACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAg > 1:19676/1‑150 (MQ=255) tGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAgtgt > 1:1003579/1‑150 (MQ=255) gggAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGtt > 2:839478/1‑150 (MQ=255) gggAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGATGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCATTTGCTGCAAGTGtt > 2:110230/1‑150 (MQ=255) gAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCATCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTg > 2:1357833/1‑150 (MQ=255) aaaaaaGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGGGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGc < 2:1134563/150‑1 (MQ=255) aaaaaGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGcc < 2:1361827/150‑1 (MQ=255) aaGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGGCGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGCATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAGCACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGGCAgc > 1:1470474/1‑149 (MQ=255) aGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGAc < 2:34581/150‑1 (MQ=255) aGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGAc > 2:1241401/1‑150 (MQ=255) tctcGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCtt < 1:615842/150‑1 (MQ=255) ctcGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTc > 2:1527148/1‑150 (MQ=255) cggcggGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGc > 1:654730/1‑150 (MQ=255) ggcggGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCAATTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTTAATATTAAAGTCCGTCTGGAAGTCGAACACTTATTTAGCTTCCACTGTTTGACATACATCTGGCTTCGCa > 1:1516133/1‑150 (MQ=255) ggCTGGTGCTGATAGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGcc < 1:1594118/150‑1 (MQ=255) tGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAgg > 1:1638479/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGAAAGGc > 2:988203/1‑150 (MQ=255) ggTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAAAGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGc > 1:439435/1‑150 (MQ=255) gCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCaaa > 1:191229/1‑150 (MQ=255) tGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCCCTTCCACGGATAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTCGCAGTCGAACACGGCGGTTGCTGCCAGTGTTTGCCCGACGTCGGGCTTCGCCCGCCAGGCACACg > 1:311582/1‑150 (MQ=255) gctcggcatcggcGGCCAGATCCTCTGGCCGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACgg < 1:1515832/148‑1 (MQ=255) atcggcagcggcGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGc < 1:1625155/150‑1 (MQ=255) tcggcatcggcGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCg < 1:1013855/150‑1 (MQ=255) tcggcatcggcGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCg > 2:1247154/1‑150 (MQ=255) gcatcggcGTCCAGAACCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAAGGCTGCCAGAGGTGAATATTAACGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTACTTTTGCTGCCAGTGATTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCa < 1:1583254/150‑1 (MQ=255) catcggcGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCAt > 2:494573/1‑150 (MQ=255) atcggcGTCCATATCCTTTGTAGGCACTTAGACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTTAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTTCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATc < 2:1516133/150‑1 (MQ=255) tgcGTCCAGAGGATCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGc > 1:242320/2‑150 (MQ=255) tgcGTCCAGAGGATCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGc > 1:190990/2‑150 (MQ=255) tgcGTCCAGAGGATCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGc > 1:108872/2‑150 (MQ=255) ggcGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTTAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGc > 1:1557376/1‑150 (MQ=255) ggcGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGc > 1:1369286/1‑150 (MQ=255) gcGTCCAGAGGATCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCTAACGGCGTCATCTGCa > 2:1050024/1‑150 (MQ=255) gcGTCCAGAGGATCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGCa > 2:1558805/1‑150 (MQ=255) aGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGCAATAATg < 2:819116/150‑1 (MQ=255) aGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGCAATAATg < 2:1657696/150‑1 (MQ=255) ctctGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGCAATAATGCGACg > 1:446220/1‑150 (MQ=255) | ACATTATCGCGACCGCATTGGCCATTGGTTGTGCAACCTTGATTATGTCAACATTAGGGATGATGGTTGGTCGCTTTATCGGCTCAATTATTGGGAAAAAAGCGGAAATTCTCGGCGGGCTGGTGCTGATCGGCATCGGCGTCCAGATCCTCTGGACGCACTTCCACGGTTAATAAGAACGCTGCCAGAGGTGAATATTAAAGTCCGTCTGGCAGTCGAACACTTCTTTTGCTGCCAGTGTTTGCCAGACTTCTGGCTTCGCACGCCAGGCAAACGGCGTCATCTGCAATAATGCGACG > NC_000913/1906082‑1906380 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |