New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 3620350 | NA (NA) | 4 (0.020) | 3/266 | NT | 100% | coding (1159/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
? | NC_000913 | = 3620425 | 0 (0.000) | coding (1234/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAtcacca‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3620202‑3620350 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCACCACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTAA < NC_000913/3620425‑3620271 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT < 2:1098520/150‑1 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 1:467591/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 1:8452/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 2:2240985/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 1:36468/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 1:3165907/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 2:3283627/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 2:3592524/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 2:1112343/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 2:4067657/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 2:833712/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCAT > 2:2162554/1‑150 TTACGATGATAAATACCGGGGCCGGAGGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTCTGAGAAAGACCGCAT > 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2:1196705/1‑150 GATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCATCACC > 1:928389/1‑150 GATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCATCACC > 2:2261495/1‑150 GATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCATCACC > 1:4112803/1‑150 GATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCATCACC > 2:307460/1‑150 GATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCATCACC > 2:307478/1‑150 GATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCATCACC > 2:3434781/1‑150 GATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCATCACC < 1:2250771/150‑1 GATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCATCACC > 1:1445231/1‑150 GATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCATCACC > 2:594254/1‑150 GATGATAAATACCGGGGCCGGATGGAGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCAGTATGAGAAAGACCGCATCACC > 2:307455/1‑150 ATGATAAATACCGGGGCCGGATGGTGGCGCACCGTCACACGGGCCGGCCGGAAATCCGTTACCGTTACGACAGCGACGGGCGGGTGACAGAACAGCTAAACCCGGCAGGCTTAAGCTACACGTATCGGTATGAGCAAGACCGCATCACCA > 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2:4442/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:3839058/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 2:156874/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:1215698/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:1665626/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:1686488/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 2:2211181/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:2993023/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:3399537/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:3838743/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGGGTAGCTTAAGCCTGCCGGGGTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCGGTCGTA > 2:2375656/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATAAGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTA > 1:1442430/1‑150 CACCCGCTTCAGCCCGGCGTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGGGTCGCTTAAGCCTGCCGGGTGTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGGCGTA > 2:2191743/1‑150 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTAA < 1:741898/150‑1 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTAA < 2:3728190/150‑1 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTAA < 2:3774203/150‑1 ACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTAA < 1:1745525/150‑1 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NC_000913/3620202‑3620350 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TCACCACCCGCTTCAGCCCGGCTTCGCCCTGCGTGTGCAGCACTTCACGGCGGTCCAGGCTGTCGGTGATGGTGATGCGGTCTTTCTCATACTGATACGTGTAGCTTAAGCCTGCCGGGTTTAGCTGTTCTGTCACCCGCCCGTCGCTGTCGTAA < NC_000913/3620425‑3620271 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |