Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 848,362 | 0 | A | G | 6.8% | 301.3 / 9.5 | 103 | intergenic (‑358/+46) | glnH/dps | glutamine transporter subunit/Fe‑binding and storage protein; stress‑inducible DNA‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/41); new base G (5/2); total (60/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.96e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.16e-01 |
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTCGATAAACCACAGGAATTTATCCAGGTCGCGAGACGCGGCGGTCAGGATATCTGCGGTGTCGTCATCTTTCGCTTCGCC > NC_000913/848213‑848503 | gTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGaa < 1:1251331/150‑1 (MQ=255) tAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAg > 2:1788823/1‑150 (MQ=255) aaaCCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGcc < 1:690446/150‑1 (MQ=255) 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ctGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTCGATAAACCACAGGAATTTATCCAGGTCGCGAGACGCGGCGGTCAGGATATCTGCGGTGTCGTCATCTttcgcttcgc < 1:1300790/150‑1 (MQ=255) tGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTCGATAAACCACAGGAATTTATCCAGGTCGCGAGACGCGGCGGTCAGGATATCTGCGGTGTCGTCATCTTTCGCTTCGcc > 2:1458667/1‑150 (MQ=255) | GTAAAACCTGATGAAAAAACAATCTTTATGTAACGATTGTGTGATGATGTGGATACAAAAAATTTACTTAATCAGCTGGAGATAGCAGATGGATGCACTAAATAAGTGCGTTGAGGTGGGCTGCAAAACAAAACGGCCTCCTGTCAGGAAGCCGCTTTTATCGGGTACTAAAGTTCTGCACCATCAGCGATGGATTTATTCGATGTTAGACTCGATAAACCACAGGAATTTATCCAGGTCGCGAGACGCGGCGGTCAGGATATCTGCGGTGTCGTCATCTTTCGCTTCGCC > NC_000913/848213‑848503 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |