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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 2,044,733 | 0 | T | C | 6.0% | 345.7 / 9.4 | 118 | intergenic (+109/‑205) | asnT/yeeJ | tRNA‑Asn/putative adhesin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/53); new base C (4/3); total (61/57) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
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Only 100 of 119 total aligned reads displayed.
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ggTTGAGGGCGTTTTGCTATGAACGCCATCACCATTTTCCCCTCGATTATAAAACTTGAGTTATTCAGTAGTCTCCCCTCTTGCAACTCACACCCAAAACTGCCTAACGAAAAGTTTTTAATTTTCAATCATATTGCTATCAGTATTTAc > 2:234990/1‑150 (MQ=255) gTTGAGGGCGTTTTGCTATGAACGCCATCACCATTTTCCCCTCGATTATAAAACTTGAGTTATTAAGTAGTCTCCCCTCTTGCAACTCACCCCCAAAACTGCATAACGAAAAGTAATTAAATTTCAATCATAATGCAATCACTATTTACa > 1:351124/1‑150 (MQ=255) | TAATCCGTATGTCACTGGTTCGAGTCCAGTCAGAGGAGCCAAATTCTAAAAATTCGCTTTTTTAGCGCAATGTCACTGACCTTAGTTGAACATTGTTTTTTAACGGATAGCGGGTTTTTAACATCTTAAGCGCCCTCGACCTTTATGGTTGAGGGCGTTTTGCTATGAACGCCATCACCATTTTCCCCTCGATTATAAAACTTGAGTTATTCAGTAGTCTCCCCTCTTGCAACTCACACCCAAAACTGCCTAACGAAAAGTTATTAATTTTCAATCATATTGCTATCAGTATTTACA > NC_000913/2044584‑2044880 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |