| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,086,965 | G→T | 6.8% | intergenic (+116/‑37) | fdhD → / → yiiG | formate dehydrogenase formation protein/DUF3829 family lipoprotein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,086,965 | 0 | G | T | 6.8% | 651.5 / 4.7 | 213 | intergenic (+116/‑37) | fdhD/yiiG | formate dehydrogenase formation protein/DUF3829 family lipoprotein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (81/110); new base T (20/2); total (101/112) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.54e-05 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 216 total aligned reads displayed.
GTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATAAAAAAGCCGAAACAGAAACGCTCCCGCCTGCCAATAGTCA > NC_000913/4086817‑4087114 | ttATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTc < 1:1165778/150‑1 (MQ=255) ttATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTc < 1:1185257/150‑1 (MQ=255) ataCCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATACATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCAc < 1:687595/150‑1 (MQ=255) taCCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCAct < 1:2329096/150‑1 (MQ=255) ccATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCActctc > 2:2095817/1‑150 (MQ=255) ccATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTAActctc > 2:811480/1‑150 (MQ=255) aTCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCtt > 1:1727992/1‑150 (MQ=255) cGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGGAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTGTTATc < 1:2443131/150‑1 (MQ=255) cGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATc < 2:3541313/150‑1 (MQ=255) cGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGAGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTAATTTATTATTTTAAATATATTATc > 2:1948682/1‑150 (MQ=255) gCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCt < 1:982529/150‑1 (MQ=255) cGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCtatat < 1:2942850/150‑1 (MQ=255) gTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCtatata < 2:1894176/150‑1 (MQ=255) tttGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTatatat > 2:1373908/1‑150 (MQ=255) tttGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCACATATCGatatat > 1:320814/1‑150 (MQ=255) ttGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATAtt > 2:2703968/1‑150 (MQ=255) aGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTtat < 1:555657/150‑1 (MQ=255) aGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTtat < 2:1218421/150‑1 (MQ=255) aGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTtat < 1:290656/150‑1 (MQ=255) gCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTGTTTTTTGATTTATTATTTTGAATATATTATAtttatatttata > 2:3474382/1‑150 (MQ=255) gCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTtata < 2:860150/150‑1 (MQ=255) gCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTtata < 1:2850324/150‑1 (MQ=255) cAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATTTATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGTCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATaa < 2:2464854/150‑1 (MQ=255) cAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATaa < 2:4099242/150‑1 (MQ=255) aattaattAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTAATTTATTATGTTGACTCTCTGATCTATATATTTATAAg > 1:3341958/1‑150 (MQ=255) attaattaAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAgg < 2:3710022/150‑1 (MQ=255) attaattaAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAgg < 2:1982681/150‑1 (MQ=255) attaattaAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTATTTTTTAATTTATTTTTTTGACTCTCTTATATATATATTTATaatg > 1:3126045/1‑148 (MQ=255) ttaaAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTGTTCTTTTTTGATTTATTATGTTGACTCTCTTATGTATATATTTATAAGGC‑AAtt > 1:181950/1‑150 (MQ=255) aaaTAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTaaa < 2:415172/150‑1 (MQ=255) aaaTAAGTCCTGCGAAATAGAATAAAGTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCTTTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATTTTTATAAGGC‑AATTaaa < 1:3366104/150‑1 (MQ=255) aaTAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTGTTTTTTTATTTTTTATGTTGACGGTGTTATCTTTATATTTTTTATGG‑AATTTAAt > 1:3881553/1‑150 (MQ=255) aaTAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTGTTTTTTAATTTATTATTTTGACACTCATATGTATATATTTATAAGGC‑aaataaat > 2:20359/1‑150 (MQ=255) aaTAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATTTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAAt > 2:175217/1‑150 (MQ=255) aaTAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAAt > 2:2418021/1‑150 (MQ=255) aaTAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAAt < 2:873111/150‑1 (MQ=255) aaTAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTAATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAAt > 1:1386153/1‑150 (MQ=255) aaTAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTGTTCTTTTTTAATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑CATTAAAt > 1:1386020/1‑150 (MQ=255) aaGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGaa < 2:1096071/150‑1 (MQ=255) aGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGaaa < 1:1754363/150‑1 (MQ=255) gTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGaaaa < 1:4085093/150‑1 (MQ=255) gTCCTGCGAAATATATTAAAGTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGaaaa < 1:743876/150‑1 (MQ=255) tCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCAATCTATTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAg > 2:2996267/1‑150 (MQ=255) tCCTGCGAAATATATAAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTTTAAGGC‑AATTAAATGAAAAg > 1:1028102/1‑150 (MQ=255) tGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTAATTTATTATGGTCCCGCACGTAACGATATATTTATAAGGCAAATAAAATAAAAAGGa > 1:3473080/1‑150 (MQ=255) tGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTATTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATATATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGaa > 1:2384501/1‑150 (MQ=255) tGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTGTTCATTTTTAATTTATTATGGTCACTATCATATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGaa > 1:1966120/1‑150 (MQ=255) gCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAAt < 1:2327060/150‑1 (MQ=255) aaaTATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATTTTAAATCTCTTATATATATATTTATAATGC‑AATTAAATGAAAAGGAAtttt > 1:2239589/1‑149 (MQ=255) aaaTATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTATTTTTTAATTTTTTATTTTGAATATCTTTTATATATATTTTTAATGC‑CATTAAAATAAAAggcaagta > 1:2786417/1‑144 (MQ=255) aaTATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATttat < 1:3567957/150‑1 (MQ=255) atTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTATTTTTTCATTTATTATTTTCACTCTCGTATGTATATATTTATAAGGC‑AAATAAATGTAAAGGAATTtattatat > 1:909198/1‑148 (MQ=255) atTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTATTTTTTAATTTTTTATGTTCACTATCTTATCTATATATTTATAATGG‑AATTAAATGAAAAGTAATTTATTATCt > 1:909116/1‑150 (MQ=255) aaTTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTATTTTTTCATTTTTTTTGTTGAATCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AAATAAATTTAAAGGAATTTATTATATTACg > 1:3744170/1‑150 (MQ=255) aTTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTAATTTATTATTTTAACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATTAAAAGGAATTTATTATAttaagc > 2:1631122/1‑146 (MQ=255) cAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGTGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCtatt < 1:459210/150‑1 (MQ=255) cAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCtatt < 2:3918360/150‑1 (MQ=255) gACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATtata < 1:1218169/150‑1 (MQ=255) ttATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTc < 1:2991810/150‑1 (MQ=255) tCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCca < 1:768866/150‑1 (MQ=255) tCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCca < 1:769224/150‑1 (MQ=255) cATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCcat < 1:2012035/150‑1 (MQ=255) gTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGTGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AAATAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTc > 2:3019690/1‑150 (MQ=255) gTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGTAAATGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTc > 2:3747013/1‑150 (MQ=255) tattattttattTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTc < 1:579009/150‑1 (MQ=255) tattattttattTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTc < 1:4005778/150‑1 (MQ=255) tattattttattTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTACGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTc > 2:3370765/1‑150 (MQ=255) tattattttattTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCAATATCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAATGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGGCGCCATCATGTACCTCGGTc > 2:3700383/1‑150 (MQ=255) ttttatttATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACg < 2:3299920/150‑1 (MQ=255) ttatttatAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTGTCTTATGTATATATTTTTAAGGC‑AATTAAATGGAAAGGGATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGGCATCATGTCCCTGGGTGTGGCggg > 2:3984407/1‑150 (MQ=255) ttatttatAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTAATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACggg > 2:1700070/1‑150 (MQ=255) ttatAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTtgt < 1:3251576/150‑1 (MQ=255) ttatAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTtgt < 2:3783592/150‑1 (MQ=255) ttatAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCAAGTCCCTCGGTCTGACGGGTtgt > 2:262151/1‑150 (MQ=255) tataAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTATTTTTTAATTTATTATTTTCACAATATTATCTATATATTTATAATGC‑AATTAAAAGAAAAGGAAATTATTATATTACGCTATTATATTCGCCAACCTGTCCCTCGGTCTGACGGGGtgtg > 2:728095/1‑150 (MQ=255) ataAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAATGC‑AATTAAATGAAAATGAATTTATTATATTCCGCTATTATATTCGCCAACATGTCCCACGGTCTGACGGGTTGtga > 2:2219972/1‑150 (MQ=255) ataAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGtga < 2:1276854/150‑1 (MQ=255) ataAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGtga < 2:4031875/150‑1 (MQ=255) ataAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGtga < 2:1438750/150‑1 (MQ=255) ataAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGtga < 2:181950/150‑1 (MQ=255) ataAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATCATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGtga < 2:1561147/150‑1 (MQ=255) taAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGtgat < 1:2511590/150‑1 (MQ=255) aaCAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTATTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATTAAAAGGAATTTATTATATTACGCTATTATATTAGCCATCATGTCCCTCGGTCTGTCGGGTTGtgatga > 2:2948486/1‑150 (MQ=255) aCAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTACGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTgatgat > 2:569734/1‑150 (MQ=255) aCAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTAATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTgatgat > 2:3502191/1‑150 (MQ=255) cAAAATGCGTGTGGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATATTACGCTATTATAGTCGCCAACATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATa > 2:3131590/1‑150 (MQ=255) cAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATa < 2:3850035/150‑1 (MQ=255) cAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCAATTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATa > 2:3042103/1‑150 (MQ=255) aaaaTGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCAATTATTATGTTCACTCTCGTATCTATATAGTTATAAGGC‑AAATAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATTTCCCACGGTCTGACGGGTGGTGATGATaa > 2:2820399/1‑150 (MQ=255) aaTGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATaaaa < 2:3499360/150‑1 (MQ=255) tGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATaaaaaa < 2:440219/150‑1 (MQ=255) cGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATAAAAAAGc < 1:2552493/150‑1 (MQ=255) gtgtAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATAAAAAAGcc < 2:648913/150‑1 (MQ=255) tgTGGCTTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATAAAAAAGCCGaaa < 1:1445844/149‑1 (MQ=255) ttCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATAAAAAAGCCGAAACAGAAACGc > 2:3603428/1‑150 (MQ=255) tCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGTAATTTATTATCTTCCGATATTATAGTCGCCATCTTGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATTATAAAAAAGCCGAAACAGAAACGCt < 1:2268558/150‑1 (MQ=255) ttttttCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATAAAAAAGCCGAAACAGAAACGCTcc > 2:634570/1‑150 (MQ=255) tttATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATAAAAAAGCCGAAACAGAAACGCTCCCGCCTGcc > 2:3348779/1‑150 (MQ=255) tattatGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATAAAAAAGCCGAAACAGAAACGCTCCCGCCTGCCaa > 1:1902220/1‑150 (MQ=255) ttatGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATAAAAAAGCCGAAACAGAAACGCTCCCGCCTGCCAATa > 2:3140831/1‑150 (MQ=255) | GTTTATACCCATCCGCAGCGTTTGAGCAATTAATTAAAATAAGTCCTGCGAAATATATTAAATTGCAGGACTTATTCATTTCGTGAATTTTATTATTTTATTTATAAACAAAATGCGTGTAGTGGCGTTTTCTTTTTTCATTTATTATGTTCACTCTCTTATCTATATATTTATAAGGC‑AATTAAATGAAAAGGAATTTATTATCTTCCGCTATTATAGTCGCCATCATGTCCCTCGGTCTGACGGGTTGTGATGATAAAAAAGCCGAAACAGAAACGCTCCCGCCTGCCAATAGTCA > NC_000913/4086817‑4087114 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |