| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_000913 | 3,658,002 | 0 | C | T | 5.7% | 904.8 / 28.5 | 264 | noncoding (53/69 nt) | arrS | antisense sRNA ArrS, function unknown |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (117/131); new base T (9/6); total (126/138) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.28e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.62e-01 | |||||||||||
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
TTAAATAAGTAATCCGGGTTCATTTTTTTGCAACTGGCGTTGATTACATTGCATAAATATCCGTGTCTCCAGACGCTATATAAAAACCTGAAGACATGAATGCGTTATTTACTCAGGTAATTTCAATGCGTTAAAAGAAAGCTGGCAATCCAATTGCCAGCTTAAGTCGAAACAAGGAGACTCGATATTTAAATCGGATTACATTTTAACTTTAGTAATATTCTTCAGAGATCACAAACTGGTTATTGATAACTTATTCTTGGGCAGTAATCCGCAAACGTTAACTTTTTGTTTGCT > NC_000913/3657853‑3658149 | ttAAATAAGTAATCCGGGTTCATTTTTTTGCAACTGGCGTTGATTACATTGCATAAATATCCGTGTCTCCAGACGCTATATAAAAACCTGAAGACATGAATGCGTTATTTACTCAGGTAATTTCAATGCGTTAAAAGAAAGCTGGCAATc > 2:233776/1‑150 (MQ=255)ttAAATAAGTAATCCGGGTTCATTTTTTTGCAACTGGCGTTGATTACATTGCATAAATATCCGCGTCTCCAGACGCTATATAAAAACCTGAAGACATGAATGCGTTATTTACTCAGGTAATTTCAATGCGTTAAAAGAAAGCTGGCAATc > 2:1735468/1‑150 (MQ=255) aTAAGTAATCCGGGTTCATTTTTTTGCAACTGGCGTTGATTACATTGCATAAATATCCGTGTCTCCAGACGCTATATAAAAACCTGAAGACATGAATGCGTTATTTACTCAGGTAATTTCAATGCGTTAAAAGAAAGCTGGCAATCCAAt > 1:1703693/1‑150 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |