New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 2817942 | 47 (0.730) | 6 (0.110) | 5/258 | 6.3 | 12.3% | intergenic (‑82/+117) | argQ/argZ | tRNA‑Arg/tRNA‑Arg |
? | NC_000913 | 2818492 = | 45 (0.800) | noncoding (58/77 nt) | argV | tRNA‑Arg | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
GAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAC > NC_000913/2817796‑2818089 | taggaTTAGATCCTCCTACCGATAGGTTCGTATCATATTACTCTATCCATCTTCGCTTCTGATGCATTGTGATTAGTTATTTTACTGATT‑ATATTGCTAACGCTAATATCTCCATTTTAATTATTATATGGTGCATCCGGGAGGATTACt < 2:639709/149‑1 (MQ=2) aTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGcc > 1:294469/1‑150 (MQ=255) aTTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAAATAATTAT‑CCGCAGAATATTTAAACCCCAACAAAAGCCATTAAAATTAAGAAATGGTTCAAACCGGAGGATTAcaaccc > 2:491951/1‑145 (MQ=2) cGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAACGCCATATCAATTAACAGATGGGGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTg < 1:908840/150‑1 (MQ=255) ccTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGc > 2:31186/1‑150 (MQ=255) gACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCTcc > 2:634292/1‑150 (MQ=255) ccGCTCGGTTCGTATCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCTGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCt < 2:396567/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTT‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAATAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCt < 2:856915/150‑1 (MQ=255) ccGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAATAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCt < 2:251836/150‑1 (MQ=255) cGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCTTCGGGAAAACTTATTCAACTGCTG‑ATATTGATTCCGCTACTATCGCCATATCAATTATGATATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCtt < 1:200576/150‑1 (MQ=17) cTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCg < 2:379727/150‑1 (MQ=255) ggTTCGTAGCCGAGTACTCTCTCCAGCTTAGCTACGGATGCAGCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGCTACCGCTCCTACCGCCATCTCACTTACGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGc < 1:139067/150‑1 (MQ=17) gTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGAAGCATCGTGAAAACTTATTCTCCTGCTG‑ATCTTGCTACCGCTACTACCGCCATCTCAATTACCAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTg < 1:618894/150‑1 (MQ=17) atccGAGTTCTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCAGCGGGAAAACTTATTCTACTGATG‑ATATTGATACCGCTACTATAGCCATTTCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCt < 2:969575/148‑1 (MQ=17) gCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTa > 1:546225/1‑150 (MQ=255) ctctATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTCCTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACg < 1:792939/150‑1 (MQ=255) atctATCCAGCTGAGCTACGTATGCATCGTTAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGATACTACAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGTATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACg < 1:831483/149‑1 (MQ=17) tctATCAACCTGAGATACTGATGCATCGGGAAAAGTTATTCATCTTCTG‑ATATTGATTCCGCTACTAAAGCCATATTAATTATGATATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGt < 1:504870/150‑1 (MQ=17) ccAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTT‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTatca < 1:249915/150‑1 (MQ=255) aGCTCAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTatcatc < 1:249921/150‑1 (MQ=255) cTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTg < 2:356544/150‑1 (MQ=255) cATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGtt > 1:798445/1‑150 (MQ=255) cATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGtt > 2:462321/1‑150 (MQ=255) aTCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTa < 1:31186/150‑1 (MQ=255) ggAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTc < 1:829504/150‑1 (MQ=255) gAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTcc < 2:546225/150‑1 (MQ=255) aaacCTAATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTATATCAATATCAATTAAGATATTGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTTCTATAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCg < 2:1015172/150‑1 (MQ=17) aaaaCTTATTCTACTTATT‑AACTTGATACATATATTACAGCCATATCTTTTCCTAGATGGTGCATCCGGGAGGAGCAGTCGCCTTGAGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCg < 2:586131/150‑1 (MQ=14) aaaCTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGc > 2:699799/1‑150 (MQ=255) ttATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTAcc < 2:294469/150‑1 (MQ=255) tCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGAAAAGTTATCATCCCTAGAGCCTGCGGTTAATTCAGCTACATCtt > 1:172789/1‑150 (MQ=17) tgctg‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATa < 1:699799/150‑1 (MQ=255) gctg‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATAc > 1:476228/1‑150 (MQ=255) cctg‑CTATTGATACCCCTACTTCAGGCATATCACGTATCAGATGGTGCATCCGGGAGTATTAATAGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCAGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGATGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATAc < 2:157713/149‑1 (MQ=14) gattaaatTGAGACCGATTCTAAAGCCATATTATTTATTAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCGTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATAc < 1:831333/144‑1 (MQ=17) gATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTAGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCAAAAGCAACGATATCCTCCCTAGTGCCTGCGGATAATTCCGCTACCTCTTCGATACAATCATTGc > 1:224677/1‑150 (MQ=14) tACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTg > 1:472949/1‑150 (MQ=255) actaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGAttt > 1:724949/1‑150 (MQ=255) actaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACATCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGAttt > 2:918940/1‑150 (MQ=255) actaAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCACGCCATTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGATATCATCCCTAGTGCCAGCGGTTAATTACGATACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGAttt > 1:198851/1‑150 (MQ=17) ataATGCGATTTCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCATCGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTc < 1:7365/149‑1 (MQ=255) taAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCg > 2:1030841/1‑150 (MQ=255) aGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCTCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGgag > 2:475804/1‑150 (MQ=255) aaTTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTg > 1:20707/1‑150 (MQ=255) cATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTc > 2:240929/1‑150 (MQ=255) cATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCC‑GGAGGATTCg > 1:87708/1‑150 (MQ=255) aTTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAc > 2:982736/1‑150 (MQ=255) | GAGGATTCGAACCTCCGACCGCTCGGTTCGTAGCCGAGTACTCTATCCAGCTGAGCTACGGATGCATCGGGAAAACTTATTCTACTGCTG‑ATATTGATACCGCTACTAAAGCCATATCAATTAAGAGATGGTGCATCCGGGAGGATTACTCGCCTTGCGGCTCGCCCTTCGGGCCGTTGCTAAAGCAACGTTATCATCCCTAGTGCCTGCGGTTAATTCCGCTACCTCTTCGATACCTTCATTGCTGAAGATTTCGGAGAATATGGTGCATCCGGGAGGATTCGAACCTCCGAC > NC_000913/2817796‑2818089 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |