| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | NC_000913 | 2,085,662 | 0 | C | T | 5.8% | 374.0 / 6.2 | 119 | intergenic (‑137/+42) | yeeE/plaP | UPF0394 family inner membrane protein/putrescine importer, low affinity |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (59/53); new base T (5/2); total (64/55) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.49e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
CATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAGACCCAGAACCATTGAGC > NC_000913/2085514‑2085810 | cATTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGcc > 1:1040892/1‑150 (MQ=255)aaTTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGcc < 2:1041691/149‑1 (MQ=255) aTTGAAAACATAAATTAATTAACCAGATGAATGTTAATGAGGAAATTATTCATGACTGGTGGAATGCAGACCAATAACCAAATTCTCTAAATTAGAACAAATGGTTATTAATGAGGAGTTCGATACAAAAGAATAAAAAAACCGGAGCCa > 1:607473/1‑150 (MQ=255) 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aGAATAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAg > 2:1304093/1‑150 (MQ=255) taataataaaCCGGAGTCGAATGAACATTTGGCTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCACGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAGAc > 2:1622528/8‑150 (MQ=38) aTAAAAAAACCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAGAcc > 2:1075424/1‑150 (MQ=255) ataataaaCCGGAGTCGAATGAACATTTGGCTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAGAccc > 1:7568/6‑150 (MQ=38) aaaaaaaCCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAGACCCa > 1:563456/1‑150 (MQ=255) ataaaCCGGAGTCGAATGAACATTTGGCTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAGCCCCAGa > 1:1608786/3‑150 (MQ=38) aaaaaCCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTTCGGAACCGGATTACGGAAGCTCATGGTGACTCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAGACCCAGa > 2:203803/1‑150 (MQ=255) aaaaaCCGGAGCCAAATGTTCATTCGACTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAGACCCAGa < 2:666939/150‑1 (MQ=255) ccGGAGTCGAATGAACATTTGGCTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAGACCCAGAACCAt > 1:25503/1‑150 (MQ=255) cGGAGTCGAATGAACATTTGGCTCCGGTTTATTATTAGAAAAGATGATTATGCTACGTCTTCGTACTGCGGAACCGGATTACGGAAGCTCTTGGTGACGCAAGCCAGGTAAATCAGACCGATAGCAGCCCAGATCAGCCCCAGAACCAtt > 2:377076/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |