Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,959,481 | C→G | 7.2% | intergenic (+36/+51) | ilvC → / ← ppiC | ketol‑acid reductoisomerase, NAD(P)‑binding/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C (rotamase C) |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,959,481 | 0 | C | G | 7.2% | 725.6 / 39.5 | 209 | intergenic (+36/+51) | ilvC/ppiC | ketol‑acid reductoisomerase, NAD(P)‑binding/peptidyl‑prolyl cis‑trans isomerase C (rotamase C) |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (72/119); new base G (5/10); total (80/129) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.08e-01 |
Only 100 of 220 total aligned reads displayed.
AACGGGCAACTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGA > NC_000913/3959332‑3959629 | aaCGGGCAACTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCcac < 2:2761784/150‑1 (MQ=255) aCGGGCAACTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCcaca < 1:4045893/150‑1 (MQ=255) gggCAACTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCCACCCGCTCCCACagg > 1:181638/1‑150 (MQ=255) gggCAACTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGAGGCCCACACCCCGACCCTCTCCCACcgg > 1:2275574/1‑150 (MQ=255) ggCAACTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCACACCCCCACCCACACCCCCcggg > 2:2045503/1‑150 (MQ=255) gCAACTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACaggga < 2:3400129/150‑1 (MQ=255) aaCTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACagggaga < 1:2179138/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTCTATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCTGtgggagagg < 1:3128185/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCTGtgggagagg < 1:2779757/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCTGtgggagagg < 1:3452005/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACagggagagg < 1:3577231/150‑1 (MQ=255) cTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACagggagagg < 1:1944309/150‑1 (MQ=255) tGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGTAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCACCCCCacggagaggg > 1:2756913/1‑150 (MQ=255) tGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGTAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCACTCCCACagggagaggg > 1:678639/1‑150 (MQ=255) cGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCACCCACagggagggggag > 1:2845959/1‑150 (MQ=255) tGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGAGGCCCGCACCCCCACCCACTCCCCCAGGGAGAGGGAGaa > 1:3290975/1‑150 (MQ=255) gATGTGAACGTAGCGATTCGCAGCCATGCGATTTAGCAGGTTGGTAAGAAACTGCGGGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGGGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCTCAGGGAGAGGGAGaaa < 1:2547981/150‑1 (MQ=38) gATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGGCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGaaa < 1:2472034/150‑1 (MQ=255) gATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGaaa < 2:732369/150‑1 (MQ=255) gATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGATATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGaaa < 2:344850/150‑1 (MQ=255) aTGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCCCAGGGAGAGGGAGaaaa > 1:647360/1‑150 (MQ=255) aTGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCACTCCCACAGGGAGAGGGAGaaaa > 1:2502356/1‑150 (MQ=255) aaCGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGAGGCCCACACCCCCACCCTCTCCCACAGGGAGTGGGAGTAAacaata > 1:912745/1‑147 (MQ=255) cGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCaa < 2:639297/150‑1 (MQ=255) tCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTgctc < 2:4081701/150‑1 (MQ=255) gCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCt < 1:316020/150‑1 (MQ=255) gCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCt < 1:3670370/150‑1 (MQ=255) gCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCGAACCCCGAACCACTCCCACCGGGAGAGGGCGAAAACACACAAGGCCATCTccg > 2:3202670/1‑149 (MQ=255) cAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTg < 1:2085521/150‑1 (MQ=255) gCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGga < 2:2418844/150‑1 (MQ=255) gCCATGCGAGTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGga < 2:3139092/150‑1 (MQ=255) cggCGAGTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCGAGATGACAGATAGGACCCGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGTCCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTGCTCCTGGAGaa < 2:3760077/148‑1 (MQ=37) aTGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTCTATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGATAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGaa < 2:3859384/150‑1 (MQ=255) aTGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGaa < 2:2222287/150‑1 (MQ=255) aTGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGaa < 1:3419410/150‑1 (MQ=255) tGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAg < 2:2460094/150‑1 (MQ=255) tGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGAGGCCCACACCCCCACCCACACCCACACGGGGAGGGGGAAAACACACAAGGCCATATCCAGGAGAAg > 1:3196114/1‑150 (MQ=255) cGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCCCACCACTACCACAGGGAGAGGGAGAAAAAAATCAAGGCCATCTCCTGGAGAAGGc > 2:1699001/1‑150 (MQ=38) cGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGAGGGCCTCAACCCCAACCAAAACCACAGGGAGAGGGTGAAAAAACACAATGCCTTGTACTggtggatgc > 1:304091/1‑143 (MQ=255) aTTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCAGGAGAAGGCCt < 2:429690/150‑1 (MQ=255) aTTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCAGGAGAAGGCCt < 2:1502751/150‑1 (MQ=255) ttGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCGCACCCCCCCCCACACCCACACGGAGAGGGAGCAAACACACAATGCCATAAACGGGAGAAGGccgt > 2:1530458/1‑148 (MQ=255) tGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCCACCCTCAACCACAGGGCGGGGGGGAAAAAAAACAAGGCCATATCCGGGTGAAGGCCATg > 2:78546/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCCCCCCGACCCTCTCCCCCCGGGAGAGGGAGAAAACCCGCAAGGCCATCTCCGGGAGAAGGCCTTGc > 2:4018899/1‑150 (MQ=255) gAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCCACCCACTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCCAGGGCTTCTCCGGGAGAAGGCCTTGc > 1:3358449/1‑150 (MQ=38) gCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTa < 1:3442952/150‑1 (MQ=255) taAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCACCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCGCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCg > 2:1001146/1‑150 (MQ=255) taAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCACAACCCGACCCTCACCCCCACGGTGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCATCACCTGGCGCAGGCCGTGCAATTAGTTGCg > 2:1994458/1‑150 (MQ=255) aaGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCCCCCCACACCCACACGGTGGGGGGGAAAACAATCAATGCCATCTCCAGGAGAAGGCCGTGCTAATAGTTGCgg > 1:1624102/1‑150 (MQ=255) aaGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGAGGCCCACACCCCGACCCACACCCAACGGGAGAGGGAGAAAAAACACAAAGCCAAAACCAGGAGAAGGCCGTGCTATTAGTTGCgg > 1:3756721/1‑150 (MQ=255) aaaCTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGATGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCGCACCCCCAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCAGGAGAAGGCCGTGCTATTAGTTGCGGTAc > 2:1834080/1‑150 (MQ=38) tGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGAGGGCCGCACCCCCCCCCCCGCCCACACGGAGAGGGGGGAAAAACAAAAAGCCAACTCCAGGAGCAGGGCGTGGTATTATTTTGGGTTCAGCa > 1:11826/1‑150 (MQ=255) gcgcGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCAc < 2:2087584/150‑1 (MQ=255) gCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTGCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTaa < 2:1532517/150‑1 (MQ=255) cTATATGACAGATATGACACGTATTGCTGGTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAat < 1:2788/150‑1 (MQ=255) cTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAat < 1:1181954/150‑1 (MQ=255) tataTGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAatg < 2:1276452/150‑1 (MQ=255) atGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAatgatg < 1:3562092/150‑1 (MQ=255) aCAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGa < 2:1827662/150‑1 (MQ=255) aCAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTAACCCCGACCCAAACCCACAGGGGGAGGGAGAAAAAAAACAATGCCATCACCAGGAGAAGGCCGTGCTAATAGTTTCGGTACAGCACCATAaagattttt > 1:2935372/1‑146 (MQ=255) aGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCCCCCCGACCCTCTCCCACCGGGGGAGGGAGAAAACACACAAGGCCGTCTCCTGGAGAAGGCCGTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCGTAAAGATGTGata > 2:3005658/1‑150 (MQ=255) atatGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTGCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATc < 2:881348/150‑1 (MQ=255) atatGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGAGGCCCCCCCCCCCACCCGCTCCCCCCGGGCGAGGGCGAAAACACCCAACGCCGTCGCCGGGAGACCGCCATGCGATTAGGTGCGGTACAGCACCGTAATGAGGGGATATc > 2:2998894/1‑150 (MQ=255) aTTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCGCACCCCCACCCACTCCCACAGGGAGAGGGCGAAAACAAGCAAGGCCATCTCCTGGAGAAGGCCATGCTAATAGTTGCGGTACAGCACCAAAAAGATGTGATATCCGCACAGGgtg > 2:3325345/1‑150 (MQ=255) cTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATTGCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGTGTGGGTGTAAAAACTGAAGGGCTTGTGCTGGGGTAGGCCTTGGTTTTAGTTTCGGTTCAGCACCTTTATGATTTGTTTTACGTAGTGGGtgtggg > 2:1633363/1‑148 (MQ=255) cTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCACACCCCGACCCACTCCCACAGGGAGAGGGACAAAACACACAAGGCCCTCTCCGGGGGAACGGCGTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCAAAATGATGTGCTATCCCAACACGGTGTGcc > 2:2292224/1‑149 (MQ=255) ttGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCg < 1:2192009/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCggg < 2:3968104/150‑1 (MQ=255) gCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCggg < 1:2366200/150‑1 (MQ=255) ggTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCg < 2:1019199/150‑1 (MQ=255) ggTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCg < 1:1329407/150‑1 (MQ=255) aGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCgg < 2:2009098/150‑1 (MQ=255) aGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCgg < 2:2521284/150‑1 (MQ=255) gTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGc < 1:1937221/150‑1 (MQ=255) gTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGc < 1:93044/150‑1 (MQ=255) gTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTAGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGc < 1:3088013/150‑1 (MQ=255) tGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCGTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCt < 1:52930/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCa < 1:152787/150‑1 (MQ=255) gcgcTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACCGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCGTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCa < 1:2399990/150‑1 (MQ=255) tGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTAc < 1:1691753/150‑1 (MQ=255) aTGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACCGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCGGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGCACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCg > 2:1064472/1‑150 (MQ=255) aTGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCg > 2:1064515/1‑150 (MQ=255) aTGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCg < 1:4112411/150‑1 (MQ=255) cTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCCAGGCCTTCTCCTGGAGCAGGCCTTGCTCTTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCCGCGGGCCGGTCGGCTCCAGGACCGGACag > 2:1862720/1‑149 (MQ=255) cTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGACCTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACaa > 2:1161310/1‑150 (MQ=255) tCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGCGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCGTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTCTTAGTTGCGGGACCGCACCGTCATGATGTGATATCCGCCCGGGGTGTGCAGCGGGCCGGGCGGCCCCAGTCCCGGACAag > 2:3292761/1‑150 (MQ=255) cACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAaga < 1:1753997/150‑1 (MQ=255) cACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCGGCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAaga < 1:1057129/150‑1 (MQ=255) cccGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGaa < 1:3971140/150‑1 (MQ=255) cccGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCATGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGaa > 2:3580141/1‑150 (MQ=255) cGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGaaaa < 1:807903/150‑1 (MQ=255) cGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGaaaa < 2:2527443/150‑1 (MQ=255) tcccTCTCCCTGTGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAAcc > 2:2603372/2‑150 (MQ=255) ctctCCCTGTGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACt > 1:237078/1‑150 (MQ=255) ctctCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGACCTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACt > 1:2866755/1‑150 (MQ=255) tctcCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTCTTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGAGGTGATAGCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGGCAAGAGAAAACCACtt > 1:2647367/1‑150 (MQ=255) ccACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATc > 1:2238860/1‑150 (MQ=255) acaGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGa > 1:3885918/1‑150 (MQ=255) acaGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGa > 1:182384/1‑150 (MQ=255) acaGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGa > 1:545800/1‑150 (MQ=255) | AACGGGCAACTGCGTGATGTGAACGAAGCGATTCGCAGCCATGCGATTGAGCAGGTAGGTAAGAAACTGCGCGGCTATATGACAGATATGAAACGTATTGCTGTTGCGGGTTAAGTGCGCGCTGATGCCCTCACCCCGACCCTCTCCCACAGGGAGAGGGAGAAAACACTCAAGGCCTTCTCCTGGAGAAGGCCTTGCTATTAGTTGCGGTACAGCACCTTAATGATGTGATATCCGAACTGGGTGTGCAGCGGGCCGGTCGGCTCCAGTACCGGACAAGAGAAAACCACTTTATCGA > NC_000913/3959332‑3959629 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |