Predicted mutation | |||||||
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Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 3,233,155 | 0 | A | T | 5.2% | 402.3 / 8.5 | 134 | K497N (AAA→AAT) ‡ | fadH | 2,4‑dienoyl‑CoA reductase, NADH and FMN‑linked |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (55/71); new base T (3/4); total (59/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.16e-01 |
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
ACCGTGACGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGGGATCGTGCCGCGCACTCCGCCCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCGATGTACTGCGCGACAAAGCGCCGGTTGGCAACAAAGTTGCCATCATCGGTTGTGGCGGGATTGGTTTTGATACGGCGATGTATTTAAGTCAGCCGGGCGAATCCACCAGCCAGAATATCGCCGGGTTCTGTAATGAATGGGGGATCGACAGTAGCCTACAACAGGCTGGTGGCTTAAGCCCGCA > NC_000913/3233006‑3233304 | acCGTGACGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGGGATCGTGCCGCGCACTCCGCCCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCGATGTACTGCGCGACAAAGCGCCGGTTGGCAACaaa < 1:1156333/150‑1 (MQ=255) aCGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGTGATCGTGCCGCGCACTCCGCCCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCTATGTACTGCGCGAGAAAGCGCCGGTTGGCAACAAAGTTGcc < 2:608132/150‑1 (MQ=255) aCGGCGGATCAGTTACAGGCTTTCGATGAAACGATCCTCGCCAGTGGGATCGTGCCGCGCACTCCGCCCATCGACGGGATCGATCATCCGAAGGTATTGAGTTATCTCGATGTACTGCGCGACAAAGCGCCGGTTGGCAACTTTGTTGcc < 2:1699136/150‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |