Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 950,314 | A→T | 5.7% | intergenic (+56/+26) | ycaK → / ← pflA | putative NAD(P)H‑dependent oxidoreductase/pyruvate formate‑lyase 1‑activating enzyme; [formate‑C‑acetyltransferase 1]‑activating enzyme; PFL activase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 950,314 | 0 | A | T | 5.7% | 816.5 / 27.0 | 230 | intergenic (+56/+26) | ycaK/pflA | putative NAD(P)H‑dependent oxidoreductase/pyruvate formate‑lyase 1‑activating enzyme; [formate‑C‑acetyltransferase 1]‑activating enzyme; PFL activase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (121/96); new base T (4/9); total (125/105) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.18e-02 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.22e-01 |
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCATTTGTGTTTG > NC_000913/950165‑950463 | gtgtAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCa > 2:682805/1‑150 (MQ=255) tgtAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCaa > 1:3541582/1‑150 (MQ=255) ttactACTGTGTTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTTTTATCAGTCGTTATTATCTCTGGTACGGGATTTGTTAGATGCACTATATGTTGTTTAAAAAACGCTTTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAAt < 1:4004521/146‑1 (MQ=255) tAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATa > 1:102654/1‑150 (MQ=255) ctgTGGTATTGGTTGGGTAAGAACTTCACGCTAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGTATATGGTAGATGCACTATAAGTTGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGtt < 1:2613056/148‑1 (MQ=255) ctgTGGTATTCGTTGGGTAATAACTTCACGCGAGATATTATCAGTCTTTATTATCTCTGGTACGGTATTTGTTAGTTGAACTATATGTTGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGTAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGtt < 1:4011122/148‑1 (MQ=255) tGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATATAACGTAATGGATATGGTATATGAACTATAAGATGTTTTAAAAACCCAGTATCAGAATGAAAACCCGAAAAAAAAAGAGGCAACACACTAAAgattcc > 1:3914397/1‑145 (MQ=255) ggTATTGGTGGGGGAAGAACTTCACGCGCGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCCGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATTTGTTAAAAACGCTTTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCg < 1:3687593/150‑1 (MQ=255) ggTATTCGATGGGGAAGAACTTCTCGCTAGCTTTTATCAGTCGTTTTTATCTCTGGTACGGTTTTTGGTAGATGCACTATATTATGTGTTAAAAACGCTTTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTTTATTGAGTTGCCg < 1:2672859/150‑1 (MQ=255) gTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTTTATTGAGTTGCCGc < 2:3256681/150‑1 (MQ=255) gTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTTTATTGAGTTGCCGc < 2:627385/150‑1 (MQ=255) tATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATTTGTTAAAAAAGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTTCCGCt > 1:748661/1‑150 (MQ=255) tATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCt > 2:2724274/1‑150 (MQ=255) ttCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGTTGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAATTGCGGCAACTCAATAAAGTTTCCGCttt > 1:674507/1‑150 (MQ=255) ttCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTTTATTGAGTTGCCGCttt < 2:2219988/150‑1 (MQ=255) cGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTAc > 1:2375778/1‑150 (MQ=255) cGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTAc > 2:888132/1‑150 (MQ=255) cGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCGGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAATCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTAc > 1:1440785/1‑150 (MQ=255) gaaCTTCACGCGAGCTATTATCAGTCTTTATTATCTCAGGTACGGTATTTGGTAGATGCAATATATGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTa < 1:1717146/150‑1 (MQ=255) gaaCTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTa < 1:3831160/150‑1 (MQ=255) gaaCTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGCGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCAGTAGCAGAATGAAGAGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTa > 2:77065/1‑150 (MQ=255) aCTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGa < 2:4158861/150‑1 (MQ=255) aCTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGa > 2:3869448/1‑150 (MQ=255) cTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGaa < 2:2297361/150‑1 (MQ=255) ttCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAAc > 2:3955385/1‑150 (MQ=255) ttCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAAc > 2:4230016/1‑150 (MQ=255) ttCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGAACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAAc > 1:3456230/1‑150 (MQ=255) ttCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTAAGGTACCGGATATGGTAGATGCACGATAAGATTTTTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACACAAAAAAGTTTCCGCATTACGGGGAAAATAGAAc > 1:1038944/1‑150 (MQ=255) ttCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATATCAGGTACGGGATATTGTAGATGCACAATAAGATGTTTTTAAAAAGCTGTAGCAGAATTAAGCGCGGAATAAAAAATCGGCAACTCAAAAAAGTTTCCGCTTTAAGGGGAAATTAGaaa > 1:374842/1‑149 (MQ=255) tcgcgAGCTATTATAAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGTATATGGTAGATTCACTATAAGATTTGTTAAAAACGATGTAGCAGAATGAAGCGCGGATTAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACAtt < 1:2239773/149‑1 (MQ=255) aCGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGGTATGGTAGGTGCACAATAATATGTGTTAAAAAAGCTGTAGCAGAAAGAAGCGCGGAATAAAAAATCGGCAACACAATAAAGTTGCCGCTTTAAGGGGAAAATATaaaaat > 1:841934/1‑146 (MQ=255) aCGCGAGCTATTATCAGTCGTGATTATCTCAGGGACGGGATATGGGAGATGCACAATAAGATTTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCCACACAATAAACTTTCCGCTTTAAGGGGAACTTAGAACaat > 1:1253654/1‑148 (MQ=255) cgAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTTGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTAcc < 1:1429282/150‑1 (MQ=255) tattatCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATTGTAGATGCACTATAAGAAGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTAACGGGGAAATTAGAACAATACCTTATg > 2:3250462/1‑150 (MQ=255) attatCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGa < 1:1932471/150‑1 (MQ=255) tCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGt > 2:92639/1‑150 (MQ=255) tCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTg < 2:3496862/150‑1 (MQ=255) ttattaTCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTc < 1:2333402/150‑1 (MQ=255) ttattaTCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTc > 1:3054610/1‑150 (MQ=255) ttattaTCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTc > 1:552947/1‑150 (MQ=255) tattatCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAACCGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCa < 1:2706784/150‑1 (MQ=255) attatCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCaa > 2:3982869/1‑150 (MQ=255) ttatCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAg < 1:3208139/150‑1 (MQ=255) ctcAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATg < 1:187704/150‑1 (MQ=255) tcAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGc > 2:3016387/1‑150 (MQ=255) tcAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGc > 2:4009635/1‑150 (MQ=255) tcAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGc > 1:212195/1‑150 (MQ=255) tcAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGc > 1:2872010/1‑150 (MQ=255) tcAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGc < 1:706698/150‑1 (MQ=255) aGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCt < 2:3541582/150‑1 (MQ=255) aGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCt > 2:3418528/1‑150 (MQ=255) tACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAATCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTc > 1:2313247/1‑150 (MQ=255) aCGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCa > 2:2182540/1‑150 (MQ=255) ggTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCa < 1:3311143/150‑1 (MQ=255) ggTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCa < 1:2845101/150‑1 (MQ=255) gTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCAt > 1:2227493/1‑150 (MQ=255) gCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGtctc > 1:3590863/1‑150 (MQ=255) cACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGAAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTctct < 2:726883/150‑1 (MQ=255) cACTATAAGATGTGATAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCATTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTctct < 1:130481/150‑1 (MQ=255) aGATGTGTTAAAAACGCTTTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCg < 2:3914397/150‑1 (MQ=255) aGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCACCTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCg > 2:1519044/1‑150 (MQ=255) aGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCg > 2:532687/1‑150 (MQ=255) gATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCgg > 2:298840/1‑150 (MQ=255) aTGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCggt < 2:3773648/150‑1 (MQ=255) aTGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCggt < 1:2470134/150‑1 (MQ=255) aTGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCggt > 1:975428/1‑150 (MQ=255) gtTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACAGTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGtt < 1:4167430/150‑1 (MQ=255) ttAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGttt > 2:1181073/1‑150 (MQ=255) ttAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGttt > 1:917384/1‑150 (MQ=255) ttAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGttt > 2:2344974/1‑150 (MQ=255) ttAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTACTTCGGTGGttt > 2:3308964/1‑150 (MQ=255) tAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTa < 2:248834/150‑1 (MQ=255) aaaaaCGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTaa < 1:2532430/150‑1 (MQ=255) gCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAACTTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGtt > 2:1331277/1‑150 (MQ=255) gCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGtt > 1:3008424/1‑150 (MQ=255) gCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGtt < 2:2827607/150‑1 (MQ=255) cAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGttt > 2:2025719/1‑150 (MQ=255) gAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAATTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGt < 2:952872/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATACAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCtt < 2:464832/150‑1 (MQ=255) aGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCtt < 2:3501172/150‑1 (MQ=255) gcgcGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTc < 1:3869448/150‑1 (MQ=255) cgcgGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCa < 2:3194310/150‑1 (MQ=255) aTAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCAtt < 1:1198158/150‑1 (MQ=255) ccgtaaaGCGGCAACTTTATTGAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTg > 2:363819/5‑150 (MQ=255) ccgtaaaGCGGCAACTTTATTGAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTg > 2:12451/5‑150 (MQ=255) aaaaaaGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACAGTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGc < 2:2768644/150‑1 (MQ=255) aaGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCAcc < 1:1569833/150‑1 (MQ=255) aGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCAccc > 2:3608294/1‑150 (MQ=255) aGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCAccc > 2:3202296/1‑150 (MQ=255) gCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTGTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGACACCCa > 2:3135267/1‑150 (MQ=255) gCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCAttt > 1:117045/1‑150 (MQ=255) gCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCAGTGCCACCCAttt < 2:2130649/150‑1 (MQ=255) aaCTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCATgtgt > 2:1535511/1‑150 (MQ=255) aaCTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCATTtgt > 2:1653355/1‑150 (MQ=255) aaCTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCATTtgt > 2:1964996/1‑150 (MQ=255) cTCAATAAAGTTGCCGCTTGACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCATTTgtgt < 1:4043700/150‑1 (MQ=255) tCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCATTTGTGtt > 2:3420747/1‑150 (MQ=255) tCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCATTTGTGtt < 1:1217146/150‑1 (MQ=255) cAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCATTTGTGttt < 2:2242450/150‑1 (MQ=255) aaTAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCATTTGTGTTTg > 1:166049/1‑150 (MQ=255) | GTGTAATACAGTGGTATTCGATGGGGAAGAACTTCACGCGAGCTATTATCAGTCGTTATTATCTCAGGTACGGGATATGGTAGATGCACTATAAGATGTGTTAAAAACGCTGTAGCAGAATGAAGCGCGGAATAAAAAAGCGGCAACTCAATAAAGTTGCCGCTTTACGGGGAAATTAGAACATTACCTTATGACCGTACTGCTCAAGAATGCCTTTCACGCGTTCCATGGTCTCTTTCTTCGGTGGTTTAACACCGTCGAGTTTGTACTCTTCACCCATTGCCACCCATTTGTGTTTG > NC_000913/950165‑950463 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |