| Predicted mutation | |||||||
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| RA | NC_000913 | 2,267,748 | G→A | 5.6% | intergenic (+37/‑81) | yeiQ → / → yeiR | putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase/Zn‑stimulated GTPase involved in zinc homeostasis; mutants are cadmium and EDTA sensitive; Zn(2+) binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,267,748 | 0 | G | A | 5.6% | 335.6 / 6.2 | 107 | intergenic (+37/‑81) | yeiQ/yeiR | putative NAD‑dependent D‑mannonate oxidoreductase/Zn‑stimulated GTPase involved in zinc homeostasis; mutants are cadmium and EDTA sensitive; Zn(2+) binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (56/44); new base A (4/2); total (60/47) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.95e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 108 total aligned reads displayed.
GGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTA > NC_000913/2267601‑2267897 | gTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAACGCGGATGAAGCTCACCTTCGTcc > 1:168405/1‑150 (MQ=255) gTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTcc > 1:300368/1‑150 (MQ=255) tgatgaTCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCg > 2:646960/1‑150 (MQ=255) tgatgaTCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCg < 1:1421420/150‑1 (MQ=255) gatgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACCCCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGc > 2:1190496/1‑150 (MQ=255) gatgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGc < 2:55150/150‑1 (MQ=255) atgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGACGAAGGTGAGCTTCATCCGct < 1:1567360/150‑1 (MQ=255) tgatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGctc > 1:800360/1‑150 (MQ=255) gatCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGctct < 2:896403/150‑1 (MQ=255) tCTGCGAGATAACCCGCAGTTTGTGCAGGCCATCGACCAATCGTGGCAACAAAGCGTACAATGCGGCGCACATCAGGCTCTATTAAACCCCCTCATAATTTCACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTcc < 2:1598552/150‑1 (MQ=255) tCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTcc > 1:1449276/1‑150 (MQ=255) cTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTccc > 2:54188/1‑150 (MQ=255) tGCCAGCTAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACACGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTcccc < 1:1431760/150‑1 (MQ=255) 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aGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCATTTCTGCCGTTTTTAGCCAGGATTACCGCTCAGTTTACTTACCAGCGTATTGCGGACACGTTGTGCCCCGGCCCACCCTCATCACCGGTTTTCTCGCCAGCGGGCACACCacgacgcgtc > 2:301186/1‑146 (MQ=255) gCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGAttct > 2:965314/1‑150 (MQ=255) tCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCGTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGAttcttc < 2:329176/150‑1 (MQ=255) tCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGAttcttc < 1:979786/150‑1 (MQ=255) cACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCa > 2:336626/1‑150 (MQ=255) aCCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGCGCCGTTGTGCCCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCAt > 2:72948/1‑150 (MQ=255) ccTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCa < 1:1349898/135‑1 (MQ=255) ccTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCa > 2:1349898/1‑135 (MQ=255) ccTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATc > 2:1414988/1‑150 (MQ=255) ttCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTg < 1:327706/150‑1 (MQ=255) ttCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATAAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTg < 1:493114/150‑1 (MQ=255) gTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTACCGCTCAGTTAACATACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGCCCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCGTCATATGTTa > 2:134937/1‑150 (MQ=255) | GGTGATGATCTGCCAGATAACCCGCATTTTGTGCAGGCCATCGAACAAGCCTGGCAACAAATCGTACAATTCGGCGCACATCAGGCGCTATTAAACACCCTCAAAATTTAACGATTTCTGCGGTTAAAGCGGATGAAGCTCACCTTCGTCCGCTCTCCCCTTCTCTTTTCTGCCTTTTTTAGCCAGGATTAACGCTCAGTTAACTTACCAGAGTATTGCGGAGCCGTTGTGACCAGGACCAACCTCATCACCGGTTTTCTCGGCAGCGGGAAAACCACGTCGATTCTTCATCTGTTA > NC_000913/2267601‑2267897 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |