Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 209,171 | A→G | 5.4% | N184S (AAC→AGC) ‡ | accA → | acetyl‑CoA carboxylase, carboxytransferase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 209,171 | 0 | A | G | 5.4% | 375.5 / 8.7 | 129 | N184S (AAC→AGC) ‡ | accA | acetyl‑CoA carboxylase, carboxytransferase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (67/53); new base G (4/3); total (72/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.41e-01 |
Only 100 of 133 total aligned reads displayed.
CAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGCCGGAAGGTTGTG > NC_000913/209024‑209320 | cAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGCACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAccc > 1:227280/1‑150 (MQ=255) cAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCTGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGACATTGCACGCAAcc > 2:286377/1‑150 (MQ=255) aGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCCCCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCt > 1:82354/1‑150 (MQ=255) aGCGCCAGAAGGTTACCGAAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGAGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCt > 1:1196014/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTg > 1:965456/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTATAAGATGCCTATCATCCCCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTg > 2:1088898/1‑150 (MQ=255) gcCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCCCCTTTATCGACACCCCGGGGGCATATCCTGGAGTTGGCGCAGAAGCGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCg > 2:1007206/1‑150 (MQ=255) gAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACCCCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGaa > 1:1288027/1‑150 (MQ=255) gAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCCGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGaa < 2:1465973/150‑1 (MQ=255) aaGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGaaa < 2:1350031/150‑1 (MQ=255) ggTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAGGTTGCGTGCAATg < 1:818674/150‑1 (MQ=255) gTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTTCACGCAGGTTGCGTGCAATgg < 1:1254893/150‑2 (MQ=255) gTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTTCACGCAGGTTGCGTGCAATgg < 1:631809/150‑2 (MQ=255) ccGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCg > 1:805266/1‑150 (MQ=255) cGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTAACGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGc > 2:826921/1‑150 (MQ=255) aaaGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTc < 2:677056/150‑1 (MQ=255) gCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATCCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGGCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGc < 2:1006213/150‑1 (MQ=255) gCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTAcc > 1:1278710/1‑150 (MQ=255) gTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCgg < 1:770318/150‑1 (MQ=255) tCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCACCCTGCGTGAAATGTCACGCCTCGGCGTCCCGGt > 1:1635119/1‑150 (MQ=255) cTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTa > 2:1479993/1‑150 (MQ=255) cTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCCACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTa > 2:955803/1‑150 (MQ=255) gATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGt > 2:1478684/1‑150 (MQ=255) aTGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGtt < 1:310658/150‑1 (MQ=255) tGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGttt > 2:1665533/1‑150 (MQ=255) gCAAATGGCTGAAGGCTTTAAGATGCCTATCATCCCCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTg < 2:1431594/150‑1 (MQ=255) gCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTg < 2:1345569/150‑1 (MQ=255) cAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGt > 1:1608300/1‑150 (MQ=255) cAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGt > 1:1019936/1‑150 (MQ=255) cAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCAATCATCACATTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGAGGTCTGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGAGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGGAGTTAGt > 1:871580/1‑150 (MQ=255) ggCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCACTGGGGATTATCCTGGCGTGGGAGAAGAAGAGCTTGGTCAGTCTGAAGACATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTAGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGt > 1:1280066/1‑150 (MQ=255) gAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCC‑GGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCg > 1:1773431/1‑150 (MQ=255) aaCGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACAACCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCTTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCg < 2:1734234/150‑1 (MQ=255) ttAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAg < 2:1800742/150‑1 (MQ=255) tAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTAACCTAGCGTGGGCGCAGAAGAGAGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCCTGAAATGTCTCGCCTAGGCGAACCTGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAgg > 1:883013/1‑150 (MQ=255) gCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTc > 2:1362992/1‑150 (MQ=255) cTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTg > 2:171920/1‑150 (MQ=255) atcatcACCTTTATCGCGACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGc < 1:145918/150‑1 (MQ=255) tcatcaCCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGTGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCg < 1:1592955/150‑1 (MQ=255) tcatcaCCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCg < 1:251212/150‑1 (MQ=255) catcaCCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCgg < 1:1774277/150‑1 (MQ=255) tcaCCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTg < 1:664128/150‑1 (MQ=255) caCCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTTTCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTgc > 1:224819/1‑150 (MQ=255) aCCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGGCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTgcg < 2:1447773/150‑1 (MQ=255) ccTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTgcgc > 2:855102/1‑150 (MQ=255) ccTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGCCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGATGGTGGTTCTGGCGGTgcgc > 2:659904/1‑150 (MQ=255) tttATCGTCACCCCGGGGGCTTATGCTGGCGGGGGCGCAGAAGAGCGGGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGTCGGTGCGCTg < 1:505655/150‑1 (MQ=255) tttATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCCGGGGCGCAGAAGAGCGTTGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGGGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTg < 2:142027/150‑1 (MQ=255) ttATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGGACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTgg < 2:525834/150‑1 (MQ=255) ttATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTgg > 1:221274/1‑150 (MQ=255) aaTCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGGCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGc < 1:1502563/149‑1 (MQ=255) aTCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACTAAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTCGTTCTGGCGGTGCGCTGGCg < 2:1764973/150‑1 (MQ=255) aTCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGGAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCg > 2:1095386/1‑150 (MQ=255) cGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGTAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGAt > 1:127396/1‑150 (MQ=255) gACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGAtt > 1:885115/1‑150 (MQ=255) gACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGAtt > 1:378302/1‑150 (MQ=255) cacCCCGGGTGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTgg < 2:849020/150‑1 (MQ=255) cacCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTgg > 2:22344/1‑150 (MQ=255) cacCCCGGGGGCGTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTgg < 1:1102531/150‑1 (MQ=255) cccccGGGGGCTTATCCTGGCGGGGGCGCAGAAGAGCGGGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGc < 1:321424/149‑1 (MQ=255) ccccGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCg < 2:798448/150‑1 (MQ=255) ccccGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCg < 2:1621444/150‑1 (MQ=255) ccGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGGCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGGCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTg < 1:1171809/150‑1 (MQ=255) ggggCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGc < 2:652057/150‑1 (MQ=255) gggCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTTAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCg < 2:955940/150‑1 (MQ=255) ggCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGa > 1:1001762/1‑150 (MQ=255) ttATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATaa > 2:159343/1‑150 (MQ=255) tCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTTGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGt < 1:1112505/150‑1 (MQ=255) ccTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTg > 2:1720216/1‑150 (MQ=255) cTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGa > 1:1464314/1‑150 (MQ=255) gggCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATAtgct < 1:1448549/150‑1 (MQ=255) ggCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATAtgctg > 1:519679/1‑150 (MQ=255) gcgcAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCGACCTGCGTGAATTGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGGGATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGGGATTGGCGTGGGCGAGAAAGTGAATAtgctgc > 1:76220/1‑150 (MQ=255) gcgcAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATAtgctgc < 2:745284/150‑1 (MQ=255) cgcAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCa > 2:1201484/1‑150 (MQ=255) cgcAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGAGAAAGTGAATATGCTGCa > 2:1801940/1‑150 (MQ=255) gcAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCaa < 1:733731/150‑1 (MQ=255) gcAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCaa > 2:424580/1‑150 (MQ=255) aagaGCTTGCTCAGTCTGAAGCCATTGCATTCAAGATGCGTGAAATGTCTCTCATAGTCGTACCGGTAGTTTGTAAGGTTATCGGTGAAGGTTTTTCTGTCGGTGCTCTTGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTTAATATGCTGCAATACa < 1:286377/150‑1 (MQ=255) agagCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAg < 1:1277390/150‑1 (MQ=255) gTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCt > 1:1049009/1‑150 (MQ=255) tCAGTCTGAAGCCATTGCTCTCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGGTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTc < 1:442735/150‑1 (MQ=255) gTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGt > 1:288030/1‑150 (MQ=255) gTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGt < 1:1478684/150‑1 (MQ=255) gTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGt > 2:652606/1‑150 (MQ=255) cTGAAGCCAGTGCACGCAACCTGCGGGAAATGTCCCGACTCCGCGTACCGGTAGTTTTTTCTGTTATCTGTGAAGGTGGTTCTGGCGTTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATTAAGTGAATATGCTGGAATACAGCACCTATTCCGTTa < 2:273728/150‑1 (MQ=255) gcgagacATTTCACGCAGGTTGCGTGCAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTTGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTAt > 2:68024/7‑150 (MQ=255) gAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTAta > 2:386198/1‑149 (MQ=255) aGCCATTGGACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGTAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTAtctc < 1:11960/150‑1 (MQ=255) aGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTCTTCCGTTAtctc > 1:1752566/1‑150 (MQ=255) gacATTTCACGCAGGTTGCGTGCAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCAGTTATCTCg > 1:1568317/3‑150 (MQ=255) gCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCg > 2:673162/1‑150 (MQ=255) cATTTCACGCAGGTTGCGTGCAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGcc > 1:695450/1‑150 (MQ=255) cATTTCACGCAGGTTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACATCACCTATTACGTTATCTCGcc > 2:125720/1‑150 (MQ=255) cATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGcc < 1:1020471/150‑1 (MQ=255) cATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGcc < 2:1288027/150‑1 (MQ=255) aTTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCTGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGGGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGCCg < 2:917588/150‑1 (MQ=255) tGCACGAAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCCGTAGTTTGTACGGTTATCGGTCAAGGTGGTTCTGGAGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATCCTGCAATACAGCAACTATTCCGTTATCTCGCCGGa > 2:832678/1‑150 (MQ=255) cACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACCGCACCTATTCCGTTATCTCGCCGGAAg > 1:1001353/1‑150 (MQ=255) aCCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTTGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGCCGGAAGGTtgtg < 2:1196014/150‑1 (MQ=255) | CAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGCCGGAAGGTTGTG > NC_000913/209024‑209320 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |