| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,591,498 | T→A | 8.9% | intergenic (‑219/‑159) | yjiY ← / → tsr | putative transporter/methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,591,498 | 0 | T | A | 8.9% | 356.1 / 19.8 | 124 | intergenic (‑219/‑159) | yjiY/tsr | putative transporter/methyl‑accepting chemotaxis protein I, serine sensor receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (69/44); new base A (3/8); total (72/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.11e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.36e-01 | |||||||||||
Only 100 of 125 total aligned reads displayed.
ATTGACCGCTATCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACA > NC_000913/4591353‑4591643 | aTTGACCGCTATCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGTGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTAata > 1:596896/1‑150 (MQ=255)aTTGACCGCTATCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCata < 1:308252/150‑1 (MQ=255)aTTGACCGCTATCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCata > 2:826619/1‑150 (MQ=255)aTTGACCGCTATCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTGATTTTAGGGATGTAAGCGGGCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCata < 1:1141711/150‑1 (MQ=255) ttGACCGCTATCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCatat > 2:1223155/1‑150 (MQ=255) gCTATCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACata > 2:1778631/1‑150 (MQ=255) gCTATCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACata > 2:1516216/1‑150 (MQ=255) tctCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTCAGGTAAATAACTGAGGGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGTGCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGGTTAAGTGACGATAAATATGTGATATGAATCACATAtt < 1:1148917/148‑1 (MQ=255) tATCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATAtt < 1:1664005/150‑1 (MQ=255) ccTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTtat < 1:1428241/150‑1 (MQ=255) tGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACTATAAATATGTGATTCATATCACATATTTatat > 1:277070/1‑150 (MQ=255) tGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATATGAATCACATATTtatcg < 1:817113/150‑3 (MQ=255) tGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATATGAATCACATATTtatcg < 1:1048864/150‑3 (MQ=255) tGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGCTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATATGAATCACATATTtatcg < 1:752439/150‑3 (MQ=255) gTGATGTTGCCAGATTTACGCGCTCGTAATGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTACGGATGTAATCGGTGAGTTTTGCGGATGAGCGGGAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATtgtg < 2:942903/150‑1 (MQ=255) gTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATtgtg < 2:601860/150‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGa < 2:1035061/150‑1 (MQ=255) tGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATATGAATCACATATTtatcgtcact < 2:393556/150‑8 (MQ=39) tGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGAAGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAAtt > 2:739646/1‑150 (MQ=255) agagTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCTGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATg > 2:79340/1‑150 (MQ=255) gTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTATATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATGACATATTTATATTGTGAATAATGTATGTaa > 1:307010/1‑150 (MQ=255) gTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTaa > 1:1024325/1‑150 (MQ=255) cgcgcgcgTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCTGTTGAGCGCCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATTTAaataa > 2:1226824/1‑150 (MQ=255) cgcgcgcgTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAaataa > 1:44378/1‑150 (MQ=255) cgcgcgTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATg > 2:1599814/1‑150 (MQ=255) cgTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGAGAATAATTTATGTAAATAATGGCtt > 1:1805076/1‑150 (MQ=255) gTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTAAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAAATTAAGTAAATAATGGCttt > 2:274447/1‑150 (MQ=255) tAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATAACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCtttt > 1:142504/1‑150 (MQ=255) aaaGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCCCATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCttttt < 2:794158/150‑1 (MQ=255) aGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTaa > 1:261974/1‑150 (MQ=255) ttAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTaaa < 1:1372386/149‑1 (MQ=255) gTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTaaa > 1:1055978/1‑150 (MQ=255) gTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGAGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTaaa > 1:1188053/1‑150 (MQ=255) aaGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAAtt < 2:395334/150‑1 (MQ=255) aaGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAAtt > 2:1507837/1‑150 (MQ=255) aGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCTGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAATGCGTCGTTTAAGTTACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTc < 2:1291575/150‑1 (MQ=255) aGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAAtta > 1:776820/1‑149 (MQ=255) ggTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCa > 2:1346295/1‑150 (MQ=255) ggTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCa > 1:1311219/1‑150 (MQ=255) gTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTTag < 2:499549/150‑1 (MQ=255) aaaTAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCagag > 1:531939/1‑150 (MQ=255) aaaTAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCAAATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCagag > 2:39369/1‑150 (MQ=255) aTAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAgtg < 1:1746515/150‑1 (MQ=255) aaCTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGtgtg < 1:1517520/150‑1 (MQ=255) cTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGaa > 1:190614/1‑150 (MQ=255) cTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCAAATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGaa > 1:1674289/1‑150 (MQ=255) cTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCCGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAACTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGaa < 2:88617/150‑1 (MQ=255) ggTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAAt < 2:1796956/150‑1 (MQ=255) ggTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAAt > 2:617180/1‑150 (MQ=255) ggTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAAt < 1:1484201/150‑1 (MQ=255) aTTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCAc < 1:846020/150‑1 (MQ=255) tttAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTc > 1:795084/1‑150 (MQ=255) tAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTCAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCgg < 1:721247/150‑1 (MQ=255) tAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAACGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATAACACATATTTAAATTGTGAATAATTTATGTAAATAATTTCTTTTTAAATTCAGATACAGAATAAAAATCACTCgc > 2:946695/1‑149 (MQ=255) aGGGATGTAAGCGTTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAAAAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGc < 2:717033/150‑1 (MQ=255) aGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATTTTATTCAcactct < 2:324035/150‑6 (MQ=255) aGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGc < 2:1003654/150‑1 (MQ=255) gggATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTTAGCTGCAAAGTCGTCGTTTAAGAGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCg < 1:339864/150‑1 (MQ=255) tGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCTTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAAt < 2:707915/150‑1 (MQ=255) tAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAAtct > 2:627458/1‑150 (MQ=255) ggTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCcgcg > 2:1805208/1‑150 (MQ=255) tCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCggg > 1:727618/1‑150 (MQ=255) gTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGata > 2:1392796/1‑150 (MQ=255) tttGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATAtt < 1:1769404/150‑1 (MQ=255) cGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATa < 1:1778631/150‑1 (MQ=255) ggTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATaa > 2:495055/1‑150 (MQ=255) ggTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATaa > 2:511151/1‑150 (MQ=255) tagaggCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGtt < 1:1544945/146‑1 (MQ=255) gCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGtttt < 2:276118/150‑1 (MQ=255) gCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGtttt > 2:967575/1‑150 (MQ=255) gCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGtttt > 2:1680594/1‑150 (MQ=255) gCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGtttt > 2:1181116/1‑150 (MQ=255) gCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGtttt < 1:1543234/150‑1 (MQ=255) gCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTAACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGtttt > 1:767059/1‑150 (MQ=255) ggCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTtttc > 2:6643/1‑150 (MQ=255) gCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTtttcc < 1:1005618/150‑1 (MQ=255) gCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTtttcc > 1:466421/1‑150 (MQ=255) gCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTtttcc > 2:260745/1‑150 (MQ=255) gCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCa < 2:767055/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAg < 1:989579/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAg < 1:957299/150‑1 (MQ=255) cgtcgtTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTACTTTCCAg > 2:1316791/1‑150 (MQ=255) cgtTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGcc > 1:208776/1‑150 (MQ=255) aaGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGaaaa > 1:1143037/1‑150 (MQ=255) aGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAAt < 2:399435/150‑1 (MQ=255) tGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCt > 1:423526/1‑150 (MQ=255) tGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCt < 1:638957/150‑1 (MQ=255) tGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCt > 1:530433/1‑150 (MQ=255) gACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTACAGGCCGAAAATCtt > 1:957318/1‑150 (MQ=255) caataTAAATATGTGATATGAATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCtt > 1:1283295/5‑150 (MQ=255) cGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGc > 1:780122/1‑150 (MQ=255) cGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGGGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGc < 2:1171536/150‑1 (MQ=255) aTAAATATGTGATATGAATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCAt > 2:472237/1‑150 (MQ=255) aaaTATGTGATATGAATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCg > 1:911028/1‑150 (MQ=255) aaTATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCTCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCgg > 1:998947/1‑150 (MQ=255) atatGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGt > 2:1500824/1‑150 (MQ=255) tatGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTc < 1:1260355/150‑1 (MQ=255) atggtaatCATATAACATATTTATATTGTGTATAATTTATTTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCG‑AAATCTTGCATCGGTCca < 1:1501134/143‑1 (MQ=255) atGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTcc > 2:692605/1‑150 (MQ=255) tgATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCcaca > 1:1163926/1‑150 (MQ=255) | ATTGACCGCTATCCTGTAGTGATGTTGCCAGAGTTACGCGCGCGTAAAGTAAGGTAAATAACTGAGTGGTTATTTTAGGGATGTAAGCGGTCAGTTTTGCGGTTGAGCGGCAAAGGCGTCGTTTAAGTGACGATAAATATGTGATTCATATCACATATTTATATTGTGAATAATTTATGTAAATAATGGCTTTTTAAATTCAGAGTGTGAATAAAATTCACTCGGCGTAATCTCCGCGGGATATTCATAAAGTTTTTCCTTTCCAGGCCGAAAATCTTGCATCGGTCCACA > NC_000913/4591353‑4591643 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |