| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,071,347 | T→A | 7.0% | noncoding (31/195 nt) | isrC → | novel sRNA, CP4‑44; putative prophage remnant |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,071,347 | 0 | T | A | 7.0% | 282.8 / 7.4 | 100 | noncoding (31/195 nt) | isrC | novel sRNA, CP4‑44; putative prophage remnant |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (51/42); new base A (2/5); total (53/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.85e-01 | |||||||||||
Only 100 of 109 total aligned reads displayed.
GGATTTTCTTCTGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTTG > NC_000913/2071198‑2071494 | ggATTTTCTTCTGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTatat < 1:909279/150‑1 (MQ=255) ttttCTTCTGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATatcga < 2:1415604/150‑1 (MQ=255) ttcttcTGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATatcgatc < 1:1087680/150‑1 (MQ=255) cttctGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATAtcgatcga > 2:86658/1‑150 (MQ=255) cttctGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGGTTATAtcgatcga > 1:703870/1‑150 (MQ=255) ttctGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATcgatcgat < 2:170209/150‑1 (MQ=255) ttctGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTATGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGAACGTTTATATcgatcgat > 1:733249/1‑150 (MQ=255) tctGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATa < 1:956391/150‑1 (MQ=255) tctGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGATATAAACGATCGATa < 2:1672750/150‑1 (MQ=255) ctGAACCTGTCTTGACTGATGACCTCCCTCACTCTGAGACAGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGATATAAACGATCGATaa < 2:1072745/150‑1 (MQ=255) ctGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATaa < 2:774829/150‑1 (MQ=255) tGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAg > 2:1147402/1‑150 (MQ=255) tGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAg > 1:554179/1‑150 (MQ=255) tGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGATATAAACGATCGATaaa < 1:1118966/150‑2 (MQ=255) gAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGATATAAACGATCGATaaaa < 2:64989/150‑3 (MQ=255) aaCCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGATATAAACGATCGATaaaat < 1:495334/150‑4 (MQ=255) aCCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGATATAAACGATCGATaaaata > 2:368925/1‑146 (MQ=255) cTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaat < 1:537231/150‑1 (MQ=255) cTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaat > 2:153111/1‑150 (MQ=255) tGTCGTGACTGATGCGCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATATTAGAATATATCGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATTTCGATCGATAAGCtaata > 2:339482/1‑150 (MQ=255) tGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaata < 2:1392021/150‑1 (MQ=255) cGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCtaataata < 1:722244/150‑1 (MQ=255) tGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATCGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATATTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAAc < 2:1232847/150‑1 (MQ=255) aCTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCt < 1:1470628/150‑1 (MQ=255) cTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCtt > 2:314604/1‑150 (MQ=255) gATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTg < 2:1363539/150‑1 (MQ=255) gATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATAGATAAGCTATTAATAACCATTg > 1:728184/1‑150 (MQ=255) aTGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAAAAACCTTTGt > 2:298106/1‑150 (MQ=255) tGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTc < 2:1193046/150‑1 (MQ=255) gCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCa > 2:1085518/1‑150 (MQ=255) ccctccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCat > 1:452046/1‑149 (MQ=255) ccctccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAg > 1:1141032/1‑150 (MQ=255) ccctccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAg < 1:1309589/150‑1 (MQ=255) tccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAATCTAATAATAACCTTTGTCAGTaa < 2:1031547/150‑1 (MQ=255) ccctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAAc < 1:1269431/150‑1 (MQ=255) cctGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATCGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACa < 2:86221/150‑1 (MQ=255) ctctGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGcac < 2:1141032/150‑1 (MQ=255) ctctGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGcac < 2:1444443/150‑1 (MQ=255) ctGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAg > 2:385879/1‑150 (MQ=255) tGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGa > 2:1215597/1‑150 (MQ=255) gAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGAt < 1:1627181/150‑1 (MQ=255) aGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATa > 2:1280776/1‑150 (MQ=255) gTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAATCGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATATCCTTTGTCAGTAACATGCACAGATAc > 1:248326/1‑150 (MQ=255) tCTGCTCACAAAAGCACTGGTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACg < 2:864859/150‑1 (MQ=255) tGCTCACAAACGCACTGTCTTCGTCACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAAAAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGtc < 2:208659/150‑2 (MQ=255) tGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTa > 1:22926/1‑150 (MQ=255) gctaaaaaaaTCACTTTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTACGTGCAATATCTCAATAATATAATAAAAATATCAATATATATTTTATAGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTAc < 1:298366/144‑1 (MQ=255) gCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTAc < 2:519586/150‑1 (MQ=255) cTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACa > 1:116395/1‑150 (MQ=255) cTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCCTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACa > 1:551213/1‑150 (MQ=255) cacaAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGa > 1:1344536/1‑150 (MQ=255) caAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCTCAGATACGTACAGaaa > 2:1187489/1‑150 (MQ=255) aaaGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATTAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGa < 1:1212283/150‑1 (MQ=255) gTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCTATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATAGTTTATATATATCTATAAGCTAATAATAACATTTGTCATTTACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAgg > 1:1147926/1‑150 (MQ=255) ttCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGaa < 2:555918/150‑1 (MQ=255) cGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATATCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTTTTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGaaca < 1:941656/150‑1 (MQ=255) gTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGaacaa > 1:23540/1‑150 (MQ=255) gTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGAAATTCAGGGaacaa > 1:1715120/1‑150 (MQ=255) ttACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGaacaac > 1:474016/1‑150 (MQ=255) cTGTCTCTCTTTTCCGTTCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGa < 1:1503495/150‑1 (MQ=255) cTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGa > 1:1303773/1‑150 (MQ=255) cTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTAAGTAACATGAACAGATACGTACAGAAATACATTCAGGGAACAACAGa > 1:701366/1‑150 (MQ=255) gTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACAATCAGGGAACAACAGAAc > 2:759658/1‑150 (MQ=255) ctctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATa < 1:1142076/116‑1 (MQ=255) ctctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATa > 2:1142076/1‑116 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACcac < 1:1317506/150‑1 (MQ=255) tctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACcac < 1:1215597/150‑1 (MQ=255) ctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTAGAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACcaca > 2:235095/1‑150 (MQ=255) ctctTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACcaca > 2:925586/1‑150 (MQ=255) tCCGTGAAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGATAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAg > 2:579082/1‑150 (MQ=255) aaTAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTcc < 1:1085518/150‑1 (MQ=255) aaTAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTcc < 2:116395/150‑1 (MQ=255) aTAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTccc > 2:1021174/1‑150 (MQ=255) aGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCcac > 2:29318/1‑150 (MQ=255) cTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAg < 2:1612602/150‑1 (MQ=255) cAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAAGCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGcc < 1:384515/150‑1 (MQ=255) ataataGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGAAACGTACAGAAAGACATTCAGGTAACAACAGAAACACAATTCAGAAACTCCCACAGCCgg > 1:80520/1‑150 (MQ=255) aataGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGAc < 1:1147402/150‑1 (MQ=255) ataGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGAcc > 2:1125397/1‑150 (MQ=255) aGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTc > 1:546611/1‑150 (MQ=255) gAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTcc < 2:490287/150‑1 (MQ=255) gAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTcc > 1:1175505/1‑150 (MQ=255) aaTAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCg > 2:782705/1‑150 (MQ=255) tAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGc < 2:916358/150‑1 (MQ=255) aaaaCGATCTATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACACTTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCa < 2:1520995/150‑1 (MQ=255) aaaCGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCAc > 1:1074869/1‑150 (MQ=255) cGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGAGGTCCGGctgtgg < 1:153111/150‑6 (MQ=255) atCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCttt > 2:1593415/1‑150 (MQ=255) atCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCttt < 2:733249/150‑1 (MQ=255) tCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTa > 1:325109/1‑150 (MQ=255) aTTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGAACTGTAACCCTTTACCt > 2:143217/1‑150 (MQ=255) tttATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGc < 2:1075153/150‑1 (MQ=255) cttATCGATCGATATAAACGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGc > 1:740102/2‑150 (MQ=255) ttATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGcc < 1:1599460/150‑1 (MQ=255) atcgatcgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCTCAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCgg > 2:898749/1‑150 (MQ=255) cgatcgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTa > 2:1257699/1‑150 (MQ=255) gatcgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAAATCCCACAGACGTACCTCCGGCACTGAAACCCATTACATGCCGGTAt > 1:345909/1‑150 (MQ=255) cgTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGCCCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCa > 2:1134489/1‑150 (MQ=255) tataTCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGtt < 1:368925/150‑1 (MQ=255) tatCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTtg < 1:1569019/150‑1 (MQ=255) | GGATTTTCTTCTGAACCTGTCGTGACTGATGCCCTCCCTGACTCTGAGTCTGCTCACAAAAGCACTGTTTTCGTTACTGTCTCTCTTGTCCGTGCAATAGCTCAATAATAGAATAAAACGATCAATATCTATTTTATCGATCGTTTATATCGATCGATAAGCTAATAATAACCTTTGTCAGTAACATGCACAGATACGTACAGAAAGACATTCAGGGAACAACAGAACCACAATTCAGAAACTCCCACAGCCGGACCTCCGGCACTGTAACCCTTTACCTGCCGGTATCCACGTTTG > NC_000913/2071198‑2071494 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |