Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 1,568,915 | 0 | G | A | 9.8% | 350.0 / 19.4 | 123 | intergenic (‑92/+39) | yddW/gadC | liprotein, glycosyl hydrolase homolog/glutamate:gamma‑aminobutyric acid antiporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (52/57); new base A (10/2); total (63/60) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.02e-02 | |||||||||||
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Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
CAACTAGTATCGCTGGTCTTCTAATCGTTAATTTCTTGTTTCGGGAGCAGATATCCATATGTGCTGGTTTCCGGTAAACAGATGTGCGCTCATTCTCGTACTTATCCCCGTTAAGTCAATACGACAGCAAGCACGAAAAAGGGAGCGATGAATTATCGCTCCCTTGTCTTATAACCATTCAGACATGGTTAGTGTTTCTTGTCATTCATCACAATATAGTGTGGTGAACGTGCACGCGGGTGCAGGAAGAAGTGACCTTTTGGTGCGTTCTGACTGTTGATTGGCTCCAGAGTGACGCC > NC_000913/1568766‑1569064 | cAACTAGTATCGCTGGTCTTCTAATCGTTAATTTCTTGTTTCGGGAGCAGATATCCATATGTGCTGGTTTCCGGTAAACAGATGTGCGCTCATTCTCGTACTTATCCCCGTTAAGTCAATACGACAGCAAGCACGAAAAAGGGAGCGATg > 2:1532007/1‑150 (MQ=255) cAACTAGTATCGCTGGTCTTCTAATCGTTAATTTCTTGTTTCGGGAGCAGATATCCATATGTGCTGGTTTCCGGTAAACAGATGTGCGCTCATTCTCGTACTTATCCCCGTTAAGTCAATACGACAGCAAGCACGAAAAAGGGAGCGATg > 2:834288/1‑150 (MQ=255) aaCTACTATCGCTGGTCTTCTAATCGTTAATTTCTTGTTTCGGGAGCAGATATCCATATGTGCTGGTTTCCGGTAAACAGATGTGCGCTCATTCTCGTACTTATCCACGTTAAGTAAAAACGACAGAAAGCACGAAAAAGGGAGCGATGa > 1:88599/1‑150 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |