| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 1,181,761 | 0 | A | G | 6.0% | 349.6 / 9.8 | 116 | intergenic (‑36/+22) | ymfA/potD | DUF3592 family inner membrane protein/spermidine/putrescine ABC transporter periplasmic binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (66/43); new base G (2/5); total (68/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.24e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
AATCGCGTCTTTGCTATAGGTGAACTGGTTATAAAAGACAACAACAGAAATGAGGATCAGTACCAGACCGATACCGAGGAATATACGAAAGAAAACTTTACTGTCCTGACTCATTAGCCACATCCTTGCTAACTAAAAAACGGGCGGTAATACCACCGCCCGCTTGCTGAATTAACGTCCTGCTTTCAGCTTCTGATAATACTCTTCATAAATGCTGCTGGCTGCGCCAACGTCATTCTGCCATTCGCCATTTTTAATGGTTTCAGCATCCGGGTAGAGTGTTTTATCGTTCGCCACT > NC_000913/1181612‑1181909 | gcgTCTTTGCTATAGGTGAACTGGTTATAAAAGACAACAACAGAAATGAGGATCAGTACCAGACCGATACCGAGGAATATACGAAAGAAAACTTTACTGTCCTGACTCATTAGCCACATACTTGCTAACTAAAAAACGGGCGGTAATacc > 1:1610099/1‑150 (MQ=255) gTCTTTGCTATAGGTGAACTGGTTATAAAAGACAACAACAGAAATGAGGATCAGTACCAGACCGATACCGAGGAATATACGAAAGAAAACTTTACTGTCCTGACTCATTAGCCACATCCTTGCTAACTAAAAAACGGGCGGTAATaccac < 1:1513133/150‑1 (MQ=255) tttGCTATAGGTGAACTGGTTATAAAAGACAACAACAGAAATGAGGATCAGTACCAGACCGATACCGAGGAATATACGAAAGAAAACTTTACTGTCCTGACTCATTAGCCACATCCTTGCTAACTAAAAAACGGGCGGTAATACCAccgc > 1:40623/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |