New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 696863 = | 26 (0.240) | 11 (0.110) +GAAGAAACAATC |
9/254 | NT | 17.0% | intergenic (‑33/+2) | glnW/glnU | tRNA‑Gln/tRNA‑Gln |
? | NC_000913 | = 697134 | 92 (0.860) | intergenic (‑1/+379) | metT/asnB | tRNA‑Met/asparagine synthetase B |
ACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACC > NC_000913/696725‑697011 | aCTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGt < 2:179816/150‑1 (MQ=255) gTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTc < 1:451347/150‑1 (MQ=255) cttgATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATC‑AAAACCGGTGcc < 2:1399537/147‑1 (MQ=255) cTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCCATACCCGGGCGGTGACCCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGGATCAACAACCGGTGc > 1:1633901/1‑150 (MQ=37) ttCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACAGGGCGGTGAACCGCTTAATCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACAAGGGAAATCCGGAATCAAAAACCGGTGCCATAc > 1:1388165/1‑150 (MQ=37) tcggAATGCCGGAATCATAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATg < 1:1270634/84‑1 (MQ=255) tcggAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATg > 2:1270634/3‑86 (MQ=18) gacgggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGTAATGCACGTATCAAAAACCGGTGCATTACCGCTTGGCGa < 2:451347‑M1/70‑1 (MQ=255) ggattcgaacctgtgaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATAcc > 2:1818533‑M1/77‑150 (MQ=255) ggTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATCGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGCAATGCCGGTATCAAAAACCGGGGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCaa > 1:1612075/1‑149 (MQ=255) cAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCATTACCGCTTGGCGCTACCCCATCCGTa > 1:1608346/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAAGACGGCGGTTACCCGCTAAGTCTAAGAAGCGCGCGGCGGTACCTCGAATCCAAACAGGGACAGCCGCGATCAAATTCAGCTTCAATACCGATTGGCGCTACCCCATcaatac > 2:1705671/1‑145 (MQ=255) aaaaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAAAAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACGCGGGAATGCCGGAATCAACAGCCGGTGCGTGACCGCTAGGCGATACCCCATCCGTAc > 2:1734769/1‑150 (MQ=37) aaaaCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATATCCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGCTGGCTGGGGTACCTGGCTTCGAAACAGGGAATGCCGGTTTCAAAAACCGGTGCCTTACAGCTAGGCGATACCCCATCCGTACa > 1:1317443/1‑150 (MQ=38) gaccccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGACTGCCGGTATCAAAAACCGCTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATACGAACAACg < 2:1094268‑M1/88‑1 (MQ=255) cGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGACCCGCTTAGTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGGATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTAGAACGCt > 1:1573538/1‑150 (MQ=255) ccatcattatgagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAACCCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATACGGACAACgctga < 2:1226797‑M1/92‑3 (MQ=255) cTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAAACGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCAATCCGTACAACGCTTTCTgg > 1:15333/1‑150 (MQ=255) ttctgttgtgatctaaataactgagctacgtagcgagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATg > 2:273757‑M1/49‑150 (MQ=255) gagtgatgtgctctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAACCAGACAACGCTTTCGCGtgaaag < 2:355282‑M1/102‑3 (MQ=255) gtcGATACCACAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGTCGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGc < 1:1236477/148‑1 (MQ=255) tccctaaccaactgcgctacgtagcgagaattcttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAg > 2:1415312‑M1/40‑150 (MQ=255) ccccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGc > 2:1452770/1‑150 (MQ=255) ctaaccaactgagctacgtagccagattgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCGTTACCGCTTGGCGATACCCCAAACGCACAACGCTTACTCGGGAATGGTGCGggagtcg < 2:269431‑M1/114‑4 (MQ=255) ccAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCga > 2:137598/1‑150 (MQ=255) aaactgcgcttcgtagcgagtatgtttcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACt > 2:51253‑M1/32‑150 (MQ=255) tttgtagccattttgtttattaGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGc > 2:686324‑M1/23‑150 (MQ=255) gTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCGGGATTCGCACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGca > 1:1125034/1‑150 (MQ=255) tgtagcgagattgattatacGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGcac > 2:772690‑M1/21‑150 (MQ=255) agatccGCTTACTCGAAGATGATGCTTGGGGTACCTTGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGcac < 1:561340/146‑1 (MQ=25) gAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGcaca > 2:1358903/1‑150 (MQ=255) gAACCGCTCACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGcacc > 2:379300/1‑149 (MQ=255) aCCGCTTACTCGAAGTAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACAcc < 1:849574/150‑1 (MQ=255) aCCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGTGAAAGCCGGTATCATATACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCGTCCGTTCTTCGCTGGCTGGTGATTGGTGCGGGAGGCGAGACGTGAACTCGCACAcc > 2:867721/1‑150 (MQ=21) aCCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACAcc > 1:945205/1‑150 (MQ=255) cTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTgc > 1:648663/1‑150 (MQ=255) cTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATTCCCCCTCCGTACACCGCGGTCTGGGGTATGGTGCGGGCGGCGAGCCGGGCACTCGCCCCCCTTgcggcg > 2:891215/1‑150 (MQ=18) cGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGCCTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGcc > 2:1561678/1‑150 (MQ=255) gaagaaGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTTAACTCGCACACCTTGCGGCGCCa < 1:1452770/150‑1 (MQ=255) tcttcGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATACGAACCCCGCTTTCTGGTGAAAGGTGCGGGACTCGAGACTTGAACTCGCAACCCTGgcggcgcaac < 2:1720441‑M1/145‑4 (MQ=255) aattcGATGGCTGGGGTAGCTGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAg > 2:1227009‑M1/6‑150 (MQ=255) agaagaTGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCTCACACCTTGCTGCGCCAGa > 2:1705755/1‑150 (MQ=255) cGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAAcc > 1:1720441‑M1/2‑150 (MQ=255) | ACTGAGCTACGTAGCCAGATTGTTTCTTCGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCAATAACCGGGCGGTGAACCGCTTACTCGAAGAAGATGGCTGGGGTACCTGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCGATACCCCATCCGTACAACGCTTTCTGGTGAATGGTGCGGGAGGCGAGACTTGAACTCGCACACCTTGCGGCGCCAGAACC > NC_000913/696725‑697011 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |