| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,990,932 | C→T | 9.0% | intergenic (+40/+22) | tyrP → / ← yecA | tyrosine transporter/UPF0149 family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,990,932 | 0 | C | T | 9.0% | 327.0 / 14.7 | 110 | intergenic (+40/+22) | tyrP/yecA | tyrosine transporter/UPF0149 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (50/50); new base T (4/6); total (54/56) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.42e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.19e-01 | |||||||||||
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
ACCGGGTCAAAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATCCAGTAC > NC_000913/1990783‑1991080 | tccGGGTCATAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTTGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAAc < 1:1538/149‑1 (MQ=255)aCCGGGTCAAAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAAc > 2:4843/1‑150 (MQ=255) ccGGGTCAAAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACg > 1:1065440/1‑150 (MQ=255) gTCAAAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGa < 1:534005/150‑1 (MQ=255) tCAAAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGTCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGac < 1:31701/150‑1 (MQ=255) aGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCAccc < 1:852174/150‑1 (MQ=255) ggtCGTGCGGCGCTGGTGGGGGAGTTTCTCTGGGGTATTGCTGTGCGTGGCGGGCAATGTTTGATAGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGGGGGGGGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTCTTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAAta < 1:1614133/150‑2 (MQ=255) gtcgtcCGGCGCTGGTGGTCGTGTTTCTCTGTGGTTTTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAAtaa < 1:1643518/150‑3 (MQ=255) tcgtcCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTAGTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAAtaag < 1:1064510/150‑4 (MQ=255) gcggccGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAAtaag < 1:649022/146‑4 (MQ=255) ggtcCGGCGCTGGTGGTGGTGGTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCGTTATTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAAtaagg < 2:475722/149‑5 (MQ=38) cgtcCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTgg < 1:1483564/150‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCctct > 1:1577968/1‑150 (MQ=255) ggCGCTGGTGGTGGGGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTCATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATAAACGCAGACACCCAATTTGGCctct < 1:814097/150‑1 (MQ=255) cgcTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTa < 2:589759/150‑1 (MQ=255) cgcTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTa < 2:638603/150‑1 (MQ=255) cTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGTCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTACCGCTGCCACCCAATTTGGCCTCTTAAt > 1:449143/1‑150 (MQ=255) gtggtggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgca < 2:797182/150‑1 (MQ=255) gtggtggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgca > 1:1304079/1‑150 (MQ=255) tggtggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgcag < 1:516748/150‑1 (MQ=255) tggtggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGACCTCTTAATgcag < 1:656688/150‑1 (MQ=255) gggtggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgcag < 2:1278683/149‑1 (MQ=255) ggggggggtTGCTCTGTGGAATTGCTGTGATTGCGGTGCAATTTTTTATTGCGGCAGGGTTGTTCCCAGAAGTGGGGGGATCAGATACCCTAAAATACCTTATT‑GGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgcagg < 1:1564752/143‑1 (MQ=255) gtggtgTTTCTCTGGGGTATTGCTGTGATTGGGGTTCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTGGTTACCAGAAGTGGGGTGATCCGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGCTGCCTGAATTAACGCTGACACGCAATTTTGCCTCTTAATgcaggc < 2:1278044/150‑1 (MQ=255) tggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgcaggca > 1:364816/1‑150 (MQ=255) tggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgcaggca > 1:551130/1‑150 (MQ=255) ggtgTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATgcaggcag > 2:591590/1‑150 (MQ=255) gtgtTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGgcagc < 1:518937/150‑1 (MQ=255) tgtTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGgcagca > 1:446331/1‑150 (MQ=255) gtTTCTCTGTGGTATCGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCAc < 1:366829/150‑1 (MQ=255) gtgGTATTGCTGTCATTGGCGTGCAATTTTTGAATGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTCGGGTGATCAGATAGCATCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACAACCAATTTGGACTCTTAATTCAGTCAGCACTGATTaaa > 2:316735/1‑150 (MQ=255) tgGTATTGCTGTGATTGTCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGTTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTATGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAAt < 1:1122552/150‑1 (MQ=255) ttGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCtt < 1:42173/150‑1 (MQ=255) tGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTa < 1:1057083/150‑1 (MQ=255) cTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTAcc < 1:989405/150‑1 (MQ=255) tgtgATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCa < 1:917152/150‑1 (MQ=255) gTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTACTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAAGTTCTTACCACTACCGCACg > 1:119069/1‑150 (MQ=255) gCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACggg > 1:1434522/1‑150 (MQ=255) cAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGc > 2:82176/1‑150 (MQ=255) aaTTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCa < 2:943397/150‑1 (MQ=255) tttttGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAg > 2:1700708/1‑150 (MQ=255) gATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCg < 1:1518017/150‑1 (MQ=255) tGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTa < 1:693557/150‑1 (MQ=255) gCGGCAGGGTTGTTACCAGAATTGGGGTGATCAGATAGCCTCACATTGCTTATTGGGTGGCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGGACGGGCAAGGAGCGTTAc < 2:1710746/150‑1 (MQ=255) gCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGTTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTAc < 1:807281/150‑1 (MQ=255) gCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTAc > 1:511375/1‑150 (MQ=255) cGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGTGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACg > 2:938677/1‑150 (MQ=255) ggCAGGGTTGTTACGAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCTGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGc < 1:439665/150‑1 (MQ=255) aGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGcccc < 2:1595180/150‑1 (MQ=255) gttgttACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCgct > 2:216094/1‑148 (MQ=255) gttgttACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGt > 2:1449904/1‑150 (MQ=255) tACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCACAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTtctc > 1:1295384/1‑150 (MQ=255) aCCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACCCCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTctct > 2:1055966/1‑150 (MQ=255) aCCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTctct < 2:1405722/150‑1 (MQ=255) ccAGAAGTGGGGTGTTCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCtctt > 2:422816/1‑150 (MQ=255) ccAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACAGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCtctt > 1:424362/1‑150 (MQ=255) aaGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATAGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGc < 2:391933/150‑1 (MQ=255) aGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTTCTTAAATTTAAAACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACTCCCCGGTTACTCTTCTgat > 1:1791454/1‑148 (MQ=255) aGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCt < 2:446331/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGATTTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTTCGCCCCGGTTTCGGGTCTGCtgt > 2:700735/1‑148 (MQ=255) tGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCttt < 2:1522215/150‑1 (MQ=255) tGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCttt > 1:1267003/1‑150 (MQ=255) ggggTGCTCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGAGCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTg < 1:1396143/150‑1 (MQ=255) ggggTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTg < 1:1700708/150‑1 (MQ=255) ggggTGAGCAGATAGCCTCATATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCGGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTg < 1:1747577/150‑1 (MQ=255) ggTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGAt > 1:1752002/1‑150 (MQ=255) gTGATCAGATAGCCTCTAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTTATGGAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACGGCACGGGCAAGGATCGTTTCGCCCCGGGTTCTCTTCTGCTTTGATc < 2:1761099/150‑1 (MQ=255) tGATCATATAGCCTCAAATTCCTTATTTGGTGCAAGAATTAACGCTGAAACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTTCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCg < 2:1531917/150‑1 (MQ=255) tGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCg < 1:366335/150‑1 (MQ=255) aTCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGt > 1:460438/1‑150 (MQ=255) aGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGc < 2:1049296/150‑1 (MQ=255) gCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAAc < 2:1021291/150‑1 (MQ=255) cTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAg < 1:1701834/150‑1 (MQ=255) cTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTGTGATCGGTTGCTGAACAg > 1:1532469/1‑150 (MQ=255) tCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGc > 1:526154/1‑150 (MQ=255) cAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCt > 2:417488/1‑150 (MQ=255) aTTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCGCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCtttt < 2:1577968/150‑1 (MQ=255) aTTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCtttt < 2:1065440/150‑1 (MQ=255) ggccaaaTTGGGTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTTAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCttttt > 1:328686/7‑150 (MQ=38) ggccaaaTTGGGTGTCAGCGTTAATTCAGGCACCCAATTTGGCGTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTGAACTTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCGTTGATCGGTTGCTGAACAGCttttt > 1:292681/7‑150 (MQ=255) ccTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGGACAGCTTTTTcc < 1:804615/150‑1 (MQ=255) cTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCt > 1:1366878/1‑150 (MQ=255) cTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCt > 2:1733832/1‑150 (MQ=255) cTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGAGCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCt < 1:342353/150‑1 (MQ=255) tATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAAATTGTCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAAATTCTTAACACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCAAGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGc > 2:739219/1‑150 (MQ=255) tttGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAATGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCg < 1:453864/149‑1 (MQ=255) aTTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCg < 1:969636/150‑1 (MQ=255) gggTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGAt > 1:786574/1‑150 (MQ=255) ggTGTCAGCGTTAATTCTGGCACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATg > 1:1449368/1‑150 (MQ=255) ggTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATg > 2:1374435/1‑150 (MQ=255) ggTGCCAGAATTAACGCTGAAACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGTCAGCACTGCTTAAATTTCTTAACACTACCTCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATg < 2:1014670/150‑1 (MQ=255) tGCCAGAATTCACGCGGACACCCAATTTGGCCTCTTAAGGCAGGCAGCACAGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGAGCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATgcg < 1:77327/150‑1 (MQ=255) tGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATgcg > 1:1776714/1‑150 (MQ=255) gCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATgcgc > 1:730373/1‑150 (MQ=255) gCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCATAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTATGATCGGTTGCTGAACAGCTTTATCCTGCGGATgcgc > 2:1406890/1‑150 (MQ=255) gCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCAATGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATgcgc > 2:65715/1‑150 (MQ=255) ccAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGcc > 1:1590674/1‑150 (MQ=255) cAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCa > 1:841057/1‑150 (MQ=255) aaCGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGATTAAATTTCTTACAACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGATTATATTATGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATCCCGTa > 2:142070/1‑150 (MQ=255) aCGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTAGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATCCAGTAc > 1:379144/1‑150 (MQ=255) | ACCGGGTCAAAGGTGGTCGTCCGGCGCTGGTGGTGGTGTTTCTCTGTGGTATTGCTGTGATTGGCGTGCAATTTTTGATTGCGGCAGGGTTGTTACCAGAAGTGGGGTGATCAGATAGCCTCAAATTCCTTATTGGGTGCCAGAATTAACGCTGACACCCAATTTGGCCTCTTAATGCAGGCAGCACTGCTTAAATTTCTTACCACTACCGCACGGGCAAGGATCGTTACGCCCCGGTTTCTCTTCTGCTTTGATCGGTTGCTGAACAGCTTTTTCCTGCGGATGCGCCATCCAGTAC > NC_000913/1990783‑1991080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |