| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 443,022 | 0 | G | A | 5.4% | 354.2 / 5.0 | 109 | intergenic (+25/+29) | thiI/yajL | tRNA s(4)U8 sulfurtransferase/oxidative‑stress‑resistance chaperone |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (55/48); new base A (4/2); total (59/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.85e-01 | |||||||||||
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Only 100 of 111 total aligned reads displayed.
ATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTACCCGGC > NC_000913/442874‑443171 | aTTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGt < 1:770072/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATCTCGACCAGAACAAAAGCTGGCTGCTGTGGGGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTTCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGGCa < 2:325298/150‑1 (MQ=255) ttGGCGATCTCGACCAGAACAAAACGTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCa < 2:310523/150‑1 (MQ=255) 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ctcGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGAc > 2:1269588/1‑150 (MQ=255) ctcGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGAGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGAc > 1:300799/1‑150 (MQ=255) tcGACCAGAACAAACCCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGACCAGATGCGACg < 1:991514/150‑1 (MQ=255) tcGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGACCAGATGCGACg < 2:830504/150‑1 (MQ=255) cGACCAGAACAAAACCTCGCTGCTGTGGTGTGAGCGCCGGGTGAAGAGCCCTCTGCAGCCGCACTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTCAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGATTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGt > 1:382333/1‑150 (MQ=255) aCCAGAACAAACCCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGttt > 1:816196/1‑150 (MQ=255) cAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCTTCTGGTCAGATGCGACGTTTGc > 1:1728543/1‑150 (MQ=255) aGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGcc < 2:1694409/150‑1 (MQ=255) gAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCg < 2:1066000/150‑1 (MQ=255) gAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCg < 1:1500894/150‑1 (MQ=255) 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tataTCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGt > 1:1625162/1‑150 (MQ=255) tatCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCg < 2:367397/150‑1 (MQ=255) tatCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATAACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCg > 1:698150/1‑150 (MQ=255) tatCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCAGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCg < 1:565740/150‑1 (MQ=255) atCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGa > 1:1326188/1‑150 (MQ=255) atCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGa > 2:167164/1‑150 (MQ=255) aTTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAg < 1:1619722/150‑1 (MQ=255) ttGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCATATGCGACGTTTGACGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGAc < 2:836820/150‑1 (MQ=255) tttttACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGt > 1:416523/1‑150 (MQ=255) tttACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCCTCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCg < 1:689174/150‑1 (MQ=255) tACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGAt > 1:614243/1‑150 (MQ=255) tACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGAt < 2:589829/150‑1 (MQ=255) aCGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATa < 2:1766678/150‑1 (MQ=255) aCGTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATTATTTTCAGACCAAAGTCGATa > 1:59655/1‑150 (MQ=255) gTCGCATCTGACCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGACGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAga > 2:1739047/1‑149 (MQ=255) cGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTg < 2:1026599/150‑1 (MQ=255) gCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCGCCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCACAACCCACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCCATAGcggg > 1:346437/1‑147 (MQ=255) aTCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTAc > 1:644743/1‑150 (MQ=255) tCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTAcc > 2:1057712/1‑150 (MQ=255) cTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCGGTcccc > 2:1203002/1‑150 (MQ=255) gTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGCCACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACTGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTACCCGGc > 1:232514/1‑150 (MQ=255) gTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTACCCGGc > 2:930937/1‑150 (MQ=255) | ATTTGGCGATCTCGACCAGAACAAAACCTGGCTGCTGTGGTGTGAGCGCGGGGTGATGAGCCGTCTGCAGGCGCTCTATCTGCGCGAGCAGGGCTTTAACAATGTGAAGGTATATCGCCCGTAATTTGTGGTTTTTACGTCGCATCTGGTCAGATGCGACGTTTGCCGCATCCGACACTACTCGTAATAATTATAAATCCCTGCCGCCATCACCAGTTGTGATGCCACTTCATGGGCTTTTTCACGCCCAACCAACAGGTCGATAATTTTCAGACCAAAGTCGATAGCTGTACCCGGC > NC_000913/442874‑443171 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |