Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 103,614 | A→T | 5.2% | K154* (AAG→TAG) | ftsQ → | divisome assembly protein, membrane anchored protein involved in growth of wall at septum |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 103,614 | 0 | A | T | 5.2% | 323.0 / 3.3 | 105 | K154* (AAG→TAG) | ftsQ | divisome assembly protein, membrane anchored protein involved in growth of wall at septum |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/48); new base T (4/2); total (55/50) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACGCT > NC_000913/103465‑103762 | cGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCagca < 1:1708289/150‑1 (MQ=255) ttAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAgg < 2:1769743/150‑1 (MQ=255) aaGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTTGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTg > 2:85948/1‑150 (MQ=255) gCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCt < 1:784411/150‑1 (MQ=255) aGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTc < 2:1237593/150‑1 (MQ=255) ggTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGt > 1:503565/1‑144 (MQ=255) ggTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGt < 2:503565/144‑1 (MQ=255) gAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCTGCTTGCTGGTGcgttctgg < 1:1497490/150‑8 (MQ=255) cgCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATg < 2:138802/149‑1 (MQ=255) aGCGTCAGAAATCAGTGGGCTTATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGGGGAATGATCAACATATGGTAGACTCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATg < 2:450800/150‑1 (MQ=255) gCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGATTATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGc < 2:969484/150‑1 (MQ=255) gCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCATCATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGc < 1:78099/150‑1 (MQ=255) gCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGc < 2:1010943/150‑1 (MQ=255) gCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGc < 2:478416/150‑1 (MQ=255) gCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGc > 1:316646/1‑150 (MQ=255) aGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTAt > 2:1372331/1‑150 (MQ=255) gAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATg > 2:555705/1‑150 (MQ=255) aGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCTCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGcc < 1:522201/150‑1 (MQ=255) gCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGccc > 1:1328260/1‑150 (MQ=255) cAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCg < 1:655507/150‑1 (MQ=255) aGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTTCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCgg < 1:1729506/150‑1 (MQ=255) ggCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAg < 2:909889/150‑1 (MQ=255) ccTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAATGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATTCTGTATGGCCCGGAAGGc > 1:128980/1‑150 (MQ=255) ccTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGc > 1:1173937/1‑150 (MQ=255) atgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcg > 1:196163/1‑150 (MQ=255) atgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcg < 1:1383170/150‑1 (MQ=255) tgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcgc > 1:180007/1‑150 (MQ=255) tgaATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAgcgc < 2:338362/150‑1 (MQ=255) aTTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCaa > 2:1073988/1‑150 (MQ=255) gAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGa < 2:1561535/150‑1 (MQ=255) gATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAgt > 2:1181822/1‑150 (MQ=255) aTTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAgtg < 2:1368891/150‑1 (MQ=255) tCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCa < 2:642243/150‑1 (MQ=255) ggTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCTAGCAGGTGATTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAggg > 2:1319385/1‑150 (MQ=255) ggTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAggg < 2:1328260/150‑1 (MQ=255) gTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGc > 1:1699962/1‑150 (MQ=255) tGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGGAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTa > 2:1087429/1‑150 (MQ=255) gAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTAt > 2:1011034/1‑150 (MQ=255) atGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATcgcg > 1:1280114/1‑150 (MQ=255) tgtgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGa < 1:492524/150‑1 (MQ=255) gtgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGaa > 2:1484130/1‑150 (MQ=255) tgCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGaaa < 1:1657853/150‑1 (MQ=255) cGATTGCGCTGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATgg < 1:105914/150‑1 (MQ=255) ttGCGCGGTGGAATGAGCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCTGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGc < 1:510809/150‑1 (MQ=255) tGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTg > 2:1456413/1‑150 (MQ=255) tGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTg > 2:647287/1‑150 (MQ=255) ggAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTgg < 1:8126/150‑1 (MQ=255) gAATGATCAACATATTGTAGCCGCGGAATGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACTCACCAGCAAGCAGGTGCGTCCAATGCTGGATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGc < 1:768100/150‑1 (MQ=255) gAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGc < 2:1206834/150‑1 (MQ=255) gAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGc < 1:776896/150‑1 (MQ=255) aaTGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCa < 2:1021493/150‑1 (MQ=255) tGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCaaa > 1:498812/1‑150 (MQ=255) tGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCaaa > 1:1575865/1‑150 (MQ=255) cAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGAc > 1:1374025/1‑150 (MQ=255) aCATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAg < 2:21662/150‑1 (MQ=255) aCATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAg < 2:1206583/150‑1 (MQ=255) cATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGa < 1:734296/150‑1 (MQ=255) tatGGTAGACGCGGAAGGAAATTCCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCATAGGACAGAtt > 1:1740693/1‑150 (MQ=255) tatGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGAtt > 1:1751567/1‑150 (MQ=255) tatGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGAtt > 1:1733708/1‑150 (MQ=255) tAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTActc > 1:405752/1‑150 (MQ=255) tgACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTActct < 2:1121954/149‑1 (MQ=255) aGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTActct > 2:1543818/1‑150 (MQ=255) gACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCGTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCCGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTg < 1:924563/150‑1 (MQ=255) gcgGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTgaag < 1:1372331/150‑1 (MQ=255) ggaaggaaATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGGTTCGAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTgaagga < 2:631475/150‑1 (MQ=255) aggaaATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGACgc > 1:925543/1‑150 (MQ=255) aggaaATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAgc > 1:1395908/1‑150 (MQ=255) gaaATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAgcgg > 2:951596/1‑150 (MQ=255) tACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGAt > 2:1389332/1‑150 (MQ=255) aCCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATg > 2:942488/1‑150 (MQ=255) aCCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATg > 2:409386/1‑150 (MQ=255) aCCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTGCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGTCTATCGCGAAATGGGGCAGATGTTGGCAAATGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATg < 2:1646341/150‑1 (MQ=255) cTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGAc > 1:1805411/1‑150 (MQ=255) cTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGAGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGAc > 2:127012/1‑150 (MQ=255) ggccgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcggc < 1:1069586/149‑1 (MQ=255) gccgccTCAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCGGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGGTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcggcg < 1:450763/150‑1 (MQ=255) gccgccAGAACGCACCAGCAAGCAGCTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCgcggcg < 1:991576/150‑1 (MQ=255) ccgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGTGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAATCGGCGATGACCGCGCGGCGt > 2:1687686/1‑150 (MQ=255) ccgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGt > 1:68733/1‑150 (MQ=255) cgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGtt > 2:1306593/1‑150 (MQ=255) cgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGtt > 1:740284/1‑150 (MQ=255) cgccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGtt > 1:1544543/1‑150 (MQ=255) gccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTc > 1:1410084/1‑150 (MQ=255) gccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTc > 1:1408446/1‑150 (MQ=255) gccAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTc > 2:602850/1‑150 (MQ=255) ccAGAACGCACCATCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTTTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGATCGCGCGGCGTTcc < 2:340974/150‑1 (MQ=255) ttggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCt > 1:1639194/7‑150 (MQ=255) ggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATTAAGTGTTCCAGGGCTATCGCGAAATTCGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTAGGAAGGAAGCGGAGATGACCGCGCGGCGTTCCTgg > 2:1102668/5‑150 (MQ=255) ggaagCACCTGCTTGCTGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTgg > 1:24311/5‑150 (MQ=255) gAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTgg < 1:1073988/150‑1 (MQ=255) aaCGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGc < 2:1173937/150‑1 (MQ=255) aaCGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGc < 1:1681018/150‑1 (MQ=255) cGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAg > 1:1500775/1‑150 (MQ=255) cACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGtt > 1:842885/1‑150 (MQ=255) ccAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTgc > 2:1275716/1‑149 (MQ=255) ccAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGATGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGAGGCGTTCCTGGCAGTTGa > 1:550402/1‑150 (MQ=255) agcaagcaGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGATCCTGGCAGTTGACg > 2:859147/1‑150 (MQ=255) gcaagcaGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACGc > 2:528354/1‑150 (MQ=255) caagcaGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACGCt > 1:1099423/1‑150 (MQ=255) | CGTGGATTAAGCAGGTGAGCGTCAGAAAGCAGTGGCCTGATGAATTGAAGATTCATCTGGTTGAATATGTGCCGATTGCGCGGTGGAATGATCAACATATGGTAGACGCGGAAGGAAATACCTTCAGCGTGCCGCCAGAACGCACCAGCAAGCAGGTGCTTCCAATGCTGTATGGCCCGGAAGGCAGCGCCAATGAAGTGTTGCAGGGCTATCGCGAAATGGGGCAGATGCTGGCAAAGGACAGATTTACTCTGAAGGAAGCGGCGATGACCGCGCGGCGTTCCTGGCAGTTGACGCT > NC_000913/103465‑103762 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |