New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | = 4286343 | 748 (1.260) | 6 (0.010) | 6/268 | NT | 0.81% | coding (1029/1959 nt) | acs | acetyl‑CoA synthetase |
? | NC_000913 | = 4286352 | 741 (1.300) | coding (1020/1959 nt) | acs | acetyl‑CoA synthetase | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 898 total aligned reads displayed.
TCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGATATCACCCGGATGATAATC > NC_000913/4286194‑4286492 | gggTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGcc > 2:2722111/1‑150 (MQ=255) aaTTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACg < 2:2133817/150‑1 (MQ=255) ttGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGg > 1:5712999‑M2/1‑149 (MQ=255) ttGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGg < 1:2288217‑M2/150‑2 (MQ=255) ttGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGg < 1:6379231‑M2/150‑2 (MQ=255) gCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGgcag > 1:367137‑M2/1‑146 (MQ=255) cTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGgcagg < 1:1521873‑M2/150‑6 (MQ=255) cTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGgcagg > 2:1029813‑M2/1‑145 (MQ=255) tCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGc > 2:8344079/1‑150 (MQ=255) gCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGt < 2:9815266/150‑1 (MQ=255) cccACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTCTCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTc < 1:9906134/150‑1 (MQ=255) cccACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTc > 2:8492106/1‑150 (MQ=255) ccACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCg > 1:7374593/1‑150 (MQ=255) cACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCgg < 1:5864252/150‑1 (MQ=255) aCGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGc < 2:6858463/150‑1 (MQ=255) aCCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGtg < 2:6787639/150‑2 (MQ=255) ccGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTg < 2:1416807/150‑1 (MQ=255) cGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTgg > 2:8645536/1‑150 (MQ=255) 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cgacgaACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCaaa > 1:1942592/1‑150 (MQ=255) cgacgaACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCaaa > 1:1282806/1‑150 (MQ=255) aaCGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCa > 1:1081176/1‑150 (MQ=255) aCGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAg > 2:1147417/1‑150 (MQ=255) cggtcggtGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGc < 1:5570673/150‑1 (MQ=255) 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cTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTa < 2:2861646/150‑1 (MQ=255) tGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAg > 2:781534/1‑150 (MQ=255) gATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGa > 1:4220551/1‑150 (MQ=255) gATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGa < 2:9072213/150‑1 (MQ=255) ttGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGATATCa < 1:6642945/150‑1 (MQ=255) 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cccgtatggcgcaggtggtggacaagcatcaggtcaatattctctataccgcacccacggcgatccgcgcgctgatggcggaaggcgataaagcgatcgaaggcaccgaccgttcgtcgctgcgcattctcggttccgtgggcgagccaa > 1:3889740‑M1/1‑1 (MQ=255) | TCCGGGTTAATTGGCTCGCCCACGGAACCGAGAATGCGCAGCGACGAACGGTCGGTGCCTTCGATCGCTTTATCGCCTTCCGCCATCAGCGCGCGGATCGCCGTGGGTGCGGTATAGAGAATATTGACCTGATGCTTGTCCACCACCTGCGCCATACGGGCAGGCGTCGGCCAGTTGGGTACGCCTTCAAACATCAGCGTGGTCGCACCGCAGGCCAGCGGGCCGTACAGCAAGTAACTGTGTCCGGTCACCCAGCCCACATCGGCGGTGCACCAGTAGATATCACCCGGATGATAATC > NC_000913/4286194‑4286492 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |