Predicted mutation | |||||||
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RA | NC_000913 | 2,976,754 | T→G | 5.9% | R52R (CGT→CGG) | galR → | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,976,754 | 0 | T | G | 5.9% | 328.3 / 8.5 | 113 | R52R (CGT→CGG) | galR | galactose‑inducible d‑galactose regulon transcriptional repressor; autorepressor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (47/59); new base G (2/5); total (49/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.97e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.60e-01 |
Only 100 of 114 total aligned reads displayed.
ACCATAAAGGATGTAGCCCGACTGGCAGGCGTTTCAGTCGCCACCGTTTCCCGCGTCATTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGGCGCAGCAGACCACTGAAACGGTCGGTCTGGTCGTTGGTGATGTTTCCGATCCGTTTTTCGGTGCAATGGTGAAAGCGGTCGAACAGGTGGCTTATCACACCGGTAATTTTTTATTGATTGGCAACGGTTACCACAACGAA > NC_000913/2976605‑2976901 | aCCATAAAGGATGTAGCCCGACTGGCAGGCGTTTCAGTCGCCACCGTTTCCCGCGTCATTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGt > 2:1424822/1‑150 (MQ=255) ccATAAAGGATGTAGCCCGACTGGCAGGCGTTTCAGTCGCCACCGTTTCCCGCGTCATTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTg < 1:1775974/150‑1 (MQ=255) ccATAAAGGATGTAGCCCGACTGGCAGGCGTTTCAGTCGCCACCGTTTCCCGCGTCATTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTg < 1:1597728/150‑1 (MQ=255) aTAAAGGATGTAGCCCGACTGGCAGGCGTTTCAGTCGCCACCGTTTCCCGCGTCATTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTgcg < 2:787108/150‑1 (MQ=255) aGGATGTAGCCCGACTGGCAGGCGTTTCAGTCGCCACCGTTTCCCGCGTCCTTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTgg < 1:199955/150‑1 (MQ=255) gATGTAGCCCGACTGGCAGGCGTTTCAGTCGCCACCGTTTCCCGCGTCATTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCTTAGTGCAATTGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAGCGCACGGGCGTTGgcg < 1:1010364/150‑1 (MQ=255) gATGTAGCCCGACTGGCAGGCGTTTCAGTCGCCACCGTGTCGCGCGTCATTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGGAATGGAGTCTCTTAGCTTTCACCCGAACGCCAACGCCCGTGCGCTGgcg < 1:338672/150‑1 (MQ=255) aTGTAGCCCGACTGGCAGGCGTTTCAGTCGCCACCGTTTCCCGCGTCATTAATAATTCACCCAAAGCCAGCGAAGCTTCCCGGCTGGCTGTGCATAGTGCAATGGAGTCTCTTAGCTATCACCCGAACGCCAGCGCACGGGCGTTGgcgt < 1:749457/150‑2 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |