Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 848,356 | 0 | T | A | 7.2% | 306.9 / 8.6 | 106 | intergenic (‑352/+52) | glnH/dps | glutamine transporter subunit/Fe‑binding and storage protein; stress‑inducible DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (55/43); new base A (6/2); total (61/45) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.62e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 106 total aligned reads displayed.
TTAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTCGATAAACCACAGGAATTTATCCAGGTCGCGAGACGCGGCGGTCAGGATATCTGCGGTGTCGTCATCTTTCGCTTCGCC > NC_000913/848208‑848503 | ttAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTc > 2:918160/1‑150 (MQ=255) ttAGCGTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTc < 1:886993/150‑1 (MQ=255) gTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGaa < 1:1251331/150‑1 (MQ=255) 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tgatgaAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCttt < 2:1824728/150‑1 (MQ=255) attaaaaaaCTATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGTATACAAAAAATATACTTAATCAGCTGCAGCTAGCAGATGGATGCACTAAATACGTGCGTTGAGGTGGGCTGAAAAACAAAACGGCTTCCTGACAGGAGGCCGttttgt < 2:103095/147‑3 (MQ=255) aaaaCAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCggg < 1:226355/150‑1 (MQ=255) aaaaCAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCggg < 2:554129/150‑1 (MQ=255) aaaCAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGt > 2:1811751/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |