New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_000913 | 4321620 = | 734 (1.240) | 8 (0.010) | 4/264 | NT | 1.2% | coding (77/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit |
? | NC_000913 | 4321659 = | 657 (1.170) | coding (38/453 nt) | phnG | ribophosphonate triphosphate synthase subunit | |||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 812 total aligned reads displayed.
CGGCAAAAAAACGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGCGCACGCACAGCAGCGGC > NC_000913/4321510‑4321808 | ggCAAAAAAACGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa < 1:9372955/150‑1 (MQ=255) ggCAAAAAAACGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa < 2:8436729/150‑1 (MQ=255) ggCAAAAAAACGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa < 2:8186271/150‑1 (MQ=255) ggCAAAAAAACGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGGGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGa > 1:43602/1‑150 (MQ=255) gCAAAAAAACGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGAGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGAc < 2:7301640/150‑1 (MQ=255) aaaaaCGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATcc > 1:6302833/1‑150 (MQ=255) aaaCGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAg < 2:2147399/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCt > 2:2719718/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTg < 1:6820169/150‑1 (MQ=255) ttCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTg > 2:501402/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGGGAGGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCCGCCGGTTGGCGGTGCGCCAGCACGGACCTCCAGTGCTg > 2:3583773/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTAAGCGGCGCGGATAACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTg > 1:1388647/1‑150 (MQ=255) cGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGc < 2:6639327/150‑1 (MQ=255) gCCGGCGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCg < 1:1817964/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCgg < 2:4441079/150‑1 (MQ=255) ccGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCGCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGGTGGCTGTGCGCCCGCACGGACATCCAGTGCTGGCgg > 1:4506239/1‑150 (MQ=255) ccGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCACATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGGTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCgg > 1:3658336/1‑150 (MQ=255) gTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTc > 1:5217667/1‑150 (MQ=255) 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cgcCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTg < 1:6992370/150‑1 (MQ=255) ccTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCa < 2:9508041/150‑1 (MQ=255) gAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTc > 1:3740055/1‑150 (MQ=255) ctCTGGACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCAGAGTCGGCGGTGCTGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAg < 2:4089009/149‑1 (MQ=255) aTCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAg > 1:3969351/1‑150 (MQ=255) 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ttCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACggtg < 1:5632143/150‑1 (MQ=255) ttCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACggtg > 1:199273/1‑150 (MQ=255) cAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACggtggt < 1:9302717/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGtt > 2:1292073/1‑150 (MQ=255) ccGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTaa < 1:6044429/150‑1 (MQ=255) 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gcacgGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGCGCACGCAcagca < 1:829610‑M2/145‑1 (MQ=255) acgGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGCGCACGCACagcagc < 1:4769517‑M2/147‑1 (MQ=255) | CGGCAAAAAAACGTTCGCCGGTGCCGCCCATCCGCGCCTGAATCTGTACCAGGCCAGTTTCAGCGGCGCGGATCACCTCATAGTCGGCGGTGATGTTTAGCGCGTTCAGGCGTGCTGCCAGTTCAGCCGGTTGGCTGTGCGCCAGCACGGACATCCAGTGCTGGCGGGTCGCGGTATCTGCGTGCATTCAGTGCTCCATAGTGAATTCAATCATGTCGGCGCGCGTCAGGCTGACGGAGTACTCCGCCGGGCTGCTTTCACCGTCACGGTGGTTAAGGGTGCGCACGCACAGCAGCGGC > NC_000913/4321510‑4321808 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |