| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,481,820 | 0 | C | A | 10.1% | 1378.3 / 14.6 | 476 | M119I (ATG→ATT) | emrY | putative multidrug efflux system |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (229/180); new base A (2/64); total (231/245) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.23e-18 | |||||||||||
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Only 100 of 481 total aligned reads displayed.
AAGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAACCCCTGAACGACTCTAAAAAATATCAGCACATCAAGATTGGTCGATAGGCTACACATTAATGAAGACAGCGAAAAAAAAGTGACTGAAAGTAAAAATAATCTTAATTCGCCTATTCTTTGTGCCAACCTGCCAGTAACAGGGA > NC_000913/2481671‑2481968 | aaGTTATCACAAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGcc < 2:2424058/150‑1 (MQ=255) tATCACAAATAGCCCCGCCCAATCTCGGCCCACATATGGGAGGGATAATCCGGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATATTTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTa < 1:1889816/150‑1 (MQ=255) cacaAATATAACCGCCCAATATCGGCCCACATATCGGAGCGATAATCACGGTCATTGACCATAATGCCAGAGCAAATGTTCTTTTTTCTGGCGGATAATTCCTTAATAATAAACTCTGTGACAGTGGAATTAACGGCCCCGCCATTAAcc < 2:2368562/150‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |