Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,679,644 | A→T | 5.3% | M30L (ATG→TTG) | ydgI → | putative arginine/ornithine antiporter transporter |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,679,644 | 0 | A | T | 5.3% | 299.5 / 4.5 | 104 | M30L (ATG→TTG) | ydgI | putative arginine/ornithine antiporter transporter |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (53/45); new base T (4/2); total (57/47) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.87e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.03e-01 |
Only 100 of 105 total aligned reads displayed.
ATTTTTATGCGTTTTGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCCGCGAAGG > NC_000913/1679496‑1679789 | aTTTTTATGCGTTTTGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAatat > 1:1116456/1‑150 (MQ=255) tttATGCGTTTTGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggc < 2:1069843/150‑1 (MQ=255) ttATGCGTTTTGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggcg > 1:1072387/1‑150 (MQ=255) aTGCGTTTTGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggcggc < 2:1473032/150‑1 (MQ=255) aTGCGTTTTGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATggcggc < 2:408222/150‑1 (MQ=255) tGCGTTTTGCCTTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCa > 2:1597509/1‑150 (MQ=255) gTTTTGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCCATATTTTGCGGCAgac < 2:446668/150‑3 (MQ=255) ttttGCCTTAATAATTATTCTACTTATCAAGATTTAATCTCTGCATATCCATGGAATAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGATTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTg < 2:326318/150‑1 (MQ=255) ttttGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTg > 2:1430819/1‑150 (MQ=255) tttGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGc < 1:1803240/150‑1 (MQ=255) cccTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGc > 1:1747897/1‑150 (MQ=255) tatttattCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAACAGAAACTGTGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCGGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGgca < 2:1468685/150‑1 (MQ=255) atttattCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAACCTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGgcag < 2:1140779/150‑1 (MQ=255) atttattCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGAGGCAGTTGCCAGCCCGgcag > 2:199817/1‑150 (MQ=255) cttcttATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAGCTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCt > 2:1348475/1‑150 (MQ=255) cttcttATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCt > 1:173791/1‑150 (MQ=255) cttcttATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCt > 2:1732341/1‑150 (MQ=255) cttcttATCACGTTATAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCt < 2:126459/150‑1 (MQ=255) tacatATCACGTTATAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGAATGAGCGCACTCACCGCGCAGTTATTAACCTCAATGATGGGCGCGGGTGTTTACAGTCTCCCGCAAAAAATGGCGGCAGTTGACAGCCCGGCAGCACTGCTc > 2:812988/5‑150 (MQ=255) tATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAACACTGCTCATCg > 2:1823153/1‑150 (MQ=255) tCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCggg > 1:708113/1‑149 (MQ=255) cACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCt > 1:403485/1‑150 (MQ=255) cGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTgg < 1:546595/150‑1 (MQ=255) gTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTggg < 2:1560662/150‑1 (MQ=255) ttttAATCACTGGATATCTATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTgggg < 1:764799/150‑1 (MQ=255) ttttAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTgggg < 1:522186/150‑1 (MQ=255) tttAATCACTGGATATCGATGGAAAAGATACTGGGACTGAGCGGACTCACCGCGCTGGGATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGt < 1:1135612/150‑1 (MQ=255) tttAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGt < 2:1332745/150‑1 (MQ=255) aCTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTg > 2:1696409/1‑150 (MQ=255) cTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTgg > 1:1595721/1‑150 (MQ=255) atatCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCt < 2:418985/150‑1 (MQ=255) atatCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCt < 1:1012276/150‑1 (MQ=255) tatCTATGTAAAAGAAACTGGGACTTAGCGCACTAAGCGCGCTGTTATTAATCTCACTGCTGGGCTCGCGTGTATTCAGTCTGCCGCAAAAAATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGTCGCTg < 2:336163/150‑1 (MQ=255) tatCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTg < 1:1234487/150‑1 (MQ=255) tCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGc > 1:271792/1‑150 (MQ=255) cGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCa > 1:369851/1‑150 (MQ=255) gAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGTCATTTTa > 2:211149/1‑150 (MQ=255) aaaaGACACTGGGATTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTAt < 2:645219/150‑1 (MQ=255) aGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATTGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGc > 2:655175/1‑150 (MQ=255) aGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGc > 1:4287/1‑150 (MQ=255) aGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGc > 2:1307873/1‑150 (MQ=255) gAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCt > 2:1795479/1‑150 (MQ=255) gAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCt > 2:1009668/1‑150 (MQ=255) gAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATAGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCt > 2:286833/1‑150 (MQ=255) aCTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGc > 2:1135033/1‑150 (MQ=255) gggACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCtt < 1:35386/150‑1 (MQ=255) aCTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGc < 2:820065/150‑1 (MQ=255) cTGAGCGCACTCTCCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTATCAGTCTGCCGCAAAATAAGGCTGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATAACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGcc < 2:1179541/150‑1 (MQ=255) cTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTCAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGcc < 1:649119/150‑1 (MQ=255) cTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGcc < 2:644905/150‑1 (MQ=255) cTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGcc > 2:75574/1‑150 (MQ=255) gcgcACTCACCTCGCTGGTATTAAGCTCAATGATGGGCGCGGGTGTTATCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCAACGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGACAttg > 1:1654070/1‑148 (MQ=255) gcgcACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGc < 2:1637397/150‑1 (MQ=255) gcgcACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGc > 1:554537/1‑150 (MQ=255) gcgcACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGc < 2:1745938/150‑1 (MQ=255) cgcACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCt > 2:1248387/1‑150 (MQ=255) cgcACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCt < 1:1288212/150‑1 (MQ=255) gcACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTg < 2:1582413/150‑1 (MQ=255) cACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGa > 2:598491/1‑150 (MQ=255) cACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGa > 1:247392/1‑150 (MQ=255) cTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATc < 2:626522/150‑1 (MQ=255) ctccGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCGGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCATATTATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGGACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCTTGCTGATCCt < 2:147028/148‑1 (MQ=255) ccGCGCTGGTATTAAGCTCAATGTTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTcc > 1:796292/1‑149 (MQ=255) cgcTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCAcgc < 2:719812/150‑1 (MQ=255) ggTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCAt > 2:837664/1‑150 (MQ=255) ggTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCAt > 1:1448910/1‑150 (MQ=255) ggTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGAAGTTGCCAGCCCGGCAGCCCTGCTCATCTGCTGGGTGATTACTGGCTCTTGCATTTTATTGCTGGCCGTTGCCATGCTGATACTCACGAGCAt > 1:1746714/1‑150 (MQ=255) gTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCAtt > 2:415826/1‑150 (MQ=255) gTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGATGGCCTATGCGATGCTTATCCTCACGCGCAta > 2:101260/1‑149 (MQ=255) aTTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCg > 2:109679/1‑150 (MQ=255) ttAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAAAAAGGCGGCAGATGCCCGCCCGCCAGCACTGCTCCTCGGCGGGGGTTTTACTCGCCCTGGCATTTTAAAGCTGGCCATAGCCAAGCTGATCCTCACGCGCATACgg > 2:1755041/1‑149 (MQ=255) tAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCGAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTc < 1:178533/150‑1 (MQ=255) tAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTc > 2:1596694/1‑150 (MQ=255) tAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTc > 1:1823442/1‑150 (MQ=255) tAAGCGCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTc < 1:990589/150‑1 (MQ=255) aaGCTCAATGCTGGGCGCGGGAGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCATTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTcc > 1:392846/1‑150 (MQ=255) aaGCTAAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTATGGCGCAAAATTTGGCGGCAGTTGCCTGCCCTGCAGCACTGCTCTTGGGGTGGGGTATTACTGGCGCTGTCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATGCTCACGCGCATTCGTcc < 1:708652/150‑1 (MQ=255) aGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTccc < 1:996296/150‑1 (MQ=255) cTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGa > 2:756346/1‑150 (MQ=255) cTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGa < 1:1348475/150‑1 (MQ=255) cAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAAc > 2:847686/1‑150 (MQ=255) aTGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGCTCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACtt > 2:1527552/1‑150 (MQ=255) tGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGAcg < 2:1532148/150‑1 (MQ=255) gggCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGAcgg > 1:669609/1‑150 (MQ=255) ggCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGAcggc < 1:1281177/150‑1 (MQ=255) cgcgGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGAcggcgg < 2:1072387/150‑1 (MQ=255) ggTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAACACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATc < 1:1823153/150‑1 (MQ=255) ttatCAGTCTGCCGAAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCGGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTa < 1:1597509/147‑1 (MQ=255) tttCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCCCTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGCTCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTAc > 1:363897/1‑150 (MQ=255) tttCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGAcggcgg > 1:116488/1‑141 (MQ=255) tttCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGAcggcgg < 2:116488/141‑1 (MQ=255) ctggcaacTGCCGCCATATTTTGCGGCAGTTGCCCGCCCGGCAGCGCTGCTCATCGGCTGGGGGATTACTGGCGCTGGCATTGTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCCCGCGCATTCGTCCCGACCTTGACGGCGGTATCTGTAc > 1:260421/8‑150 (MQ=255) caacTGCCGCCATATTTTGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTAt > 2:1142864/4‑150 (MQ=255) acTGCCGCCATATTTTGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCCCGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGc > 2:1067877/2‑150 (MQ=255) cTGCCGCCATATTTTGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGcc > 2:829053/1‑150 (MQ=255) ccGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCcgc > 1:606205/1‑150 (MQ=255) ccGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCAATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCcgc > 2:1590168/1‑150 (MQ=255) cGCAAAATAGGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCcgcg < 2:1772696/150‑1 (MQ=255) aaaaTATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCCGCGAAg > 1:551592/1‑150 (MQ=255) aaaTATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCCGCGAAgg < 2:1300101/150‑1 (MQ=255) | ATTTTTATGCGTTTTGCCCTAATATTTATTCTTCTTATCACGTTTTAATCACTGGATATCGATGGAAAAGAAACTGGGACTGAGCGCACTCACCGCGCTGGTATTAAGCTCAATGCTGGGCGCGGGTGTTTTCAGTCTGCCGCAAAATATGGCGGCAGTTGCCAGCCCGGCAGCACTGCTCATCGGCTGGGGTATTACTGGCGCTGGCATTTTATTGCTGGCCTTTGCCATGCTGATCCTCACGCGCATTCGTCCCGAACTTGACGGCGGTATCTTTACCTATGCCCGCGAAGG > NC_000913/1679496‑1679789 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |