| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,612,331 | C→T | 6.0% | intergenic (+42/‑80) | ytjA → / → yjjU | uncharacterized protein/putative patatin‑like family phospholipase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,612,331 | 0 | C | T | 6.0% | 357.9 / 7.1 | 118 | intergenic (+42/‑80) | ytjA/yjjU | uncharacterized protein/putative patatin‑like family phospholipase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (57/52); new base T (3/4); total (60/58) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.10e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.03e-01 | |||||||||||
Only 100 of 118 total aligned reads displayed.
GGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTCCAGCCTGG > NC_000913/4612183‑4612478 | ggTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCg > 1:22780/1‑150 (MQ=255) gTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCgg > 2:1267071/1‑150 (MQ=255) tggtggTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACt > 2:1154054/1‑150 (MQ=255) gtggtCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGCCCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTgg > 1:350222/1‑150 (MQ=255) gtCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTTTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCGCTGGACTGGCtt < 2:1755722/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGGTACCGCTGCCGGCGCAGCTAAAATTGGCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTCATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCtttt < 1:721832/150‑1 (MQ=255) cTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCGCTGGACTGGCtttg < 1:1279789/150‑2 (MQ=255) tGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTTTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCGCTGGACTGGCtttgg < 2:1050411/150‑3 (MQ=255) tGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCGCTGGACTGGCtttgg < 2:1192039/150‑3 (MQ=255) ggCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTTAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTGGc > 1:239407/1‑150 (MQ=255) gCCGGTACCGCTGCCGGCGCTGCTAAACTTGTCTTTGTCTTCGGGAGTTTTCTTATCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCGGAACACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCg < 1:1710422/150‑1 (MQ=255) gCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGGCGTCGGGATTATTGTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGGCCAGCGGACTGGCTTTTGCg < 2:1662412/150‑1 (MQ=255) ccGGTACCGCTGCAGGCTAAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGTGATTATTCTGTTCCTGTTGAGTTTGTTCATGGGCCTAAAACGACCATAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCgg < 2:1724107/150‑1 (MQ=255) gTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCATTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGttt < 2:302589/150‑1 (MQ=255) gTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGttt < 1:640874/150‑1 (MQ=255) gTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGACTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGCCCCTAGATTTCAGACCATTAAGATAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGtgt > 1:1610079/1‑148 (MQ=255) tACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGtttt < 1:450124/150‑1 (MQ=255) cTGCAGGCTCAGGTAAAATTTTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTATATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCTGACTTGCTTTTGCGGTTTTAGCGa < 2:541588/150‑1 (MQ=255) tGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGaa < 2:1606736/150‑1 (MQ=255) gCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGaat > 2:20828/1‑150 (MQ=255) ggCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGaataat > 2:368998/1‑150 (MQ=255) gcgcAGCTAAAAGTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGGTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAACACGACCCTAGATTTCATACCATTAAGAAAATTTTTTCCAATGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTTCGGTTTTAGCGAataata < 1:1254720/150‑1 (MQ=255) cTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCGTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGc > 2:622829/1‑150 (MQ=255) aaaaTTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGATACTCGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAACCCACCCTAGATTTACGGCAATTAAGAAAATTTTAACCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGATTTTGCGGATTTAGCGAATAATAAATTGCGt > 1:1306615/1‑150 (MQ=255) aaaaATGTCTATGTCCTCGGGAATATTCTGTTCCAGGTCAGATTCTTCAAGTGCCGAAAACCACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATATAATACAAAGCCACACCACCGCACTGGCTTTTCCGGTATTAGCGAATAATAAAttccct > 1:1306608/1‑146 (MQ=255) aaaTTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGGTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGtt < 2:1095856/150‑1 (MQ=255) tGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATCGCGTTACtt < 1:849536/150‑1 (MQ=255) tCTTTGTGGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTg < 2:1781212/150‑1 (MQ=255) tCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTg < 1:1484093/150‑1 (MQ=255) cTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGt > 1:372110/1‑150 (MQ=255) tttGTCGTCGGGATTATTCTGTTTCTGGTGATTTTGTTTAAGGGCCGTAAAAGAACCTATTTTTTATTCCATTAAGTAAATTTTATCCAAAGCCATTCCCGGGGTCTGGCTTTTGGGGTTTTATGGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTc < 2:1039296/150‑1 (MQ=255) ttGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCa < 1:474249/150‑1 (MQ=255) gtcgGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCtt < 1:844304/150‑1 (MQ=255) gtcgGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATAAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCtt > 1:847873/1‑150 (MQ=255) gtcgGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGAACATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCtt < 1:80404/150‑1 (MQ=255) cgGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTc > 1:775384/1‑150 (MQ=255) ggATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCTTTACTTTGTCATTCTTTcaa > 2:1544212/1‑149 (MQ=255) attattCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCacaa < 1:1337978/150‑1 (MQ=255) tattCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCacaaca > 2:315984/1‑150 (MQ=255) ttCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACaaa > 1:1003494/1‑150 (MQ=255) gTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACa < 2:385766/150‑1 (MQ=255) gTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACa > 2:548794/1‑150 (MQ=255) tcatGGGGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCATAAGATTAATTAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTAACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAAGAgg < 2:51191/147‑1 (MQ=255) tGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAg < 2:467807/150‑1 (MQ=255) gAGTTTGTTCATGGGCCGCAAACGCCCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCag > 1:47723/1‑150 (MQ=255) gAGTTTGTTCATGGGACGAAAACGACCCAAGATTTCAGACCATTATGAAAATTTTATCCAACGCCAGTCCAGCGGACTGGCTGTTGCGGGTGTAGCGAATAATAACTTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCCCAACAAACACAGGACGGCag > 2:1232822/1‑150 (MQ=255) gTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCagag > 1:632293/1‑150 (MQ=255) tGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACACCAAAAACAGGAAGGCAGAGGTg > 2:918041/1‑150 (MQ=255) tGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTg < 1:1267071/150‑1 (MQ=255) ttCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTggg < 2:714360/150‑1 (MQ=255) cctgcgCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCCGCGGACGGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTCTCATTCAATCACAACAAAAACAGGAAGCCAGAGGTGGGGc < 2:294307/145‑1 (MQ=255) gggCTGTAAAAGACCCTATATTTGAGACCATTAAGAAAATTTTATGCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGATAAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGc < 1:336958/150‑1 (MQ=255) gggCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGc > 2:1664135/1‑150 (MQ=255) ggCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCg > 2:851126/1‑150 (MQ=255) ggCCGAAAACGACCCGAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCCGCGGTCTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACATCAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCg > 1:1146750/1‑150 (MQ=255) gCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACGTTGTCATGCGTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGa > 1:35710/1‑150 (MQ=255) ccGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGaa > 1:1784846/1‑150 (MQ=255) gAAAACGACCCTAGTTTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCTGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATa < 2:1630661/150‑1 (MQ=255) gAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATa < 1:1237283/150‑1 (MQ=255) aaaaCGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATAc < 2:604971/150‑1 (MQ=255) aaaCGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAACTTTTATCCAAAGCCAGGCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAATCAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCTAATAcc < 1:185518/150‑1 (MQ=255) aaaCGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCCGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATAcc < 1:766786/150‑1 (MQ=255) aaCGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCt < 1:20828/150‑1 (MQ=255) aCGAACCTAGATTTCTGACCTTTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTg < 2:912621/150‑1 (MQ=255) aCCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTaa > 1:1403261/1‑150 (MQ=255) tAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCt > 1:1084942/1‑150 (MQ=255) tttCAGAGCATTAAGAATTTTTTATCCAAAGCGTGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGGGAATATTTAATTGCGTTAATTTGTCATTCTTTCTCAACATAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGGAGCGAATTCCTGTAACGCTTGGt < 2:1306608/150‑1 (MQ=255) tttCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCGAGTCCAGCGGACTTGCTTTTGCGGTTTTATCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTATCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGTGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGt < 2:1306615/150‑1 (MQ=255) tttCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGt > 2:409544/1‑150 (MQ=255) tCAGAACTTTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCTGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTTCTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGATGGGAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGGAACGCTTGGTaa < 2:900542/150‑1 (MQ=255) cAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAat > 2:698617/1‑150 (MQ=255) aGACGATTAAGAAAATTTTATCCAAATCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAata < 1:276135/150‑1 (MQ=255) acATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTg < 2:817174/149‑1 (MQ=255) cATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCTGACTGGTTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACTACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTgc < 1:316326/150‑1 (MQ=255) cATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGATAGGTAATATTgc > 1:1133978/1‑150 (MQ=255) aTTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTgcg > 1:493487/1‑150 (MQ=255) tAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGcc > 2:504477/1‑150 (MQ=255) tAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGAGGTTTTAGAGATTAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGcc > 2:168656/1‑150 (MQ=255) aGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTACCGCTTGGTAATATTGCGCCGt > 2:1203923/1‑150 (MQ=255) aGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGt < 1:1773844/150‑1 (MQ=255) gAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGtt > 1:997101/1‑150 (MQ=255) aTTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGTCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCg < 2:1289459/150‑1 (MQ=255) ttttATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCCGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGc < 1:94840/150‑1 (MQ=255) cgcaaaaGCCAGTCCGCTGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAg > 1:1409346/5‑150 (MQ=255) cAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGcc > 2:1816527/1‑150 (MQ=255) aaaGCCAGTCCGCTGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCg > 2:1569123/1‑150 (MQ=255) aGCCAGTCCGCTGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGtt > 1:565646/1‑150 (MQ=255) gacAGTTCAGAGTACTGGCTTTTTCTGTTTTATCTAATAATAAATTTCTTTACTTTGTTATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACATGTATCGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGtta < 1:1198256/148‑2 (MQ=255) gCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTc > 2:1790964/1‑150 (MQ=255) gCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTc < 1:1203923/150‑1 (MQ=255) gcAGTCCTGCTGACTGGCTTTTGGGGTTTTAGCGAATAATAAATTTCGTTACTTTGTAATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTcc < 2:606131/149‑1 (MQ=255) ccAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCTCAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTcc > 2:705088/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTCCAGc < 2:1778544/150‑1 (MQ=255) tCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTCCAGcc > 1:426312/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTCCAGCCt > 1:1122767/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTCCAGCCt > 1:761247/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTCCAGCCt > 2:1561637/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGGGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGAGCCGTTGTCGCAAAGGCCGTTCCAGCCt > 2:1695107/1‑150 (MQ=255) cAGCGGACTGGCTTTTGCGGCTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCTTTCCAGCCTg < 1:1283143/150‑1 (MQ=255) cAGCGGACTGGCTTTTGAGGATTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTCCAGCCTg < 1:1702344/150‑1 (MQ=255) | GGTTTGGTGGTCTGGCCGGTACCGCTGCAGGCGCAGCTAAAATTGTCTTTGTCGTCGGGATTATTCTGTTCCTGGTGAGTTTGTTCATGGGCCGAAAACGACCCTAGATTTCAGACCATTAAGAAAATTTTATCCAAAGCCAGTCCAGCGGACTGGCTTTTGCGGTTTTAGCGAATAATAAATTGCGTTACTTTGTCATTCTTTCACAACAAAAACAGGAAGGCAGAGGTGGGGCAGCGAATACCTGTAACGCTTGGTAATATTGCGCCGTTGTCGCTAAGGCCGTTCCAGCCTGG > NC_000913/4612183‑4612478 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |