New junction evidence
  seq id position reads (cov) reads (cov) score skew freq annotation gene product
* ? NC_000913 2066551 =14 (0.220)7 (0.110) 6/284 6.3 34.4% noncoding (803/1195 nt) IS5 repeat region
?NC_000913 2102204 = NA (NA)noncoding (740/1195 nt) IS5 repeat region
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff.

CCTTGTATCTGGCTTTCACGAAGCCGAACTGTCGCTTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCC  >  NC_000913/2066403‑2066612
                                                                                                                                                    |                                                             
ccTTGTATCTGGCTTTCACGAAGCCGAACTGTCGCTTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCgg                                                              <  2:874237/150‑1 (MQ=32)
       tCTGGCTTTCAGGACTCCGATCGGGCGCTGGATCATGCGCAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCTGATGCTGGATTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTTCCGGGGCGCTc                                                       <  2:418659/150‑1 (MQ=11)
       tCTGGCTTTCACGAAGCCGAACTGTCGCTTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTc                                                       >  2:34166/1‑150 (MQ=32)
          ggCTTTCACGAAGCCTAACTGTCGCTTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGc                                                    <  1:525456/150‑1 (MQ=17)
            cTTTCACGAAGCCGAACTGTCTCTTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGa                                                  <  1:904069/150‑1 (MQ=17)
               tCACGAAGCCGAACTGTCGCGTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCa                                               <  1:914221/150‑1 (MQ=17)
                             tggcGCTTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTATCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATcc                                 <  1:815463/147‑1 (MQ=17)
                              gTCGCTTGATGATGCGAACTGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCCTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTATGTTCTTGCGAGGATGCTGTTTCAAGGATCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCa                                <  1:141825/150‑1 (MQ=11)
                              gTCGCTTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCa                                <  1:774365/150‑1 (MQ=32)
                                        gatgCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAg                      >  2:62391/1‑150 (MQ=32)
                                          tgCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGct                    >  1:705448/1‑150 (MQ=32)
                                              aaaTGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGctcctc                <  2:444542/150‑1 (MQ=32)
                                                          cACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGGTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGgcgc    <  1:351880/150‑1 (MQ=17)
                                                            ccTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGccc  >  1:332949/1‑150 (MQ=32)
                                                                                                                                                    |                                                             
CCTTGTATCTGGCTTTCACGAAGCCGAACTGTCGCTTGATGATGCGAAATGGGTGCTCCACCTTGGCCCGGATGCTGGCTTTCATGTATTCGATGTTGATGGCCGTTTTGTTCTTGCGTGGATGCTGTTTCAAGGTTCTTACCTTGCCGGGGCGCTCGGCGATCAGCCAGTCCACATCCACCTCGGCCAGCTCCTCGCGCTGTGGCGCCC  >  NC_000913/2066403‑2066612

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: 
Reads not counted as support for junction
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint.
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication.