Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 209,173 | C→T | 5.3% | L185L (CTG→TTG) | accA → | acetyl‑CoA carboxylase, carboxytransferase, alpha subunit |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 209,173 | 0 | C | T | 5.3% | 403.0 / 6.8 | 131 | L185L (CTG→TTG) | accA | acetyl‑CoA carboxylase, carboxytransferase, alpha subunit |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (67/56); new base T (4/3); total (71/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.99e-01 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
CAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGCCGGAAGGTTGTGCG > NC_000913/209024‑209322 | cAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGCACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAccc > 1:227280/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTg > 1:965456/1‑150 (MQ=255) gcgcCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTATAAGATGCCTATCATCCCCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTg > 2:1088898/1‑150 (MQ=255) 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aCCTGCGGGAAATGTCTCGCCGCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCATCTATTCCGTTATCTCGCCGGAAGGTtgtg < 2:1533393/150‑1 (MQ=255) ccTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGCCGGAAGGTTGTGc < 2:1608300/150‑1 (MQ=255) | CAGCGCCAGAAGGTTACCGCAAAGCACTGCGTCTGATGCAAATGGCTGAACGCTTTAAGATGCCTATCATCACCTTTATCGACACCCCGGGGGCTTATCCTGGCGTGGGCGCAGAAGAGCGTGGTCAGTCTGAAGCCATTGCACGCAACCTGCGTGAAATGTCTCGCCTCGGCGTACCGGTAGTTTGTACGGTTATCGGTGAAGGTGGTTCTGGCGGTGCGCTGGCGATTGGCGTGGGCGATAAAGTGAATATGCTGCAATACAGCACCTATTCCGTTATCTCGCCGGAAGGTTGTGCG > NC_000913/209024‑209322 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |