Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 2,168,423 | 0 | A | T | 6.2% | 376.8 / 10.2 | 130 | intergenic (‑117/‑289) | yegR/yegS | uncharacterized protein/phosphatidylglycerol kinase, metal‑dependent |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (58/63); new base T (5/3); total (63/67) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.86e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.17e-01 |
Only 100 of 134 total aligned reads displayed.
ACTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCA > NC_000913/2168274‑2168571 | aCTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTATTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATaa < 1:74117/150‑1 (MQ=255) cTAATTAATGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAAATGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTAAAACATTTCataaataat > 1:1648142/1‑149 (MQ=255) taattaatGATATAGCAGCTATCTTTTTCATCTCACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGt > 1:35598/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |