| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,982,505 | G→A | 10.6% | intergenic (‑118/+49) | otsB ← / ← araH | trehalose‑6‑phosphate phosphatase, biosynthetic/L‑arabinose ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,982,505 | 0 | G | A | 10.6% | 264.5 / 14.6 | 95 | intergenic (‑118/+49) | otsB/araH | trehalose‑6‑phosphate phosphatase, biosynthetic/L‑arabinose ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/48); new base A (4/6); total (39/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 | |||||||||||
GTTCAGGGGTTTCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACGTACTGCGCGAAAGGAGAAATATT > NC_000913/1982357‑1982652 | gTTCAGGGGTTTCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGc < 2:382743/150‑1 (MQ=255)gTTCAGGGGTTTCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGATTTACTGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGACCAGCCATCCGGTATGGc > 2:918530/1‑150 (MQ=255) ttCTGGGGTTTCGGTTATCGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGGTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCg < 2:155062/150‑1 (MQ=255) tCAGGGGTTTCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTGTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCgg < 2:322179/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAATAGCCAACCGCCATAACGGTTGGc < 1:1339936/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGc > 2:1668852/1‑150 (MQ=255) ggTTTCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGc < 1:1714860/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGCCATAACGGTTGGc < 2:437818/150‑1 (MQ=255) ggTTTCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGCCATAACGGTTGGc < 1:29741/150‑1 (MQ=255) gtatCGGTTAACGGTGCTGTCACCCGGTTCTCCTCCATCTCTTTTCTTATTGTGATGCGCAGAACGCGCATTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCt < 2:751583/147‑1 (MQ=255) ttCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGCCATAACGGTTGGCtgt < 2:482124/150‑3 (MQ=255) tCGGTTCACGGCTCTGTCACCCGGTGCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATTGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGCCATAACGGTTGGCtgtt < 2:1556408/150‑4 (MQ=255) tCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTAtg < 1:588897/150‑1 (MQ=255) cGGTTTACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAATAGCCAACCGCCATAACGGTTGGCtgttc < 2:1235507/150‑5 (MQ=255) cGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTAtgg > 1:411011/1‑150 (MQ=255) tgTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTAtggt > 2:1324285/2‑150 (MQ=255) ggTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGTGGTTGGCTAtggt > 2:159418/1‑150 (MQ=255) gTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTAtggtg > 2:189217/1‑150 (MQ=255) ttAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTAtggtgg < 2:1445001/150‑1 (MQ=255) ttAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTAtggtgg < 1:726224/150‑1 (MQ=255) aCGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGCCGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGaa < 1:1005945/150‑1 (MQ=255) aCGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGaa < 2:868843/150‑1 (MQ=255) aCGGTTCAGGCACCCGGTGCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCGTTACAGACATGTAAGTATCGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGACCAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGaa < 1:169122/150‑1 (MQ=255) gTTGTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTCTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTTAGTATAGACAGTGAGCCGGGGGTCGCCATTTGCAACGTAGTACAGCCAACCGTTATGTCGGTTGGCTATTGTGGGaaaat < 2:689507/150‑2 (MQ=255) cGGGTCCCCTCCAACTCATTTCTTATTGTGGTGCCCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAAttg < 1:143092/150‑1 (MQ=255) cctcctTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑a > 1:817862/1‑150 (MQ=255) ctcctTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGGCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑aa > 2:1173616/1‑150 (MQ=255) tctcTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACTCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGAAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAg < 1:522985/150‑1 (MQ=255) tctcTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAg < 2:1431544/150‑1 (MQ=255) tctcTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAg < 2:1212484/150‑1 (MQ=255) tctTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCa < 2:566862/150‑1 (MQ=255) ctTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCAt < 2:761589/150‑1 (MQ=255) ctTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCAt > 2:618284/1‑150 (MQ=255) tttCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCa > 2:666121/1‑150 (MQ=255) ttCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAg > 1:488622/1‑150 (MQ=255) tCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACTGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGa < 1:945969/150‑1 (MQ=255) ttATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACa > 1:951172/1‑150 (MQ=255) ttGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTg < 2:411011/150‑1 (MQ=255) ttGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTg < 1:451603/150‑1 (MQ=255) ttGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTg < 2:484564/150‑1 (MQ=255) tGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTc < 2:975020/150‑1 (MQ=255) gcgcTGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCg < 1:28807/150‑1 (MQ=255) gcgcAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCg < 2:899816/150‑1 (MQ=255) gcgcAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCg > 1:1527354/1‑150 (MQ=255) cAGAACGCGCTTTACAGACATGTACGTATCGACAGTGTGCCGGGGGTCACCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAACCGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCtt < 2:951121/150‑1 (MQ=255) aCGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCATCGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTg < 2:149503/150‑1 (MQ=255) aCGCGATTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCAATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTg < 2:1255991/150‑1 (MQ=255) cgcTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCtt < 2:601077/150‑1 (MQ=255) gcTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGTGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTg < 1:159418/150‑1 (MQ=255) gcTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTg > 2:1712815/1‑150 (MQ=255) aCAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGCGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTACGCTTTTTGCTTGTAACg > 2:366578/1‑150 (MQ=255) cAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACgg < 1:1094597/150‑1 (MQ=255) cAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCAGTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCTGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACgg > 1:216196/1‑150 (MQ=255) aGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGt < 2:1625884/150‑1 (MQ=255) aCATTTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCg < 2:1519294/150‑1 (MQ=255) tGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAg > 1:1552457/1‑150 (MQ=255) tGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAg < 1:1596128/150‑1 (MQ=255) ttAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGa < 1:1690339/149‑1 (MQ=255) gttaGTATCGACAGTGTGCCGGGGGTCGGCATTTGCCACGTAGAATAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCAGCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGa < 1:1681323/147‑1 (MQ=255) gTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGa > 1:1269524/1‑150 (MQ=255) aGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCa > 1:491463/1‑150 (MQ=255) aGTATAGACAGTGGGCCGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACAGTTATGTCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCa < 1:1308444/150‑1 (MQ=255) gTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCTACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCAc > 2:110979/1‑150 (MQ=255) taaGACAGTGTGACGTGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCACCCGTAATGGCGGTTGGCTATGGTGTGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCg < 2:255931/148‑1 (MQ=255) ataGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCg < 1:1019435/150‑1 (MQ=255) ataGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCg < 1:1025696/150‑1 (MQ=255) taGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGc > 1:1324575/1‑150 (MQ=255) gACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTg > 1:1286798/1‑150 (MQ=255) gACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTg > 1:1630086/1‑150 (MQ=255) gtgtGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCcag > 2:388708/1‑150 (MQ=255) gACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGGGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAgg < 1:1545370/150‑1 (MQ=255) ggTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATAACCGCTGCCAGCAGGATTAAg > 2:971540/1‑150 (MQ=255) gTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGTTTCGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGc > 1:1559394/1‑150 (MQ=255) gTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGc < 2:1652061/150‑1 (MQ=255) gTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGAGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGc < 1:258007/150‑1 (MQ=255) gCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCcgc > 1:25271/1‑150 (MQ=255) aTTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑‑AAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAAc < 1:1668852/150‑1 (MQ=255) ttGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAAcc < 1:1637797/150‑1 (MQ=255) tGCAACGAAGAACAGCCAACAGTTATGGCGGTTGGCTATGTTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACTGTCGAAGATCACCTCTGCCAGCAGGATAAAGCCGCGAAccc > 2:1125197/1‑149 (MQ=255) gCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGaacaac > 1:515436/1‑150 (MQ=255) gCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGAGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCAc > 2:272266/1‑150 (MQ=255) cAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACg > 1:1247872/1‑150 (MQ=255) cAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACg < 2:1527354/150‑1 (MQ=255) aaCGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAGAAAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACg < 2:1662604/150‑1 (MQ=255) aCGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCAACAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCTCGAACCACGTa > 1:1255806/1‑150 (MQ=255) gaagaaCAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTGTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCCGGATGAAGCCGCGAACCACGTACt > 2:1535751/1‑150 (MQ=255) aaCAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACGTACTgcgc < 1:1497270/150‑1 (MQ=255) ataGCCAACCGCCATAACGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGAAGGATTAAGCCGCGAACCACGTACTGcgcg > 1:899163/3‑150 (MQ=255) ataGCCAACCGCCATAACGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCAAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACGTACTGcgcg > 2:94506/3‑150 (MQ=255) cAGCCAACCGTTATGGCTGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACGTACTGCGCGa < 2:1667993/150‑1 (MQ=255) aGCCAACCGCCATAACGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACGTACTGCGCGaa > 2:1377421/1‑150 (MQ=255) gCCAACCGCCATAACGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGGTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGAGTAAGCAGCGAACCACGTACTGAGCGaaa > 2:134254/1‑150 (MQ=255) aCCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACGTACTGCGCGAAAGgag > 1:1400693/1‑150 (MQ=255) tATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACGTACTGCGCGAAAGGAGAAata < 1:1712815/150‑1 (MQ=255) tGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCAGCGAACAACGTACTGCGCGAAAGGAGAAATAtt > 1:1495983/1‑150 (MQ=255) | GTTCAGGGGTTTCGGTTAACGGTTCTGTCACCCGGTTCTCCTCCTTCTCTTTTCTTATTGTGTTGCGCAGAACGCGCTTTACAGACATGTAAGTATAGACAGTGTGACGGGGGTCGCCATTTGCAACGAAGAACAGCCAACCGTTATGGCGGTTGGCTATGGTGGGAAAAAACGCTAAATTGTTGCAG‑AAAAAAGCATCAGACAGTGCGTTTCGCTTTTTGCTTGTAACGGTCGAAGATCACCGCTGCCAGCAGGATTAAGCCGCGAACCACGTACTGCGCGAAAGGAGAAATATT > NC_000913/1982357‑1982652 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |