| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 613,551 | 0 | C | A | 6.3% | 315.9 / 8.9 | 111 | A272D (GCC→GAC) ‡ | fes | enterobactin/ferrienterobactin esterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (56/47); new base A (3/4); total (59/52) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 116 total aligned reads displayed.
GCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTAC > NC_000913/613402‑613700 | gCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCTACGATATCGACACAACAAAAAACAAAAAAGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGc > 2:44989/1‑150 (MQ=255)gCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGCCACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGc > 1:1632979/1‑150 (MQ=255)gCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGc > 1:1012157/1‑150 (MQ=255) 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ccTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACtggtg < 1:1307543/150‑1 (MQ=255) cTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACtggtgg > 2:1492271/1‑150 (MQ=255) ttgTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTGGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGc < 1:1117126/148‑1 (MQ=255) gggTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGc < 1:636799/149‑1 (MQ=255) gTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCg > 2:47525/1‑150 (MQ=255) 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cccTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCCCCGTGGATGCCGGGCAGTGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTTTCTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTCGTGGCCTCATCGgtgcgggcc > 2:1577911/1‑149 (MQ=255) cccTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGgca < 1:542747/150‑1 (MQ=255) cTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGgcagc > 2:850364/1‑150 (MQ=255) cggtgCGATCGGCACGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCaa > 1:1822609/5‑150 (MQ=255) ggtgCGATCGGCACGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAag > 1:357239/4‑150 (MQ=255) ggtgCGATCGACACGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAag > 1:749804/4‑150 (MQ=255) tAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAaga > 1:809253/1‑150 (MQ=255) gCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAgg > 2:379926/1‑150 (MQ=255) cGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGGTGTGGGGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGGGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAggg < 1:724850/150‑1 (MQ=255) cGATCGTGCCGAGCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCGTTCCGCGCGGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAggg < 2:1142238/150‑1 (MQ=255) gTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCgtgt < 2:1439802/150‑1 (MQ=255) ccGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGGCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTAc > 1:346051/1‑150 (MQ=255) | GCAACTTCCTCCCGCCGTGTATGTGTTGATCGACGCTATCGACACCACGCACCGCGCCCACGAACTGCCGTGTAATGCGGATTTCTGGCTCGCAGTACAGCAAGAGTTATTACCCCTGGTGAAAGCTATTGCCCCTTTTAGCGATCGTGCCGATCGCACCGTGGTTGCCGGGCAGAGTTTTGGTGGGCTTTCCGCGCTGTATGCCGGACTGCACTGGCCTGAACGCTTTGGCTGTGTATTAAGCCAGTCAGGATCGTACTGGTGGCCGCATCGGGGCGGGCAGCAAGAGGGCGTGTTAC > NC_000913/613402‑613700 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |